МЕЖМИКРОБНОЕ РАСПОЗНАВАНИЕ «СВОЙ-ЧУЖОЙ» В ПАРЕ «ДОМИНАНТ-АССОЦИАНТ» ПРОБИОТИЧЕСКИХ ШТАММОВ ESCHERICHIA COLI М-17 И ESCHERICHIA COLI ЛЭГМ-18
- Авторы: Бухарин О.В.1, Перунова Н.Б.1, Иванова Е.В.1, Андрющенко С.В.1
-
Учреждения:
- Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза
- Выпуск: Том 93, № 3 (2016)
- Страницы: 3-9
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- Дата подачи: 10.04.2019
- Дата публикации: 28.06.2016
- URL: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/42
- DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-2016-3-3-9
- ID: 42
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Цель. Разработанный ранее метод межмикробного распознавания «свой-чужой» в паре «доминант-ассоциант» использовать для оценки чужеродности пробиотических культур Escherichia coli М-17 (с островом патогенности) и Е. coli ЛЭГМ-18 (без острова патогенности). Материалы и методы. В качестве доминантов в работе использованы эталонные и клинические штаммы бифидобактерий, в качестве ассоциантов взяты культуры Е. coli М-17 и ЛЭГМ-18, различающиеся по наличию генов, кодирующих колибактин. Определение феномена микробного распознавания проводили по разработанному алгоритму (Бухарин О. В., ПеруноваН.Б., 2011), основанному на принципе индукции метаболитов в результате предварительного соинкубирования доминантов (бифидобактерий) с супернатантом ассоциантов и формирования обратной связи в паре «доминант-ассоциант». В качестве биологических характеристик исследуемых кишечных палочек были определенные ростовые свойства, биопленкообразование и антилизоцимная активность. Результаты. Тестирование культуры Е. coli М-17 выявило угнетение изучаемых биологических признаков, и она оценивалась как «чужая», вероятно, за счет наличия острова патогенности, тогда как Е. coli ЛЭГМ-18 (без этого фрагмента) резко усиливала свои биологические характеристики и подлежала оценке как «своя». Заключение. Использование межмикробного распознавания «свой-чужой» в паре «доминант-ассоциант» перспективно в качестве базового метода при отборе пробиотических штаммов и культур микроорганизмов для создания новых синбиотических композиций и пригодно для контроля за качеством пробиотической продукции.
Об авторах
О. В. Бухарин
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза
Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Н. Б. Перунова
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Е. В. Иванова
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза
Email: noemail@neicon.ru
Россия
С. В. Андрющенко
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Список литературы
- Бондаренко В.М., Фиалкина С.В. Наличие генов генотоксина, ассоциированных с pks островом патогенности, у пробиотического штамма Escherichia coli М-17. Журн. микро-биол. 2012, 5: 25-27.
- Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Микробное распознование «свой-чужой» в условиях кишечного микросимбиоценоза человека. Журн. микробиол. 2011, 6: 46-51.
- Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Микросимбиоценоз. Екатеринбург: УрО РАН, 2014.
- Бухарин О.В., Сгибнев А.В. Влияние метаболитов коринебактерий на антагонистическую активность НгОг-продуцирующих лактобацилл. Журн. микробиол. 2012, 4: 48-51.
- Марков А.В., Куликов А.М. Гипотеза «иммунологического тестирования» партнеров - системы распознавания «своих» и «чужих» в исторической перспективе. Известия РАН. Серия биологическая. 2006, 4: 389-403.
- Сгибнев А.В. Механизмы выживания бактерий в условиях окислительного стресса и дефицита ионов железа. Журн. микробиол. 2006, 4: 20-22.
- Gibbs К. A., Urbanowski M.L., Greenberg Е.Р. Genetic determinants of self identity and social recognition in bacteria. Science. 2008, 321 (5886): 256-259.
- Johnson J.R., Johnston B., Kuskowski M.A. et al. Molecular epidemiology and phylogenetic distribution of the Escherichia coli pks genomic island. J. Clin. Microbiol. 2008,46 (12): 3906-3911.
- Jousime-Somers H., Summanen P. et al. Anaerobic Bacteriology Manual. Star Publishing; 2002.
- Lypez-Larrea C. (ed.). Self and nonself. Landes Bioscience and Springer Science+Business Media. Adv. Experiment. Med. Biology. 2012, 738.
- Martin P., Marcql., Magistro G. et al. Interplay between siderophores and colibactin genotoxin biosynthetic pathways in Escherichia coli. PLoSPathog. 2013,9 (7): e 1003437. doi: 10.1371/ journal, ppat. 1003437.
- Nougayrede J.P., Homburg S., Taieb F. et al. Escherichia coli induces DNA double-strand breaks in eukaryotic cells. Science. 2006, 313 (5788): 848-851.
- Roux A., Payne S.M., Gilmore M.S. Microbial telesensing: probing the environment for friends, foes, and food. Cell Host Microbe. 2009, 6 (2): 115-124.
- Shank A. E., Kolter R. New developments in microbial interspecies signaling. Curr. Opin. Microbiol. 2009, 12(2): 205-214.
- Wenren L.M., Sullivan N.L., Cardarelli L. et al. Two independent pathways for self-recognition in proteus mirabilis are linked by type Vi-dependent export. mBio. 2013, 4 (4): e00374-13. doi: 10.1128/mBio.00374-13.