ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ LEPTOSPIRA SPP. НА ОСНОВЕ 16S рРНК

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Сравнительное типирование коллекции штаммов Leptospira spр. на основе анализа 16S фрагмента РНК. Материалы и методы. Для ПЦР использовали две пары праймеров, совместно фланкирующих фрагмент размером 1423 п.о. Для филогенетического анализа были использованы последовательности штаммов 16S рРНК Leptospira sрp., представленные в международной базе данных. Результаты. Показано высокое сходство, в том числе межвидовое, 16S фрагмента у штаммов Leptospira spp., независимо от источника получения, серовара и серогруппы. Обсуждаются гетерогенность первичной матрицы, спонтанные мутации горячих точек и ошибочные спаривания нуклеотидов, характерные для 16S последовательности патогенных штаммов Leptospira spp. Получена молекулярногенетическая характеристика некоторых референсных штаммов Leptospira sрp. по 16S последовательности. Заключение. Результаты исследований свидетельствуют о целесообразности введения в клиническую практику идентификацию штаммов Leptospira sрp. по 16S последовательности непосредственно из клинического материала, что позволит значительно сократить время идентификации, отказаться от сложных типоспецифических сывороток и иных трудоемких методов.

Об авторах

Ю. В. Останкова

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
Россия

А. В. Семенов

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Н. А. Стоянова

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Н. К. Токаревич

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Н. Е. Любимова

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: noemail@neicon.ru
Россия

О. А. Петрова

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Ю. В. Ананьина

Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Е. М. Петров

Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Список литературы

  1. Ананьина Ю.В. Лептоспирозы в Российской Федерации: современные особенности эпидемического проявления природных и техногенных очагов. Ветеринарная патология. 2004, 4: 54-57.
  2. Стоянова Н.А., Токаревич Н.К., Ваганова А.Н. Лептоспирозы: пособие для врачей. Санкт-Петербург, 2010.
  3. Chappel R.J., Goris M., Palmer M.F. Impact of proficiency testing on results of the microscopic agglutination test for diagnosis of leptospirosis. J. Clin. Microbiol. 2004, 42: 54845488.
  4. Cerqueira G.M., McBride A.J.A., Queiroz A. et al. Monitoring leptospira strain collections: The need for quality control. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2010, 82 (1): 83-87.
  5. Faine S., Adler B., Bolin C. Leptospira and Leptospirosis. Melbourn, Australia, 1999.
  6. Morey R.E., Galloway R.L., Bragg S.L. Species-specific identification of Leptospiraceae by 16S rRNA gene sequencing. J. Clin. Microbiol. 2006, 44: 3510-3516.
  7. Postic D., Riquelme-Sertour N., Merien F. Interest of partial 16S rDNA gene sequences to resolve heterogeneities between Leptospira collections: application to L. meyeri. Res. Microbiol. 2000, 151 (5): 333-341.
  8. Sagunan A. Risk factor associated with leptospirosis during an outbreak in Middle Andaman, India. Indian J. Med. Res. 2009, 130 (1): 114-116.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Останкова Ю.В., Семенов А.В., Стоянова Н.А., Токаревич Н.К., Любимова Н.Е., Петрова О.А., Ананьина Ю.В., Петров Е.М., 2016

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах