GENETIChESKIY ANALIZ BIOKhIMIChESKIKh RAZLIChIY ShTAMMOV YERSINIA PESTIS


Cite item

Full Text

Abstract

Literature data and results of our experimental studies on genetic base of biochemical differentiation
of Yersinia pestis strains of various subspecies and biovars are summarized in the review.
Data on variability of genes coding biochemical features (sugar and alcohol fermentation, nitrate
reduction), the differential development of which are the base of existing phenotypic schemes of
Y. pestis strains classification, are presented. Variability of these genes was shown to have possible
use for the development of genetic classification of Y. pestis strains of various subspecies and biovars.

References

  1. Бобров А.Г., Филиппов А.А. Распро- странение IS285 и IS100 в геномах Yersinia pestis и Yersinia pseudotuberculosis. Молекул. генет. микробиол. вирусол. 1997; 2: 36-40.
  2. Ерошенко Г.А., Видяева Н.А., Одиноков Г.Н. и др. Структурно-функциональный анализ гена araC у штаммов Yersinia pestis различного происхождения. Молекул. генет. микробиол. вирусол. 2009; 3: 21-25.
  3. Ерошенко Г.А., Куклева Л.М., Одиноков Г.Н. и др. Способ подвидовой дифференциации штаммов возбудителя чумы методом секвенирования. № RU 2404256, опубликован 20.11.2010.
  4. Ерошенко Г.А.. Одиноков Г.Н., Куклева Л.М. и др. Структурный анализ генов, участвующих в ферментации мелибиозы и продукции изоцитралиазы у штаммов Yersinia pestis основного и неосновных подвидов. Генетика. 2011; 47: 44-50.
  5. Куклева Л.М.. Проценко О.А., Кутырев В.В. Современные представления о родстве возбудителей чумы и псевдотуберкулеза. Молекул. генет. микробиол. вирусол. 2002; 1: 3-7.
  6. Куклева Л.М.. Ерошенко Г.А., Куклев В.Е. и др. Изучение вариабельности генов rha локуса у штаммов Yersinia pestis основного и неосновных подвидов. Молекул. генет. микробиол. вирусол. 2008; 2: 23-27.
  7. Кутырев В.В., Проценко О.А. Класси- фикация и молекулярно-генетические исследования Yersinia pestis. Пробл. особо опасных инф. 1998; 11-12.
  8. Мартиневский И.Л. Биология и генетические свойства чумного и родственных ему микробов. М., Медицина, 1969.
  9. Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., Попов Н.В. и др. Природные очаги чумы Кавказа, Прикаспия, Средней Азии и Сибири. Г.Г.Онищенко, В.В. Кутырев (ред.). М., Медицина, 2004.
  10. Одиноков Г.Н., Ерошенко Г.А., Видяева Н.А. и др. Структурно-функциональный анализ генов nap оперона у штаммов Yersinia pestis разных подвидов. Пробл. особо опасн. инф. 2008; 4 (98): 12-16.
  11. Одиноков Г.Н., Ерошенко Г.А., Краснов Я.М. и др. Генетические основы метионин-зависимости у штаммов основного и неосновных подвидов. Генетика. 2011; 47: 332-338.
  12. Попов Н.В., Безсмертный В.Е.. Матросов А.Н. и др. Эпизоотическая активность природных очагов чумы российской Федерации в 2010 г. и прогноз на 2011 г. Пробл. особо опасных инф. 2011; 1 (107): 31-37.
  13. Achtman M., Zurth K., Morelli G. et al. Yersinia pestis, the cause of plague is a recently emerged clone of Yersinia pseudotuberculosis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999; 96: 14043- 14048.
  14. Deng W., Burland V., Plunkett G. et al. Genome sequence of Yersinia pestis KIM. J. Bacteriol. 2002; 184: 4601-4611.
  15. Devignat R. Variétés de l'espèce Pasteurella pestis. Bull. WHO, 1951; 4: 247-263.
  16. Eppinger M., Worsham P.L., Nicolich M.P. et al. Genome sequence of the deep-rooted Yersinia pestis strain Angola reveals new insight into the evolution and pangenome of the plague bacterium. J. Bacteriol. 2010; 192: 1685-1699.
  17. Li Y., Cui Y., Hauck Y. et al. Genotyping and phylogenetic analysis of Yersinia pestis by MLVA: insights into the worldwide expansion of Central Asia plague foci. PLoS ONE. 2009; 4 (5): e6000.
  18. Morelli G., Song Y., Mazzoni C. et al. Yersinia pestis genome sequencing identifies patterns of global phylogenetic diversity. Nature Genetics. 2010; doi: 10.1038/ng/705.
  19. Motin V.L., Georgescu A.M., Elliot J.M. et al. Genetic variability of Yersinia pestis isolates as predicted by IS100 genotyping and analysis of structural genes encoding glycerol-3-phosphate dehydrogenase (glpD). J. Bacteriol. 2002; 184: 1019-1027.
  20. Parkhill J.B., Wren W., Thomson N.R. et al. Genome sequence of Yersinia pestis, the causative agent of plague. Nature. 2001; 413: 523-527.
  21. Zhou D., Han Y., Song Y. et al. DNA microarray analysis of genome dynamics in Yersinia pestis: Insights into bacterial genome microevolution and niche adaptation. J. Bacteriol. 2004; 186: 5138-5146.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2012 Eroshenko G.A., Odinokov G.N., Kukleva L.M., Kutyrev V.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies