VNTR-GENOTYPING OF VIBRIO CHOLERAE STRAINS ISOLATED FROM OBJECTS IN THE TERRITORY OF RUSSIAN FEDERATION IN 2012


Cite item

Full Text

Abstract

Aim. VNTR-typing of Vibrio cholerae strains isolated in the territory of Russian Federation in 2012. Materials and methods. 71 Vibrio cholerae O3 and 3 V. cholerae O1/O139 strains were used in the study. Genotyping was performed by using PCR for 5 VNTR-loci. Results. Multilocus VNTR-typing allowed to group the strains into 31 VNTR-genotypes. Genotypes were divided among 10 discrete clusters by results of a cluster analysis. The presence of tcpA gene is clearly linked with the presence of VcB locus. Each geographic region was characterized by their own VNTR-genotypes. Conclusion. In the course of the carried out VNTR-genotyping of V. cholerae isolated in 2012, 2 types of vibrio population formation were detected. A geographic attachment to specific regions was characteristic for most of the genotypes.

About the authors

A. S Vodopianov

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

A. B Mazrukho

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

S. O Vodopianov

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

B. N Mishankin

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

V. D Kruglikov

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

I. V Arkhangelskaya

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

I. P Oleinikov

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

D. A Zubkova

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

E. V Monakhova

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

L. V Grigorenko

Rostov-on-Don Research Institute of Plague Control, Russia

References

  1. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б. и др. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae. Биотехнология. 2001, 6: 85-88.
  2. Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Олейников И.П. и др. Разработка способа выявления гена tcpA холерного вибриона биотипа эльтор и сероварианта O139 Бенгал с помощью полимеразной цепной реакции. Биотехнология. 1999, 6: 19-23.
  3. Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю.М. и др. Вариабельные тандемные нуклеотидные повторы (VNTR-анализ) у Vibrio cholerae O139, выделенных от людей и из воды поверхностных водоемов России. Журн. микробиол. 2004, 1: 29-34.
  4. Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю.М. и др. Ретроспективный VNTR-анализ генотипов штаммов Vibrio cholerae O1, выделенных на территории Ростовской области в годы 7 пандемии холеры. Мол. ген. микробиол. и вирусол. 2004, 4: 28-33.
  5. Мишанькин Б.Н., Ломов Ю.М., Водопьянов С.О. и др. Мультилокусное VNTR-генотипирование культур холерных вибрионов, выделенных в г. Казань во время вспышки холеры летом 2001 г. Журн. микробиол. 2003, 6: 11-15.
  6. Москвитина Э.А., Мазрухо А.Б., Адаменко О.Л. и др. Холера в начала XXI века. Прогноз на глобальном уровне. Проблемы особо опасных инфекций. 2012, 1: 11-16.
  7. Онищенко Г.Г., Ломов Ю.М., Москвитина Э.А. и др. Холера, обусловленная Vibrio cholerae O1 ctxAB- tcpA+. Журн. микробиол. 2007, 1: 23-29.
  8. Choi S.Y., Lee J.H., Jeon YS. et al. Multilocus variable-number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae O1 El Tor strains harbouring classical toxin B. J. Med. Microbiol. 2010, 59 (7): 763-769.
  9. Danin-Poleg Y., Cohen L.A., Gancz H. et al. Vibrio cholerae strain typing and phylogeny study based on simple sequence repeats. J. Clin. Microbiol. 2007, 45 (3): 736-746.
  10. Kendall E.A., Chowdhury F., Begum Y. et al. Relatedness ofVibrio cholerae O1/O139 isolates from patients and their household contacts, determined by multilocus variable-number tandem-repeat analysis. J. Bacteriol. 2010, 192 (17): 4367-4376.
  11. Monakhova E.V. Phenotypic and molecular characteristics of epidemic and non-epidemic Vibrio cholerae strains isolated in Russia and certain countries ofCommonwealth ofIndependent States (CIS). In: Epidemiological and molecular aspects on cholera. T. Ramamurthy, S.K. Bhattacharya (ed.). Springer Science+Business Media, 2010, 4: 51-78

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2014 Vodopianov A.S., Mazrukho A.B., Vodopianov S.O., Mishankin B.N., Kruglikov V.D., Arkhangelskaya I.V., Oleinikov I.P., Zubkova D.A., Monakhova E.V., Grigorenko L.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies