Отправить статью по E-mail РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ЭЛЕМЕНТА ICE-emm12, СОДЕРЖАЩЕГО ГЕНЫ УСТОЙЧИВОСТИ tetM И ermB, СРЕДИ РОССИЙСКИХ И ВЬЕТНАМСКИХ ШТАММОВ СТРЕПТОКОККОВ ГРУППЫ А
- Авторы: Киреева А.Г.1,2, Калинина О.В.3,4, Киселев А.М.3, Брико Н.И.5, Глушкова Е.В.5, Дмитриев А.В.1,2
-
Учреждения:
- Институт экспериментальной медицины
- Санкт-Петербургский государственный университет
- Северо-Западный федеральный медицинский исследовательский центр им. В.А.Алмазова
- Санкт-Петербургский государственный технологический институт «Технический университет»
- Первый московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова
- Выпуск: Том 95, № 2 (2018)
- Страницы: 23-30
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- Дата подачи: 10.04.2019
- Дата публикации: 28.04.2018
- URL: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/262
- DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-2018-2-23-30
- ID: 262
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Цель. Характеристика и изучение распространенности генетического элемента ICE-emm12, ассоциированного со вспышками стрептококковых заболеваний в Юго-Восточной Азии, среди российских и вьетнамских штаммов СГА. Материалы и методы. Изучены 96 штаммов, выделенных в 2007 - 2014 гг. Молекулярно-генетические эксперименты проводили по опубликованным методикам. Полногеномное секвенирование осуществляли по технологии MiSeq. Результаты. На основе анализа данных высокопроцессивного секвенирования в геноме вьетнамского штамма V31 идентифицирован фрагмент (61028 п.н.), гомологичный интегративно-конъюгативному элементу ICE-emm12 и содержащий гены устойчивости к MLS-антибиотикам (ermB) и тетрациклину (tetM). Этот элемент обнаружен у 12 (26,1%, типы emm12.0, emm12.22) из 46 вьетнамских штаммов и у 2 (4,0%, типы emm12.0, emm88.2) из 50 российских штаммов. У 13 из 14 штаммов ICE-emm12 интегрирован в структурную область гена РНК-метилтрансферазы, являющегося «горячей точкой» рекомбинаций. Во всех штаммах ICE-emm12 обнаруживался в линейной интегрированной форме и в замкнутой циклической форме, что указывает на возможность его дальнейшего горизонтального переноса. Заключение. Обнаружение у российских штаммов ICE-emm12 элемента, способного к переносу генов устойчивости к антибиотикам с учетом активного развития туризма в страны Юго-Восточной Азии указывают на необходимость постоянного молекулярно-эпидемиологического надзора за циркуляцией клонов-возбудителей стрептококковых заболеваний в России.
Об авторах
А. Г. Киреева
Институт экспериментальной медицины; Санкт-Петербургский государственный университет
Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
Россия
О. В. Калинина
Северо-Западный федеральный медицинский исследовательский центр им. В.А.Алмазова; Санкт-Петербургский государственный технологический институт «Технический университет»
Email: noemail@neicon.ru
Россия
А. М. Киселев
Северо-Западный федеральный медицинский исследовательский центр им. В.А.Алмазова
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Н. И. Брико
Первый московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Е. В. Глушкова
Первый московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова
Email: noemail@neicon.ru
Россия
А. В. Дмитриев
Институт экспериментальной медицины; Санкт-Петербургский государственный университет
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Список литературы
- Носик А.Г., Ильясов Ю.Ю., Линь Ф.К., Дмитриев А.В. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика стрептококков, выделенных у детей младшего школьного возраста во Вьетнаме. Журн. инфектологии. 2015, 7 (3): 112-118.
- Полякова Е.М., Мнацаканян Е.С., Бурова Л.А., Дмитриев А.В. Генетическая гетерогенность штаммов Streptococcus pyogenes генотипа emm12. Медицинский академический журнал. 2010, 10 (1): 39-44.
- Beres S.B., Musser J.M. Contribution of exogenous genetic elements to the group A Streptococcus metagenome. PLoS One. 2007, 2 (8): e800.
- Carapetis J.R., Steer A.C., Mulholland E.K. et al. The global burden of group A streptococcal diseases. Lancet Infectious Diseases. 2005, 5 (11): 685-694.
- Elliot J.A., Farmer K.D., Facklam R.R. Sudden increase in isolation of group B streptococci, serotype V, is not due to emergence of a new pulsed-field gel electrophoresis type. J. Clin. Microbiol. 1998, 36: 2115-2116.
- Feng L.J., Lin H.R., Ma Y.L. et al. Macrolide-resistant Streptococcus pyogenes from Chinese pediatric patients in association with Tn916 transposons family over a 16-year period. Diagnostic Microbiology Infectious Disease. 2010, 67 (4): 369-375.
- Guy R., Williams C., Irvine N. et al. Increase in scarlet fever notifications in the United Kingdom, 2013/14. Eurosurveillance. 2014, 19 (12): 20749.
- Ip M., Lyon D.J., Leung T. et al. Macrolide resistance and distribution of erm and mef genes among beta-haemolytic streptococci in Hong Kong. European J. Clinical Microbiology Infectious Diseases. 2002, 21 (3): 238-240.
- Kataja J., Huovinen P., Seppala H. Macrolide resistance study G. Erythromycin resistance genes in group A streptococci of different geographical origins. J. Antimicrobial Chemotherapy. 2000, 46 (5): 789-792.
- Luk E.Y., Lo J.Y., Li A.Z. et al. Scarlet fever epidemic, Hong Kong, 2011. Emerging Infectious Diseases. 2012, 18 (10): 1658-1661.
- Olivieri R., Morandi M., Zanchi A. et al. Evolution of macrolide resistance in Streptococcus pyogenes over 14 years in an area of central Italy. J. Medical Microbiology. 2015, 64: 11861195.
- ProMED-Mail (2009, June 20). Streptococcus, group A, scarlet fever - Vietnam. Retrieved December 06, 2015.
- Tse H., Bao J.Y.J., Davies M.R. et al. Molecular сharacterization of the 2011 Hong Kong Scarlet Fever Outbreak. J. Infectious Diseases. 2012, 206 (3): 341-351.
- Varaldo P.E., Montanari M.P., Giovanetti E. Genetic elements responsible for erythromycin resistance in streptococci, Antimicrobial Agents Chemotherapy. 2009, 53: 343-353.
- Yan J.J., Wu H.M., Huang A.H. et al. Prevalence of polyclonal mefA-containing isolates among erythromycin-resistant group A streptococci in southern Taiwan. J. Clinical Microbiology. 2000, 38 (7): 2475-2479.
Дополнительные файлы
