ПРОТЕОМНЫЙ МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ И ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2010 - 2012 ГГ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Проведение сравнительного протеомного масс-спектрометрического (MS) анализа на основе использования персональной базы данных белковых масс-спектров V. cholerae и генетического VNTR-типирования штаммов возбудителя холеры. Материалы и методы. Штаммы V. cholerae О1 El Tor - 7; VV. cholerae не О1/не О139 - 2. Белковое профилирование и VNTR-генотипирование штаммов проводили соответственно на масс-спектрометре MALDI TOF-MS Autoflex «Bruker Daltonics» и ГИС «Холера-штаммы-VNTR». Результаты. Установленная общность протеомного профиля эпидемических штаммов холерных вибрионов, выделенных в 2010 - 2012 гг. в г. Москва, позволила определить «индийское» происхождение токсигенного штамма, изолированного в г. Таганрог в 2011 г. Идентифицированы m/z белков, отличающие штаммы V. cholerae О1 от не О1/не О139. Протеомный анализ подтверждают результаты VNTR-генотипирования. Заключение. Используя коллекцию масс-спектров V. cholerae , возможно проводить изучение и типирование представителей V cholerae с определением их происхождения и филогенетического родства.

Об авторах

Н. Р Телесманич

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

В. В Агафонова

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

О. С Чемисова

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

И. А Чайка

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

С. О Водопьянов

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

А. С Водопьянов

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

Е. В Гончаренко

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

В. О Теличева

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

Список литературы

  1. Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю. М. и др. Вариабельные тандемные повторы (VNTR-анализ) у Vibrio choleraе О139, выделенных от людей и из воды поверхностных водоемов России. Журн. микробиол. 2003, (6): 11-15.
  2. Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю М. и др. Ретроспективный VNTR-анализ генотипов штаммов Vibrio choleraе О1, выделенных на территории Ростовской области в годы VII пандемии холеры. Мол. генет., микробиол., вирусол. 2004, (2): 28-33.
  3. Онищенко Г. Г., Ломов Ю. М., Мишанькин Б. Н. и др. Характеристика холерных вибрионов эльтор, выделенных в г. Казань в 2001 г. Журн. микробиол. 2002, 2 : 3-6.
  4. Онищенко Г.Г., Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С. и др. Холерные вибрионы серогруппы не О1, выделенные в Узбекистане в 1987- 1990 г.: ретроспективный анализ. Эпидемиол. инфекц. бол. 2003, 6: 25-29.
  5. Свидетельство о государственной регистрации базы данных «Белковые профили масс-спектров представителей вида Vibrio cholerae для программы MALDI Biotyper» № 2013620585. РФ. Чайка И.А., Телесманич Н.Р., Сеина С.О., 20.06.2013.
  6. Dieckmann R., Strauch E., Alter T. Rapid identification and characterization ofVibrio species using whole-cell MALDI-TOF mass spectrometry. J. Appl. Microbiol. 2010, 109 (1): 199-211.
  7. Hazen T.H., Martinez R.J., Chen Y et al. Rapid identification ofVibrio parahaemolyticus by wholecell matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J. Appl. Environ. Microbiol. 2009, 75 (21): 6745-6756.
  8. Welker M., Moore E.R. Applications of whole-cell matrix-assisted laserdesorption/ionization time-of-flight mass spectrometry in systematic microbiology. Syst. Appl. Microbiol. 2011, 34: 2-11.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Телесманич Н.Р., Агафонова В.В., Чемисова О.С., Чайка И.А., Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Гончаренко Е.В., Теличева В.О., 2014

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах