MLVA-TYPING OF CLINICAL STAMPS OF GENETICALLY CHANGED VIBRIO CHOLERAE BIOTYPE EL TOR INSULATED IN RUSSIA AND UKRAINE IN THE PERIOD OF SEVENTH PANDEMIC CHOLERA
- Authors: Savelieva I.V.1, Kulichenko A.N.1, Saveliev V.N.1, Kovalev D.A.1, Vasilieva O.V.1, Zhirov A.M.1, Eremenko E.I.1, Podoprigora E.I.1, Babenyshev B.V.1, Kuznetsova I.V.1, Guseva L.V.1
-
Affiliations:
- Stavropol Research Institute for Plague Control
- Issue: Vol 95, No 6 (2018)
- Pages: 37-43
- Section: Articles
- Submitted: 10.04.2019
- Published: 28.12.2018
- URL: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/326
- DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-2018-6-37-43
- ID: 326
Cite item
Full Text
Abstract
About the authors
I. V. Savelieva
Stavropol Research Institute for Plague Control
Author for correspondence.
Email: noemail@neicon.ru
Россия
A. N. Kulichenko
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
V. N. Saveliev
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
D. A. Kovalev
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
O. V. Vasilieva
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
A. M. Zhirov
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
E. I. Eremenko
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
E. I. Podoprigora
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
B. V. Babenyshev
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
I. V. Kuznetsova
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
L. V. Guseva
Stavropol Research Institute for Plague Control
Email: noemail@neicon.ru
Россия
References
- Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Мишанькин М.Б., Сучков И.Ю. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae. Биотехнология, 2001, 6:85-88.
- Домашенко О.Н., Беломеря Т.А., Мартынова Н.В., Дараген Г.М., Демкович О.О., Малахова Ю.В., Землянская Г.И., Попова Д.М. Холера в Приазовье. Журнал инфектологии, 2015, 7(2):2-97.
- Мишанькин Б.Н., Романова Ю.М., Ломов Ю.М. Vibrio cholerae О139, выделенные от людей и из воды открытых водоемов: сравнительное генотипирование. Журн. микробиол. 2000, 3:3-7.
- Савельев В.Н., Васильева О.В., Савельева И.В., Солодовников Б.В., Бабенышев Б.В., Грижебовский Г.М., Дорошенко И.Г. Ретроспективный анализ генотипов клинических штаммов холерного вибриона Эль Тор, выделенных на Кавказе в период седьмой пандемии холеры. Холера и патогенные для человека вибрионы. Ростов-на-Дону, 2010, 23:81-86.
- Савельева И.В., Безсмертный В.Е., Савельев В.Н. Серологическая диагностика современной холеры с применением липосомального энтеротоксического диагностикума в реакции связывания комплемента. Инфекция и иммунитет. 2013, 3:286-287.
- Смирнова Н.И., Кульшань Т.А., Краснов Я.М. MLVA-типирование клинических штаммов Vibrio cholerae, изолированных в разные периоды текущей пандемии холеры. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2015, 33(1):15-22.
- Boerlin P., Bannerman E., Ischer F. et al. Typing Listeria monocytogenes:a comparison of random amplification of polymorphic DNA with five methods. Res.Microbiol. 1995, 146: 35-49.
- Choi S.U., Lee J.H., Jeon Y.S. et al. Multilocus variable-number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae O1 El Tor strains harbouring classical toxin B. J.Med. Microbiol. 2010, 59(3):763-769.
- Choi S.Y., Lee J.H., Kim E.J. et al. Classical RS1 and environmtntal RS1 RS1 elements in Vibrio cholerae O1 El Tor strains harbouring a tandem repeat of CTX prophage: revisiting Mozambique in 2005. J.Med. Microbiol. 2010, 59(3):302-308.
- Danin-Poleg Y., Cohen L.A., Gancz H. et al. Vibrio cholerae Strain Typing and Phylogene Stady Based on Simple Sequence Repeats. J. Clin. Microbiol. 2007, 45(3):736-746.
- Frerichs R.R., Keim P.S., Barrais R., Piarroux R. Nepalese origin of cholera epidemic in Haiti. Clin. Microbiol. Infect. 2012,18:E158-E163.
- Heidelberg J.F., Eisen J.A., Nelson W.C. et al. DNA sequence of both chromosomes of the cholera pathogen Vibrio cholera. Nature. 2000, 406:477-483.
- Kuleshov K.V. et al. Comparative genomic analysis of two isolates of Vibrio cholerae O1 Ogawa El Tor isolated during outbreak in Mariupol in 2011. Infection, Genetics and Evolution. 2016, 44, October: 471-478.
- Lain C., Octavia S., Reeves R.P., Lan R. Multilocus variable-number tandem repeat analysis of 7th pandemic Vibrio cholerae. BMC Microbiol. 2012, 12(82):1471-2180.
- Olive D.M., Bean P. Principles and applications of methods for DNA-based typing of microbial organisms. J. Clin. Microbiol. 1999, 37:1661-1669.
- Paul R. Hunter, Michael A. Huston. Numerical index of the Discriminatory Ability of Typing Systems: an Application of Simpson's index of Diversity. J. of Clinical Microbiology, 1988 Nov. 26(11):2465-2466.
- Rashed S.M., Azman A.S., Alam M. et al. Genetic Variation of Vibrio cholerae O1 during Outbreaks, Bangladesh, 2010-2011. Emerg.Infect.Dis. 2014. 20 (1):54-60.
- Van Belkum A., Struelens M., de Visser A. et al. Role of genomic typing in taxonomy, evolutionary genetics, and microbial epidemiology. Clin. Mirobiol. Rev. 2001, 14:547-560.
- Wiedmann M. Subtyping of bacterial food-borne pathogens. Nutr. Rev. 2002, 60:201-208.