Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology13961ArticlesСтатьиShort CommunicationPROTEOME MASS-SPECTROMETRIC ANALYSIS AND TYPING OF VIBRIO CHOLERAE STRAINS ISOLATED IN THE TERRITORY OF RUSSIAN FEDERATION IN 2010 - 2012ПРОТЕОМНЫЙ МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ И ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2010 - 2012 ГГTelesmanichN. RТелесманичН. РAgafonovaV. VАгафоноваВ. ВChemisovaO. SЧемисоваО. СChaikaI. AЧайкаИ. АVodopianovS. OВодопьяновС. ОVodopianovA. SВодопьяновА. СGoncharenkoE. VГончаренкоЕ. ВTelichevaV. OТеличеваВ. ОRostov Research Institute of Plague Control, Rostov-on-Don, RussiaРостовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону15042014912NO2 (2014)№2 (2014)9710109062023Copyright ©; 2014, Telesmanich N.R., Agafonova V.V., Chemisova O.S., Chaika I.A., Vodopianov S.O., Vodopianov A.S., Goncharenko E.V., Telicheva V.O.Copyright ©; 2014, Телесманич Н.Р., Агафонова В.В., Чемисова О.С., Чайка И.А., Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Гончаренко Е.В., Теличева В.О.2014Telesmanich N.R., Agafonova V.V., Chemisova O.S., Chaika I.A., Vodopianov S.O., Vodopianov A.S., Goncharenko E.V., Telicheva V.O.Телесманич Н.Р., Агафонова В.В., Чемисова О.С., Чайка И.А., Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Гончаренко Е.В., Теличева В.О.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13961

Aim. Conduction of a comparative proteomic mass-spectrometric (MS) analysis using a personal database of V. cholerae protein mass-spectra and genetic VNTR-typing of cholera causative agent strains. Materials and methods. V. eholerae О1 El Tor strains - 7, V. eholerae non O1/non O139 - 2. Protein profiling and VNTR-genotyping of strains was carried out on MALDI TOF-MS Autoflex (Bruker Daltonics) mass-spectrometer and SIS Cholera-strains-VNTR. Results. The established community of a proteomic profile of epidemic cholera vibrio strains isolated in 2010 - 2012 in Moscow allowed to determine Indian origin of a toxigenic strain isolated in Taganrog in 2011. M/z proteins distinguishing V. cholerae О1 and non O1/non O139 strains were identified. Proteomic analysis confirms the results ofVNTR-genotyping. Conclusion. Study and typing of V. cholerae members with determination of their origin and phylogenetic relationship is possible using a collection of V. cholerae mass-spectra.

Цель. Проведение сравнительного протеомного масс-спектрометрического (MS) анализа на основе использования персональной базы данных белковых масс-спектров V. cholerae и генетического VNTR-типирования штаммов возбудителя холеры. Материалы и методы. Штаммы V. cholerae О1 El Tor - 7; VV. cholerae не О1/не О139 - 2. Белковое профилирование и VNTR-генотипирование штаммов проводили соответственно на масс-спектрометре MALDI TOF-MS Autoflex «Bruker Daltonics» и ГИС «Холера-штаммы-VNTR». Результаты. Установленная общность протеомного профиля эпидемических штаммов холерных вибрионов, выделенных в 2010 - 2012 гг. в г. Москва, позволила определить «индийское» происхождение токсигенного штамма, изолированного в г. Таганрог в 2011 г. Идентифицированы m/z белков, отличающие штаммы V. cholerae О1 от не О1/не О139. Протеомный анализ подтверждают результаты VNTR-генотипирования. Заключение. Используя коллекцию масс-спектров V. cholerae , возможно проводить изучение и типирование представителей V cholerae с определением их происхождения и филогенетического родства.

mass-spectrometric analysisprotein profile databaseМишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю. М. и др. Вариабельные тандемные повторы (VNTR-анализ) у Vibrio choleraе О139, выделенных от людей и из воды поверхностных водоемов России. Журн. микробиол. 2003, (6): 11-15.Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю М. и др. Ретроспективный VNTR-анализ генотипов штаммов Vibrio choleraе О1, выделенных на территории Ростовской области в годы VII пандемии холеры. Мол. генет., микробиол., вирусол. 2004, (2): 28-33.Онищенко Г. Г., Ломов Ю. М., Мишанькин Б. Н. и др. Характеристика холерных вибрионов эльтор, выделенных в г. Казань в 2001 г. Журн. микробиол. 2002, 2 : 3-6.Онищенко Г.Г., Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С. и др. Холерные вибрионы серогруппы не О1, выделенные в Узбекистане в 1987- 1990 г.: ретроспективный анализ. Эпидемиол. инфекц. бол. 2003, 6: 25-29.Свидетельство о государственной регистрации базы данных «Белковые профили масс-спектров представителей вида Vibrio cholerae для программы MALDI Biotyper» № 2013620585. РФ. Чайка И.А., Телесманич Н.Р., Сеина С.О., 20.06.2013.Dieckmann R., Strauch E., Alter T. Rapid identification and characterization ofVibrio species using whole-cell MALDI-TOF mass spectrometry. J. Appl. Microbiol. 2010, 109 (1): 199-211.Hazen T.H., Martinez R.J., Chen Y et al. Rapid identification ofVibrio parahaemolyticus by wholecell matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J. Appl. Environ. Microbiol. 2009, 75 (21): 6745-6756.Welker M., Moore E.R. Applications of whole-cell matrix-assisted laserdesorption/ionization time-of-flight mass spectrometry in systematic microbiology. Syst. Appl. Microbiol. 2011, 34: 2-11.