ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОЕ ОБОСНОВАНИЕ РАСПРОСТРАНЕНИЯ ОСНОВНЫХ КЛОНОВ ГЕНОТИПА BEIJING MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS В ИРКУТСКОЙ ОБЛАСТИ

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Оценка динамики изменения структуры популяции возбудителя туберкулеза в Иркутской области на основе сравнительной характеристики генотипов микобактерий туберкулеза, полученных от больных из контрастных возрастных групп. Материалы и методы. С помощью 24-локусного MIRU-VNTR типирования были охарактеризованы 588 эпидемически не связанных штаммов микобактерий туберкулеза (МБТ), выделенных от 567 больных туберкулезом (ТБ), из которых 160 штаммов принадлежали пациентам из контрастных возрастных групп. Из них 59 штаммов были выделены от «молодых» больных ТБ, родившихся после 1990 года, и 101 изолят от родившихся до 1955 года включительно. Результаты. Две трети выборки образцов МБТ (427/567) принадлежало генотипу Beijing с доминированием двух его субтипов, принадлежащих современным эпидемически распространяющимся в мире клональным комплексам СС1 и СС2. Высокий уровень кластеризации профилей этих вариантов генотипа Beijing у «пожилых» и «молодых» пациентов в Иркутской области свидетельствует о наличии стойкого очага инфекции и активной трансмиссии на протяжении последних 50 лет.

Об авторах

С. Н. Жданова

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
Россия

О. Б. Огарков

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека; Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования; Иркутский государственный университет

Email: noemail@neicon.ru
Россия

В. В. Синьков

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: noemail@neicon.ru
Россия

П. А. Хромова

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Е. А. Орлова

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: noemail@neicon.ru
Россия

М. Е. Кощеев

Иркутская областная клиническая туберкулезная больница

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Е. Д. Савилов

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека; Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Список литературы

  1. Жданова С.Н., Огарков О.Б., Степаненко J1.А. и др. Применение делеционного анализа по RD105 для выявления генотипа Пекин Mycobacterium tuberculosis. Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра Сибирского отделения Российской академии медицинских наук. 2011, 2:194-197.
  2. Краснов В.А., Ревякина О.В., Филимонов П.Н. и др. Влияние отдельных демографических и географических факторов на оказание противотуберкулезной помощи в регионах Сибири и Дальнего Востока. Туберкулез и болезни легких. 2012, 8:10-15
  3. Синьков В.В., Савилов Е.Д., Огарков О.Б. Эпидемиология туберкулеза в России: молекулярные и исторические доказательства в пользу сценария распространения пекинского генотипа М. tuberculosis в XX в. Туберкулез и болезни легких. 2012, 3: 57-62.
  4. Туберкулез в Российской Федерации, 2012/2013/2014 гг. Аналитический обзор статистических показателей, используемых в Российской Федерации и в мире. М., 2015.
  5. Borrell S., Gagneux S. Strain diversity, epistasis and the evolution of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis. Clin. Microbiol. Infect. 2011,17: 815-820.
  6. Casali N., Nikolayevskyy V., Balabanova Y. et al. Evolution and transmission of drug-resistant tuberculosis in a Russian population. Nat. Genet. 2014, 46: 279-286.
  7. Groenheit R., Ghebremichael S., Permhag A. et al. Mycobacterium tuberculosis strains potentially involved in the ТВ epidemic in Sweden a century ago. PLOS One. 2012, 77(10):e46848.
  8. Hanekom М., Gey van Pittius N.C., McEvoy C. et al. Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a template for success. Tuberculosis (Edinb). 2011, 91 (6): 510-523.
  9. Lasunskaia E., Ribeiro S.C., Manicheva O. et al. Emerging multidrug resistant Mycobacterium tuberculosis strains of the Beijing genotype circulating in Russia express a pattern of biological properties associated with enhanced virulence. Microbes Infect. 2010, 12 (6): 467-475.
  10. Marais B.J., Gie R.P., Schaaf H.S. et al. The natural history of childhood intra-thoracic tuberculosis: a critical review of literature from the pre-chemotherapy era. Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2004, 8 (4): 392-402.
  11. Merker М., BlinC., Mona S. etal. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage. Nat. Genet. 2015, 47 (3): 242-249.
  12. Mokrousov L, Narvskaya O., Vyazovaya A. et al. Russian «successful» clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a multiplex PCR assay for rapid detection and global screening. J. Clinical Microbiology. 2012, 50 (11): 3757-3759.
  13. Mokrousov I. Insights into the origin, emergence, and current spread of a successful Russian clone of Mycobacterium tuberculosis. Clin. Microbiol. Rev. 2013, 26 (2): 342-360.
  14. Mokrousov I. Mycobacterium tuberculosis phylogeography in the context of human migration and pathogen's pathobiology: Insights from Beijing and Ural families. Tuberculosis (Edinb). 2015,95 (1): SI67-76.
  15. Ogarkov O., Mokrousov 1., Sinkov V. et al. «Lethal» combination of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and human CD209 -336G allele in Russian male population. Infect. Genet. Evol. 2012, 12 (4): 732-736.
  16. Parwati I., van Crevel R., van Soolingen D. Possible underlying mechanisms for successful emergence of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype strains. Lancet Infect. Dis. 2010, 10(2): 103-111.
  17. Reed M.B., Domenech P., Manca C. et al. Aglycolipid of hypervirulent tuberculosis strains that inhibits the innate immune response. Nature. 2004, Sep 2; 431 (7004): 84-87.
  18. Smit P.W., Haanpera М., Rantala P. et al. Genotypic characterization and historical perspective of Mycobacterium tuberculosis among older and younger Finns, 2008-2011. Clin. Microbiol. Infect. 2014, 20(11): 1134-1139.
  19. Supply P., Allix C., Lesjean S. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol. 2006, 44 (12): 4498-4510.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Жданова С.Н., Огарков О.Б., Синьков В.В., Хромова П.А., Орлова Е.А., Кощеев М.Е., Савилов Е.Д., 2017

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах