Отправить статью по E-mail NG-MAST ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ NEISSERIA GONORRHOEAE, ВЫДЕЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2012 -2015 ГОДАХ
- Авторы: Воробьев Д.В.1, Соломка В.С.1, Плахова К.И.1, Дерябин Д.Г.1, Кубанов А.А.1
-
Учреждения:
- Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии
- Выпуск: Том 93, № 4 (2016)
- Страницы: 42-51
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- Дата подачи: 10.04.2019
- Дата публикации: 28.08.2016
- URL: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/68
- DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-2016-4-42-51
- ID: 68
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Цель. Характеристика современных штаммов N.gonorrhoeae с использованием NG-MAST генотипирования (Neisseria gonorrhoeae multi antigen sequence typing), выявление доминирующих вариантов и анализ их территориального распределения. Материалы и методы. В работе использованы 440 штаммов N.gonorrhoeae, выделенных в 2012 - 2015 годах на территории 19 субъектов Российской Федерации. Генотипирование проводили на основе секвенирования вариабельных участков генов роrВ и tbpB. Идентификацию аллелей и сиквенс-типов осуществляли согласно www.ng-mast.net. Результаты. Идентифицировано 172 NG-MAST генотипа, 100 из которых были описаны впервые. Преобладающими сиквенс-типами являлись 807, 1152, 1544, 5714 и 5941, типичные для нескольких субъектов Российской Федерации и некоторых стран ближнего зарубежья, а также впервые описанные сиквенс-типы 8583 и 9476, получившие исключительное распространение в регионах своего возникновения. Эпидемически значимые в странах дальнего зарубежья сиквенс-типы 225,1407 и 2992 в настоящем исследовании были представлены единичными изолятами. Заключение. Показано своеобразие и значительное генетическое разнообразие штаммов N.gonorrhoeae, циркулирующих на территории Российской Федерации, с характерной привязанностью некоторых NG-MAST генотипов к одному или нескольким регионам.
Ключевые слова
Об авторах
Д. В. Воробьев
Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии
Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
Россия
В. С. Соломка
Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии
Email: noemail@neicon.ru
Россия
К. И. Плахова
Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Д. Г. Дерябин
Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии
Email: noemail@neicon.ru
Россия
А. А. Кубанов
Государственный научный центр дерматовенерологии и косметологии
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Список литературы
- Кубанова А.А., Кубанов А.А., Мелехина Л.Е., Богданова Е.В. Дерматовенерология в Российской Федерации. Итоги 2014 г. Успехи, достижения, основные пути развития. Вестник дерматологии и венерологии. 2015, 4: 13-26.
- Соломка В.С., Чупров-Неточин Р.Н., Фриго Н.В., Кубанов А.А. Опыт молекулярного типирования и филогенетического анализа штаммов N. gonorrhoeae в Российской Федерации. Вестник дерматологии и венерологии. 2012, 2: 13-20.
- Buono S., Wu A., Hess D.C. et al. Using the Neisseria gonorrhoeae multiantigen sequencetyping method to assess strain diversity and antibiotic resistance in San Francisco, California. Microb. Drug Resist. 2012, 8 (5): 510-517.
- Chen C.C., Yen M.Y., Wong W.W. et al. Tracing subsequent dissemination of a cluster of gono- - ЖМЭИ 4 №25-2016 49 coccal infections caused by an ST 1407-related clone harbouring mosaic penA alleles in Taiwan. J. Antimicrob. Chemother. 2013, 68 (7): 1567-1571.
- European centre for disease prevention and control. Molecular typing of Neisseria gonorrhoeae - results from a pilot study 2010-2011. Stockholm, ECDC, 2012.
- Global incidence and prevalence of selected curable sexually transmitted infections. Geneva, WHO, 2012.
- Jeverica S., Golparian D., Maticic M. et al. Phenotypic and molecular characterization of Neisseria gonorrhoeae isolates from Slovenia, 2006-12: rise and fall of the multidrug-resistant NG-MAST genogroup 1407 clone? J. Antimicrob. Chemother. 2014, 69: 1517-1525.
- Kushnir A.V., Muminov T.A., Bayev A.I. et al. Molecular characterization of Neisseria gonorrhoeae isolates in Almaty, Kazakhstan, by VNTR analysis, Opa-typingand NG-MAST. Infection Genetics Evolution. 2012. 12: 570-576.
- Martin I.M., IsonC.A., AanensenD.M.etal. Rapid sequencing-based identification of gonococcal transmission clusters in a large metropolitan area. J. Infect. Dis. 2004, 189 (8): 1497-1505.
- Thakur S.D., Levett P.N., Horsman G.B. et al. Molecular epidemiology of Neisseria gonorrhoeae isolates from Saskatchewan, Canada: utility of NG-MAST in predicting antimicrobial susceptibility regionally. Sex. Transm. Infect. 2014, 90 (4): 297-302.
- Unemo M., Vorobieva V, Firsova N. et al. Neisseria gonorrhoeae population in Arkhangelsk, Russia: phenotypic and genotypic heterogeneity. Clin. Microbiol. Infect. 2007, 13 (9): 873-878.
Дополнительные файлы
