МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ ЦИРКУЛЯЦИИ ЭНТЕРОВИРУСОВ НА ДАЛЬНЕМ ВОСТОКЕ И В ЗАБАЙКАЛЬЕ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Осуществлен 6-летний молекулярно-эпидемиологический мониторинг энтеровирусов на территории Дальнего Востока и Забайкалья. С 2006 по 2011 гг. была определена нуклеотидная последовательность 125 штаммов энтеровирусов. Молекулярный анализ был проведен в области генома вируса VP1. Были проанализированы филогенетические взаимоотношения для вирусов ЕСНО-6, ЕСНО-30, ЕСНО-11, Коксаки В-5 (КВ-5), Коксаки В-1 (КВ-1) и Коксаки А-9 (КА-9). Показано, что вирусам ЕСНО-6 и ЕСНО-30 свойственна высокодинамичная эпидемиология, характеризующаяся генетической гетерогенностью и последовательной сменой вариантов вирусов. Для энтеровирусов КВ-1, КВ-5 и ЕСНО-11, напротив, присуща относительная стабильность циркулирующих генотипов. Результаты молекулярно-эпидемологических исследований указывают на частый занос новых вариантов энтеровирусов из стран Европы и Азии.

Полный текст

МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ ЦИРКУЛЯЦИИ ЭНТЕРОВИРУСОВ НА ДАЛЬНЕМ ВОСТОКЕ И В ЗАБАЙКАЛЬЕ
×

Об авторах

О. Е Троценко

Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии

А. Н Лукашев

Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П.Чумакова, Московская обл

Т. Н Каравянская

Управление Роспотребнадзора по Хабаровскому краю

В. И Резник

Центр гигиены и эпидемиологии в Хабаровском крае

Е. Ю Сапега

Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии

В. О Котова

Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии

Е. Н Амяга

Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии

П. В Корита

Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии

Список литературы

  1. Лукашев А. Н., Резник В. И., Иванова О. Е. и др. Молекулярная эпидемиология вируса ЕСНО 6 — возбудителя вспышки серозного менингита в Хабаровске в 2006 г. Вопр. вирусол. 2008, 1: 16-21.
  2. Резник В. И., Кожевникова Н. В., Каравянская Т. Н. и др. Эпидемиологическая и этиологическая характеристика энтеровирусных инфекций в Хабаровском крае. Журн. микробиол. 2007, 5: 32-37.
  3. Сапега Е. Ю., Троценко О. Е., Резник В. И. и др. Анализ проявлений эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в Дальневосточном регионе в 2010 году. Дальневосточный журн. инфекц. патол. 2011, 19: 18-22.
  4. Bailly J. L., Mirand A., Henquell C. et al. Phylogeography of circulating populations of human echovirus 30 over 50 years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene. Infect. Genet. Evol. 2009, 9: 699-708.
  5. Jorba J., Campagnoli R., De L. et al. Calibration of multiple poliovirus molecular clocks covering an extended evolutionary range. J. Virol. 2008, 82: 4429-4440.
  6. Khetsuriani N., Lamonte-Fowlkes A., Oberste S. et al. Enterovirus surveillance-United States, 1970- 2005. MMWR Surveill. Summ. 2006, 55: 1-20.
  7. Lukashev A. N., Ivanova O. E., Eremeeva T. P. et al. Analysis of echovirus 30 isolates from Russia and new independent states revealing frequent recombination and reemergence of ancient lineages. J. Clin. Microbiol. 2008, 46: 665-670.
  8. McWilliam Leitch E. C., Bendig J., Cabrerizo M. et al. Transmission networks and population turnover of echovirus 30. J. Virol. 2009, 83: 2109-2118.
  9. McWilliam Leitch E. C., Cabrerizo M., Cardosa J. et al. Evolutionary dynamics and temporal/geographical correlates of recombination in the human enterovirus echovirus types 9, 11, and 30. J. Virol. 2010, 84: 9292-9300.
  10. Mulders M., Salminen M., Kalkkinen N. et al. Molecular epidemiology of coxsackievirus B4 and disclosure of the correct VP1/2A PRO cleavage site — evidence for high genomic diversity and long-term endemicity of distinct genetic lineages. J. Gen. Virol. 2000, 81: 803-812.
  11. Nix W. A., Oberste M. S., Pallansch M. A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all entero- virus serotypes from original clinical specimens. J. Clin. Microbiol. 2006, 44: 2698-2704.
  12. Palacios G., Casas I., Cisterna D. et al. Molecular epidemiology of echovirus 30: temporal circulation and prevalence of single lineages. J. Virol. 2002, 76: 4940-4949.
  13. Savolainen C., Hovi T., Mulders M. N. Molecular epidemiology of echovirus 30 in Europe: succession of dominant sublineages within a single major genotype. Arch. Virol. 2001, 146: 521-537.
  14. Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011, 28: 2731-2739.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Троценко О.Е., Лукашев А.Н., Каравянская Т.Н., Резник В.И., Сапега Е.Ю., Котова В.О., Амяга Е.Н., Корита П.В., 2013

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах