Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology13831ArticlesСтатьиConference Report, Theses of ReportMOLECULAR-EPIDEMIOLOGICAL MONITORING OF ENTEROVIRUS CIRCULATION IN THE FAR EAST AND ZABAIKALYEМОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ ЦИРКУЛЯЦИИ ЭНТЕРОВИРУСОВ НА ДАЛЬНЕМ ВОСТОКЕ И В ЗАБАЙКАЛЬЕTrotsenkoO. EТроценкоО. ЕLukashevA. NЛукашевА. НKaravyanskayaT. NКаравянскаяТ. НReznikV. IРезникВ. ИSapegaE. YuСапегаЕ. ЮKotovaV. OКотоваВ. ОAmyagaE. NАмягаЕ. НKoritaP. VКоритаП. ВKhabarovsk Research Institute of Epidemiology and MicrobiologyХабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологииChumakov Research Institute of Poliomyelitis and Viral Encephalitis, Moscow RegionИнститут полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П.Чумакова, Московская облDepartment of Federal Service for Surveillance for Protection of Consumers' Rights and Human Welfare of Khabarovsk RegionУправление Роспотребнадзора по Хабаровскому краюCentre of Hygiene and Epidemiology of Khabarovsk Region, RussiaЦентр гигиены и эпидемиологии в Хабаровском крае15022013901NO1 (2013)№1 (2013)707509062023Copyright ©; 2013, Trotsenko O.E., Lukashev A.N., Karavyanskaya T.N., Reznik V.I., Sapega E.Y., Kotova V.O., Amyaga E.N., Korita P.V.Copyright ©; 2013, Троценко О.Е., Лукашев А.Н., Каравянская Т.Н., Резник В.И., Сапега Е.Ю., Котова В.О., Амяга Е.Н., Корита П.В.2013Trotsenko O.E., Lukashev A.N., Karavyanskaya T.N., Reznik V.I., Sapega E.Y., Kotova V.O., Amyaga E.N., Korita P.V.Троценко О.Е., Лукашев А.Н., Каравянская Т.Н., Резник В.И., Сапега Е.Ю., Котова В.О., Амяга Е.Н., Корита П.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13831

6 year molecular-biological monitoring of enteroviruses in the Far East and Zabaikalye was carried out. Nucleotide sequence of 125 strains was determined from 2006 to 2011. Molecular analysis was carried out in VP1 virus genome region. Phylogenetic interactions for ECHO-6, ECHO-30, ECHO-11, Coxsackie B-5 (CB-5), Coxsackie B-1 (CB-1) and Coxsackie A-9 (CA-9) were analyzed. Highly dynamic epidemiology was shown to be inherent for ECHO-6 and ECHO-30 viruses and is characterized by genetic heterogeneity and consequent change of virus variants. On the contrary a relative stability of circulating genotypes is in- trinsic for CB-1, CB-5 and ECHO-11 enteroviruses. The results of molecular-biological studies indicate frequent introduction of new enterovirus variants from countries of Europe and Asia.

Осуществлен 6-летний молекулярно-эпидемиологический мониторинг энтеровирусов на территории Дальнего Востока и Забайкалья. С 2006 по 2011 гг. была определена нуклеотидная последовательность 125 штаммов энтеровирусов. Молекулярный анализ был проведен в области генома вируса VP1. Были проанализированы филогенетические взаимоотношения для вирусов ЕСНО-6, ЕСНО-30, ЕСНО-11, Коксаки В-5 (КВ-5), Коксаки В-1 (КВ-1) и Коксаки А-9 (КА-9). Показано, что вирусам ЕСНО-6 и ЕСНО-30 свойственна высокодинамичная эпидемиология, характеризующаяся генетической гетерогенностью и последовательной сменой вариантов вирусов. Для энтеровирусов КВ-1, КВ-5 и ЕСНО-11, напротив, присуща относительная стабильность циркулирующих генотипов. Результаты молекулярно-эпидемологических исследований указывают на частый занос новых вариантов энтеровирусов из стран Европы и Азии.

enterovirus infectionsgenotypingECHO-6ECHO-30ECHO-11CB-1CB-5CA-9 en- terovirusesmolecular epidemiologyэнтеровирусные инфекциигенотипированиеэнтеровирусы ЕСНО-6ЕСНО-30ЕСНО-11КВ-1КВ-5КА-9молекулярная эпидемиологияЛукашев А. Н., Резник В. И., Иванова О. Е. и др. Молекулярная эпидемиология вируса ЕСНО 6 — возбудителя вспышки серозного менингита в Хабаровске в 2006 г. Вопр. вирусол. 2008, 1: 16-21.Резник В. И., Кожевникова Н. В., Каравянская Т. Н. и др. Эпидемиологическая и этиологическая характеристика энтеровирусных инфекций в Хабаровском крае. Журн. микробиол. 2007, 5: 32-37.Сапега Е. Ю., Троценко О. Е., Резник В. И. и др. Анализ проявлений эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в Дальневосточном регионе в 2010 году. Дальневосточный журн. инфекц. патол. 2011, 19: 18-22.Bailly J. L., Mirand A., Henquell C. et al. Phylogeography of circulating populations of human echovirus 30 over 50 years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene. Infect. Genet. Evol. 2009, 9: 699-708.Jorba J., Campagnoli R., De L. et al. Calibration of multiple poliovirus molecular clocks covering an extended evolutionary range. J. Virol. 2008, 82: 4429-4440.Khetsuriani N., Lamonte-Fowlkes A., Oberste S. et al. Enterovirus surveillance-United States, 1970- 2005. MMWR Surveill. Summ. 2006, 55: 1-20.Lukashev A. N., Ivanova O. E., Eremeeva T. P. et al. Analysis of echovirus 30 isolates from Russia and new independent states revealing frequent recombination and reemergence of ancient lineages. J. Clin. Microbiol. 2008, 46: 665-670.McWilliam Leitch E. C., Bendig J., Cabrerizo M. et al. Transmission networks and population turnover of echovirus 30. J. Virol. 2009, 83: 2109-2118.McWilliam Leitch E. C., Cabrerizo M., Cardosa J. et al. Evolutionary dynamics and temporal/geographical correlates of recombination in the human enterovirus echovirus types 9, 11, and 30. J. Virol. 2010, 84: 9292-9300.Mulders M., Salminen M., Kalkkinen N. et al. Molecular epidemiology of coxsackievirus B4 and disclosure of the correct VP1/2A PRO cleavage site — evidence for high genomic diversity and long-term endemicity of distinct genetic lineages. J. Gen. Virol. 2000, 81: 803-812.Nix W. A., Oberste M. S., Pallansch M. A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all entero- virus serotypes from original clinical specimens. J. Clin. Microbiol. 2006, 44: 2698-2704.Palacios G., Casas I., Cisterna D. et al. Molecular epidemiology of echovirus 30: temporal circulation and prevalence of single lineages. J. Virol. 2002, 76: 4940-4949.Savolainen C., Hovi T., Mulders M. N. Molecular epidemiology of echovirus 30 in Europe: succession of dominant sublineages within a single major genotype. Arch. Virol. 2001, 146: 521-537.Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011, 28: 2731-2739.