VNTR-ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ОБЪЕКТОВ ВНЕШНЕЙ СРЕДЫ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2012 ГОДУ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. VNTR-типирование штаммов холерных вибрионов, выделенных на территории Российской Федерации в 2012 году. Материалы и методы. В работе использован 71 штамм Vibrio cholerae O1 и 3 штамма V. cholerae не O1/O139. Генотипирование проводили при помощи ПЦР по 5 VNTR-локусам. Результаты. Мультилокусное VNTR-типирование позволило сгруппировать штаммы в 31 VNTR-генотип. По результатам кластерного анализа генотипы были разделены между 10 дискретными кластерами. Наличие гена tcpA четко связано с присутствием локуса \fcB. Для каждого географического региона были характерны свои VNTR-генотипы. Заключение. В ходе проведенного VNTR-типирования штаммов V. cholerae, выделенных в 2012 году, выявлено два типа формирования популяции вибрионов. Для большинства генотипов характерна географическая привязанность к конкретным регионам.

Об авторах

А. С Водопьянов

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

А. Б Мазрухо

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

С. О Водопьянов

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

Б. Н Мишанькин

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

В. Д Кругликов

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

И. В Архангельская

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

И. П Олейников

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

Д. А Зубкова

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

Е. В Монахова

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

Л. В Григоренко

Ростовский научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону

Список литературы

  1. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б. и др. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae. Биотехнология. 2001, 6: 85-88.
  2. Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Олейников И.П. и др. Разработка способа выявления гена tcpA холерного вибриона биотипа эльтор и сероварианта O139 Бенгал с помощью полимеразной цепной реакции. Биотехнология. 1999, 6: 19-23.
  3. Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю.М. и др. Вариабельные тандемные нуклеотидные повторы (VNTR-анализ) у Vibrio cholerae O139, выделенных от людей и из воды поверхностных водоемов России. Журн. микробиол. 2004, 1: 29-34.
  4. Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю.М. и др. Ретроспективный VNTR-анализ генотипов штаммов Vibrio cholerae O1, выделенных на территории Ростовской области в годы 7 пандемии холеры. Мол. ген. микробиол. и вирусол. 2004, 4: 28-33.
  5. Мишанькин Б.Н., Ломов Ю.М., Водопьянов С.О. и др. Мультилокусное VNTR-генотипирование культур холерных вибрионов, выделенных в г. Казань во время вспышки холеры летом 2001 г. Журн. микробиол. 2003, 6: 11-15.
  6. Москвитина Э.А., Мазрухо А.Б., Адаменко О.Л. и др. Холера в начала XXI века. Прогноз на глобальном уровне. Проблемы особо опасных инфекций. 2012, 1: 11-16.
  7. Онищенко Г.Г., Ломов Ю.М., Москвитина Э.А. и др. Холера, обусловленная Vibrio cholerae O1 ctxAB- tcpA+. Журн. микробиол. 2007, 1: 23-29.
  8. Choi S.Y., Lee J.H., Jeon YS. et al. Multilocus variable-number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae O1 El Tor strains harbouring classical toxin B. J. Med. Microbiol. 2010, 59 (7): 763-769.
  9. Danin-Poleg Y., Cohen L.A., Gancz H. et al. Vibrio cholerae strain typing and phylogeny study based on simple sequence repeats. J. Clin. Microbiol. 2007, 45 (3): 736-746.
  10. Kendall E.A., Chowdhury F., Begum Y. et al. Relatedness ofVibrio cholerae O1/O139 isolates from patients and their household contacts, determined by multilocus variable-number tandem-repeat analysis. J. Bacteriol. 2010, 192 (17): 4367-4376.
  11. Monakhova E.V. Phenotypic and molecular characteristics of epidemic and non-epidemic Vibrio cholerae strains isolated in Russia and certain countries ofCommonwealth ofIndependent States (CIS). In: Epidemiological and molecular aspects on cholera. T. Ramamurthy, S.K. Bhattacharya (ed.). Springer Science+Business Media, 2010, 4: 51-78

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Водопьянов А.С., Мазрухо А.Б., Водопьянов С.О., Мишанькин Б.Н., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Олейников И.П., Зубкова Д.А., Монахова Е.В., Григоренко Л.В., 2014

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах