PROTEOME MASS-SPECTROMETRIC ANALYSIS AND TYPING OF VIBRIO CHOLERAE STRAINS ISOLATED IN THE TERRITORY OF RUSSIAN FEDERATION IN 2010 - 2012


Cite item

Full Text

Abstract

Aim. Conduction of a comparative proteomic mass-spectrometric (MS) analysis using a personal database of V. cholerae protein mass-spectra and genetic VNTR-typing of cholera causative agent strains. Materials and methods. V. eholerae О1 El Tor strains - 7, V. eholerae non O1/non O139 - 2. Protein profiling and VNTR-genotyping of strains was carried out on MALDI TOF-MS Autoflex (Bruker Daltonics) mass-spectrometer and SIS Cholera-strains-VNTR. Results. The established community of a proteomic profile of epidemic cholera vibrio strains isolated in 2010 - 2012 in Moscow allowed to determine Indian origin of a toxigenic strain isolated in Taganrog in 2011. M/z proteins distinguishing V. cholerae О1 and non O1/non O139 strains were identified. Proteomic analysis confirms the results ofVNTR-genotyping. Conclusion. Study and typing of V. cholerae members with determination of their origin and phylogenetic relationship is possible using a collection of V. cholerae mass-spectra.

About the authors

N. R Telesmanich

Rostov Research Institute of Plague Control, Rostov-on-Don, Russia

V. V Agafonova

Rostov Research Institute of Plague Control, Rostov-on-Don, Russia

O. S Chemisova

Rostov Research Institute of Plague Control, Rostov-on-Don, Russia

I. A Chaika

Rostov Research Institute of Plague Control, Rostov-on-Don, Russia

S. O Vodopianov

Rostov Research Institute of Plague Control, Rostov-on-Don, Russia

A. S Vodopianov

Rostov Research Institute of Plague Control, Rostov-on-Don, Russia

E. V Goncharenko

Rostov Research Institute of Plague Control, Rostov-on-Don, Russia

V. O Telicheva

Rostov Research Institute of Plague Control, Rostov-on-Don, Russia

References

  1. Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю. М. и др. Вариабельные тандемные повторы (VNTR-анализ) у Vibrio choleraе О139, выделенных от людей и из воды поверхностных водоемов России. Журн. микробиол. 2003, (6): 11-15.
  2. Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю М. и др. Ретроспективный VNTR-анализ генотипов штаммов Vibrio choleraе О1, выделенных на территории Ростовской области в годы VII пандемии холеры. Мол. генет., микробиол., вирусол. 2004, (2): 28-33.
  3. Онищенко Г. Г., Ломов Ю. М., Мишанькин Б. Н. и др. Характеристика холерных вибрионов эльтор, выделенных в г. Казань в 2001 г. Журн. микробиол. 2002, 2 : 3-6.
  4. Онищенко Г.Г., Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С. и др. Холерные вибрионы серогруппы не О1, выделенные в Узбекистане в 1987- 1990 г.: ретроспективный анализ. Эпидемиол. инфекц. бол. 2003, 6: 25-29.
  5. Свидетельство о государственной регистрации базы данных «Белковые профили масс-спектров представителей вида Vibrio cholerae для программы MALDI Biotyper» № 2013620585. РФ. Чайка И.А., Телесманич Н.Р., Сеина С.О., 20.06.2013.
  6. Dieckmann R., Strauch E., Alter T. Rapid identification and characterization ofVibrio species using whole-cell MALDI-TOF mass spectrometry. J. Appl. Microbiol. 2010, 109 (1): 199-211.
  7. Hazen T.H., Martinez R.J., Chen Y et al. Rapid identification ofVibrio parahaemolyticus by wholecell matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J. Appl. Environ. Microbiol. 2009, 75 (21): 6745-6756.
  8. Welker M., Moore E.R. Applications of whole-cell matrix-assisted laserdesorption/ionization time-of-flight mass spectrometry in systematic microbiology. Syst. Appl. Microbiol. 2011, 34: 2-11.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2014 Telesmanich N.R., Agafonova V.V., Chemisova O.S., Chaika I.A., Vodopianov S.O., Vodopianov A.S., Goncharenko E.V., Telicheva V.O.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies