Распространённость генов qacEΔ1, qacE, oqxA, oqxB, acrA, cepA и zitB среди мультирезистентных Klebsiella pneumoniae, выделенных в кардиохирургическом стационаре

Полный текст

Введение

Klebsiella pneumoniae является одним из ведущих возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи в кардиохирургических стационарах. Представители этого вида, согласно классификации Всемирной организации здравоохранения, относятся к группе приоритетных патогенов, поскольку инфекции, вызванные мульти- и панрезистентными K. pneumoniae, ассоциированы с высокой смертностью пациентов [1]. Необходимой частью программы инфекционного контроля и предотвращения внутрибольничных инфекций является обработка поверхностей дезинфектантами и антисептиками [2]. Часто использующиеся в качестве дезинфицирующих средств четвертичные аммониевые соли (ЧАС) обладают способностью прикрепляться к клеточной стенке бактерий благодаря положительному заряду, что вызывает её структурную дезорганизацию и лизис клеток. Хлоргексидин может ковалентно связываться с мембраной, что в конечном итоге приводит к деполяризации и гибели клеток бактерий [3]. Широкое применение дезинфицирующих средств и антисептиков (в том числе в общественных и медицинских учреждениях во время пандемии COVID-19) вызвало возникновение резистентных к ним K. pneumoniae, что в сочетании с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) может представлять существенную эпидемиологическую угрозу [4, 5].

Одним из механизмов резистентности K. pneumoniae к биоцидам является экспрессия эффлюксных насосов (ЭН). Существуют 6 семейств эффлюксных систем: основное суперсемейство мембранных транспортеров (MFS), суперсемейство оттока лекарственных и токсичных веществ (MATE), суперсемейство АТФ-связывающих бактериальных кассетных транспортеров (ABC), суперсемейство малых транспортеров множественной лекарственной устойчивости (SMR), суперсемейство связывающе-транспортирующих протеинов (RND) и недавно описанная протеобактериальная антимикробная эффлюксная структура (PACE) [6, 7]. AcrAB, OqxAB, EefAB и KexD относятся к белкам суперсемейства RND, которое является наиболее важным у грамотрицательных бактерий. Среди ЭН наибольшую значимость представляют AcrAB и OqxAB [8]. Гены qacE и qacEΔ1 впервые были описаны у K. pneumoniae в 3'-консервативном сегменте интегрона плазмиды R751 [9]. Ген qacEΔ1 представляет собой модифицированную форму qacE, которая возникла в результате вставки сегмента ДНК, содержащего ген устойчивости к сульфаниламиду вблизи 3'-конца гена qacE. упомянутые ЭН относятся к суперсемейству SMR и обусловливают устойчивость к органическим катионам. Известно, что cepA, кодирующий насос оттока катионов, связан с устойчивостью к хлоргексидину у K. pneumoniae [10]. ZitB участвует в конститутивном пути экспорта цинка, способствуя гомеостазу клетки во время воздействия низких и умеренных концентраций ионов металла [11].

Гены группы qac часто выявляются в ассоциации с генами, кодирующими устойчивость к антибиотикам разных групп, в том числе к бета-лактамам [12]. В нескольких работах отмечается, что присутствие насоса AcrAB-TolC способствовало снижению минимальной ингибирующей концентрации ципрофлоксацина [13] и бета-лактамов [4] и формированию МЛУ. Важно, что гены ЭН, связанных с устойчивостью к биоцидам, располагаются не только на хромосоме (emrE, mdfA, sugE, ydgE, ydgF), но и на мобильных генетических элементах (oqxA, oqxB, qacEΔ1, qacE, qacF/H/I, qacG, sugE), таких как плазмиды, интегроны и транспозоны [14]. Более того, гены ЭН могут быть локализованы на тех же мобильных элементах, что и гены устойчивости к антибиотикам, что приводит к перекрестной или ко-резистентности к дезинфектантам, антисептикам и антимикробным препаратам [14].

Ранее мы представили молекулярно-генетическую характеристику изолятов K. pneumoniae, выделенных от пациентов и проб окружающей среды в кардиохирургическом стационаре [15].

Цель исследования — оценка распространённости генов ЭН и транспортёров, ассоциированных с устойчивостью к биоцидам, и их связи с резистентностью к антибиотикам среди изолятов K. pneumoniae, выделенных в условиях кардиохирургического стационара.

Материалы и методы

Бактериальные изоляты

Исследовали 50 изолятов K. pneumoniae, выделенных в 2021–2022 гг. из клинического материала пациентов (мокрота, кровь, моча, содержимое ран) и смывов с медицинского оборудования кардиохирургического стационара. Исследование проводилось при добровольном информированном согласии пациентов. Протокол исследования одобрен Институциональным наблюдательным советом Института экологии и генетики микроорганизмов (протокол № 26, дата утверждения 22.05.2024).

Бактериологические исследования были выполнены на автоматическом анализаторе «WalkAway-96 Plus» («Beckman Сoulter») с использованием панели NBC 41. Чувствительность к антибиотикам (ампициллин, цефотаксим, цефтазидим, цефтриаксон, цефепим, меропенем, имипенем, ампициллин/сульбактам, ампициллин/клавуланат, ципрофлоксацин, левофлоксацин, амикацин, гентамицин) и присутствие генов бета-лактамаз (bla_TEM, bla_CTX-M, bla_SHV, bla_OXA, bla_KPC, bla_VIM-2, bla_IMP-1, bla_NDM-1) оценивали ранее [15]. Фенотип МЛУ определяли как нечувствительность штаммов хотя бы к одному препарату 3 и более классов антибиотиков.

Детекция генов ЭН и мобильных генетических элементов

ДНК изолятов K. pneumoniae экстрагировали путём прогрева суспензии клеток бактерий в течение 15 мин при 97ºС в твёрдотельном термостате «Термит», пробы охлаждали, центрифугировали 5 мин при 13 000 об/мин, супернатанты переносили в чистые пробирки Эппендорф и хранили при ‒20ºC. Методом ПЦР детектировали гены ЭН, ассоциированных с устойчивостью к ЧАС и хлоргексидину (qacEΔ1, qacE, oqxA, oqxB, acrA), ген транспортёра катионов (cepA), ген zitB, кодирующий транспортёр цинка, ген интегронов класса 1 (int1), а также плазмиды IncQ, распространённой в клинических K. pneumoniae. Праймеры, синтезированные ООО «Cинтол» согласно рекомендациям авторов, условия проведения ПЦР и размеры ампликонов указаны в табл. 1. Амплификацию проводили в 25 мкл реакционной смеси с использованием реагентов производства ООО «Синтол» на термоциклере «DNA Engine Dyad Thermal Cycler» («Bio-Rad»). Электрофоретическое разделение продуктов реакции проводили в 1,2–2,0% агарозном геле в трисборатном буфере при напряжении электрического поля 6 В/см. Визуализацию полос и документирование данных осуществляли с помощью системы гель-документации «Gel-DocXR» («Bio-Rad»).

 

Таблица 1. Использованные в исследовании последовательности праймеров, условия проведения ПЦР и ожидаемый размер ампликона

Table 1. Primer sequences used in the study, the conditions for PCR and the expected size of the amplicons

Ген Gene	Нуклеотидная последовательность (5’–3’) Nucleotide sequence (5’–3’)	Условия ПЦР PCR conditions	Размер, п.н. Size, bp	Ссылка Reference
ЭН и транспортёры | Efflux pumps and transporters
qacEΔ1	F: TAGCGAGGGCTTTACTAAGC R: ATTCAGAATGCCGAACACCG	93ºC, 2 m; 35 [93ºC, 30 s; 55ºC, 30 s; 72ºC, 1 m]; 72ºC, 5 m	300	[16]
qacE	F: CCCGAATTCATGAAAGGCTGGCTT R: AAGCTTTCACCATGGCGTCGG		350
cepA	F: CAACTCCTTCGCCTATCCCG R: TCAGGTCAGACCAAACGGCG	94ºC, 5 m; 30 [94ºC, 30 s; 53ºC, 60 s; 72ºC, 2 m]; 72ºC, 7 m	1051
oqxA	F: CTCGGCGCGATGATGCT R: CCACTCTTCACGGGAGACGA	95ºC, 1 m; 35 [95ºC, 45 s; 60ºC, 45 s; 72ºC, 1 m]; 72ºC, 5 m	392	[17]
oqxB	F: TTCTCCCCCGGCGGGAAGTAC R: CTCGGCCATTTTGGCGCGTA		512
acrA	F: GCTGTCGACGGTTAATGACTTTACAGAGG R: ACATCCGAGAATTCCAGCGT	94ºC, 3 m; 34 [94ºC, 45 s; 52ºC, 45 s; 68ºC, 1 m]; 72ºC, 5 m	107	[18]
zitB	F: TACGACGCTTCAGTTCAGC R: CACTTTCGGTTGGCTAAGAC	95ºC, 5 m; 30 [94ºC, 30 s; 53ºC, 60 s; 72ºC, 60 s]; 72ºC, 7 m	449	[19]
Мобильные генетические элементы | Mobile genetic elements
intI	F: GGCATCCAAGCAGCAAG R: AAGCAGACTTGACCTGA	94ºC, 5 m; 35 [94ºC, 30 s; 55ºC, 30 s; 72ºC, 2 m]; 72ºC, 5 m	–*	[20]
IncQ	F: CTCCCGTACTAACTGTCACG R: ATCGACCGAGACAGGCCCTGC	94ºC, 5 m; 35 [94ºC, 30 s; 61ºC, 30 s; 72ºC, 2 m]; 72ºC, 5 m	436	[21]

Примечание. *Продукт амплификации может быть представлен несколькими последовательностями разного размера.

Note. *The amplification product may be represented by several sequences of different size.

 

Статистический анализ

Для выявления значимых различий между качественными показателями выборок определяли точный критерий Фишера (двусторонний). Значения p < 0,05 считали достоверными. Тест ранговой корреляции Спирмена использовали для оценки силы ассоциации между генами ЭН и транспортёров, генами бета-лактамаз и мобильных генетических элементов. Сила связи была классифицирована по значению коэффициента r_S на очень слабую (0,00–0,19), слабую (0,20–0,39), среднюю (0,40–0,59), сильную (0,60–0,79) и очень сильную (0,80–1,0).

Результаты

Все протестированные гены ЭН встречались с высокой частотой среди изолятов K. pneumoniae, выделенных из биологического материала пациентов и медицинского оборудования кардиохирургического стационара (рис. 1, а). Распространённость генов qacE, qacEΔ1, oqxB и cepA, ассоциированных с устойчивостью к хлоргексидину и ЧАС, оказалась значительной и составила 62% (31/50), 54% (27/50), 84% (42/50) и 72% (36/50) соответственно. Гены oqxA и acrA были обнаружены у всех изолятов. Встречаемость K. pneumoniae, содержащих ген системы выброса ионов цинка (zitB), составила 96% (48/50). В целом в геномах K. pneumoniae было обнаружено 3–7 генов разных ЭН и транспортёров одновременно, причём в исследуемой выборке более половины культур имели 6 и более ЭН (58%, 29/50). Важно отметить, что изоляты с МЛУ содержали больше разных эффлюксных систем, чем чувствительные K. pneumoniae (p < 0,05, t-тест) (рис. 1, б).

 

Рис. 1. Распространённость K. pneumoniae, содержащих гены ЭН, с учётом источника выделения (а); количество детектированных генов ЭН среди МЛУ и не-МЛУ K. pneumoniae (б). *p < 0,05 (t-тест).

Fig. 1. The prevalence of K. pneumoniae isolates containing efflux pump genes by the source of isolation (a); the number of detected efflux pump genes among multidrug-resistant (MDR) and non-multidrug-resistant (non-MDR) K. pneumoniae (b). *p < 0,05 (t-test).

 

Детектировано 14 индивидуальных паттернов, среди которых комбинация всех исследуемых генов (qacE + qacEΔ1 + cepA + zitB + oqxA + oqxB + acrA) встречалась наиболее часто (32%, 16/50). Эти 16 культур были в 100% случаев с МЛУ, в частности устойчивы ко всем протестированным бета-лактамным антибиотикам и фторхинолонам. Каждая из последующих комбинаций встречалась с частотой менее 12% (табл. 2).

 

Таблица 2. Встречаемость индивидуальных комбинаций генов ЭН, ассоциированных с устойчивостью к биоцидам, среди изолятов K. pneumoniae

Table 2. The occurrence of individual combinations of efflux pump genes associated with biocide resistance among K. pneumoniae

Комбинации генов ЭН Efflux pump genes combinations	n (% от всех культур) (% of all isolates)
qacE + qacEΔ1 + cepA + zitB + oqxB + oqxA + acrA	16 (32)
cepA + zitB + oqxB + oqxA + acrA	6 (12)
cepA + zitB + oqxA + acrA	5 (10)
qacE + qacEΔ1 + zitB + oqxB + oqxA + acrA	5 (10)
qacE + cepA + zitB + oqxB + oqxA + acrA	4 (8)
zitB + oqxB + oqxA + acrA	3 (6)
qacE + zitB + oqxB + oqxA + acrA	3 (6)
qacEΔ1 + cepA + zitB + oqxB + oqxA + acrA	2 (4)
zitB + oqxA + acrA	1 (2)
qacE + qacEΔ1 + cepA + zitB + oqxA + acrA	1 (2)
qacE + qacEΔ1 + zitB + oqxA + acrA	1 (2)
qacE + qacEΔ1 + cepA + oqxB + oqxA + acrA	1 (2)
cepA + oqxB + oqxA + acrA	1 (2)
qacEΔ1 + zitB + oqxB + oqxA + acrA	1 (2)

 

В табл. 3 показана ассоциация между генами ЭН и транспортёров и фенотипом резистентности к антибиотикам K. pneumoniae. Гены qacE, qacEΔ1 были тесно связаны с устойчивостью к цефалоспоринам, карбапенемам и фторхинолонам, а oqxB — к цефалоспоринам. Важно отметить, что только K. pneumoniae с МЛУ кодировали qacE и qacEΔ1. Не выявлено значимых ассоциаций генов cepA и zitB с фенотипом устойчивости к антибиотикам.

 

Таблица 3. Ассоциация между резистентностью к антибиотикам и генами ЭН изолятов K. pneumoniae

Table 3. Association between antibiotic resistance and efflux pump genes of K. pneumoniae isolates

Антибиотик/группа Antibiotic/group	Профиль Profile	Количество изолятов K. pneumoniae, позитивных на гены ЭН, n (%) The number of K. pneumoniae positive for the efflux pump genes, n (%)
		qacEΔ1	qacE	cepA	oqxB	zitB
Ампициллин Ampicillin	R (n = 50)	27 (54)	31 (62)	36 (72)	42 (84)	48 (96)
	S (n = 0)	0	0	0	0	0
Цефалоспорины Cephalosporins	R (n = 45)	27 (60)*	31 (68,9)*	34 (75,6)	38 (84,4)	44 (97,8)
	S (n = 5)	0	0	2 (40)	4 (80)	4 (80)
Карбапенемы Carbapenems	R (n = 38)	27 (71,1)*	30 (78,9)*	29 (76,3)	35 (92,1)*	37 (97,4)
	S (n = 12)	0	1 (8,3)	7 (58,3)	7 (58,3)	11 (91,7)
Ампициллин/сульбактам Ampicillin/sulbactam	R (n = 45)	27 (60)*	31 (68,9)*	34 (75,6)	38 (84,4)	44 (97,8)
	S (n = 5)	0	0	2 (40)	4 (80)	4 (80)
Амоксициллин/клавуланат Amoxicillin/clavulanic acid	R (n = 42)	26 (61,9)*	29 (69,1)*	32 (76,2)	36 (85,7)	41 (97,6)
	S (n = 8)	1 (12,5)	2 (25)	4 (50)	6 (75)	7 (87,5)
Фторхинолоны Fluoroquinolones	R (n = 44)	27 (61,4)*	31 (70,5)*	33 (75)	38 (86,4)	43 (97,7)
	S (n = 6)	0	0	3 (50)	4 (66,7)	5 (83,3)
Гентамицин Gentamicin	R (n = 29)	20 (69)*	21 (72,4)	19 (65,5)	25 (86,2)	28 (96,6)
	S (n = 21)	7 (33,3)	10 (47,6)	17 (81)	17 (81)	20 (95,2)
Амикацин Amikacin	R (n = 23)	16 (69,6)	15 (65,2)	17 (73,9)	20 (87)	22 (95,7)
	S (n = 27)	11 (40,7)	16 (59,3)	19 (70,4)	22 (81,5)	26 (96,3)
Фенотип МЛУ MDR phenotype	МЛУ | MDR (n = 44)	27 (61,4)*	31 (70,5)*	33 (75)	38 (86,4)	43 (97,7)
	не-МЛУ non-MDR (n = 6)	0	0	3 (50)	4 (66,7)	5 (83,3)

Примечание. *p < 0,05 — разница между выборками статистически значима (F-тест).

Note. *p < 0,05 — difference between the samples is statistically significant (F-test).

 

С помощью корреляционного анализа выявлена позитивная связь между qacEΔ1 и генами бета-лактамаз: bla_OXA (r_S = 0,31), bla_VIM-2 (r_S = 0,68), bla_NDM-1 (r_S = 0,64), bla_CTX-M (r_S = 0,51), bla_SHV (r_S = 0,51). Эти же гены показали значимую связь с qacE (рис. 2). В нашем исследовании гены cepA и zitB не показали позитивных корреляций с генами устойчивости к антибиотикам. Интегроны класса 1 длиной от 800 п.н. до 2500 п.н. были выявлены у 32 (64%) изолятов. Плазмида группы несовместимости Q была обнаружена у 90% (45/50) K. pneumoniae. Корреляционный анализ показал значимую позитивную связь между генами насосов qacE, qacEΔ1 и интегронами (r_S = 0,70 и r_S = 0,65; рис. 2).

 

Рис. 2. Корреляционная матрица, отражающая силу связи между генами ЭН, генами бета-лактамаз и мобильными генетическими элементами. Цветовое значение каждой ячейки соответствует коэффициенту корреляции Спирмена и пропорционально силе корреляции. *p < 0,05, **p < 0,01. Цветной вариант рисунка см. на сайте журнала.

Fig. 2. A correlation matrix reflecting the strength of the relationship between the efflux pumps genes, beta-lactamase genes and mobile genetic elements. The color of each cell corresponds to the Spearman correlation coefficient and is proportional to the correlation strength. *p < 0.05, **p < 0.01. For a color version of the picture, see the journal’s website.

 

Обсуждение

K. pneumoniae — распространённый патоген, вызывающий инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи. МЛУ этих бактерий к антибиотикам первой линии существенно затрудняет лечение. К тому же широкое использование биоцидов (особенно в сублетальных концентрациях) может вызвать резистентность к ним и, как следствие, способствовать сохранению K. pneumoniae в окружающей среде, в том числе на поверхностях медицинских приборов. Сниженная чувствительность бактерий к ЧАС, хлоргексидину и солям цинка в высокой степени связана с экспрессией ЭН. Во многих исследованиях показана важность ЭН для повышения устойчивости штаммов K. pneumoniae и к различным классам антибиотиков [22–24]. Важно отметить, что гены устойчивости к противомикробным препаратам часто находятся на мобильных генетических элементах, которые могут передаваться путём горизонтального переноса от одного штамма к другому. В данной работе у наиболее значимого нозокомиального патогена — K. pneumoniae мы изучили распространённость ЭН, связанных с устойчивостью к ЧАС и хлоргексидину, транспортёров, ассоциированных со сниженной чувствительностью к солям цинка, а также их связь с резистентностью к антибиотикам, наличием генов бета-лактамаз и мобильными генетическими элементами.

Одним из механизмов устойчивости к биоцидам грамотрицательных бактерий является экспрессия эффлюксных систем семейства SMR, которые кодируются генами qacE и qacEΔ1 [25, 26]. С устойчивостью K. pneumoniae к хлоргексидину тесно связан cepA, кодирующий белки системы оттока катионов [27]. В выборочных исследованиях по изучению резистентности клинических штаммов K. pneumoniae к бензалкония хлориду ген qacΔE1 обнаруживался в диапазоне от 53,1 до 68,0% [28, 29]. Согласно А. Abuzaid и соавт., среди K. pneumoniae ген cepA встречался в 87,5% случаев [28]. В исследовании К.Г. Косяковой и соавт. частота встречаемости qacE, qacEΔ1 и cepA составила 33,3, 23,3 и 83,3% соответственно [25]. В нашем исследовании qacEΔ1 и qacE были распространены в группе нозокомиальных K. pneumoniae с более высокой частотой: 62 и 54% соответственно. Встречаемость cepA оказалась несколько ниже — 72%. В последнее время возрастает роль OqxA- и OqxB-насосов, входящих в семейство связывающе-транспортирующих белков [22]. Ранее J. Yuan и соавт. обнаружили гены oqxAB во всех исследованных штаммах K. pneumoniae, что позволило сделать предположение о геноме K. pneumoniae как возможном резервуаре oqxAB [32]. У клебсиелл в основном эти гены расположены в хромосоме, но могут находиться на плазмидах и часто ассоциированы с устойчивостью к фторхинолонам, тигециклину, а также ЧАС и бигуанидным дезинфицирующим средствам [30, 31]. Меньший процент встречаемости данных детерминант показали M. Dehnamaki и соавт.: 57 и 56% изолятов несли гены oqxA и oqxB соответственно [17]. В исследовании L. Ni и соавт. частоты обнаружения oqxA и oqxB составили 60,9 и 17,2% [24]. В нашем исследовании ген oqxA детектирован у всех изолятов кардиохирургического стационара, тогда как oqxB содержали 84% культур. ЭН AcrAB-TolC обеспечивает толерантность бактерий к различным антибиотикам, включая фторхинолоны, а также к биоцидам, включая этанол, хлоргексидина ацетат и бензалкония бромид [33]. Помимо вклада в фенотип МЛУ, AcrAB может представлять собой новый фактор вирулентности, необходимый K. pneumoniae для сопротивления иммунным защитным механизмам в лёгких, способствуя развитию пневмонии [34]. Ген acrA, кодирующий белок, соединяющий 2 интегральных мембранных белка, считается более консервативным, и его часто используют для обнаружения данного ЭН. В нашем исследовании все изоляты содержали acrA, тогда как, по данным W. Guo и соавт. [33], только 19% резистентных к карбапенемам K. pneumoniae включали данный ген. Важно отметить, что соли и наночастицы тяжёлых металлов активно используются в антисептических композициях. Сегодня ведётся активная разработка противомикробных поверхностных веществ на основе меди, серебра и цинка для создания бинарных или тройных контактно-нейтрализующих поверхностных покрытий [35]. Было доказано, что ZnO более токсичен для бактерий в форме наночастиц, что делает его более перспективным. В данной работе распространённость культур, кодирующих транспортёр, опосредующий отток ионов цинка [36], — ZitB, составила 96%.

В нескольких работах отмечается, что резистентность к антибиотикам и биоцидам может многократно увеличиваться за счёт одновременной экспрессии ЭН разных семейств [4, 19, 22]. Важно отметить, что в исследуемой выборке наиболее часто встречались K. pneumoniae с комбинацией всех исследуемых насосов (32%), причём такие культуры были в 100% случаев с МЛУ. Ранее мы показали высокую распространённость в изолятах кардиохирургического стационара bla_OXA, bla_VIM-2 и bla_NDM-1. В этом исследовании выявлено, что гены группы qac чаще встречались в ассоциации с генами, кодирующими устойчивость к карбапенемам, — bla_VIM-2 (r_S = 0,68) и bla_NDM-1 (r_S = 0,64), что может быть обусловлено их локализацией в плазмид-опосредованных интегронах класса 1 и требует дальнейшего изучения. В исследовании Y. Chen и соавт. также было показано, что гены qacEΔ1 и cepA были достоверно чаще представлены среди карбапенеморезистентных культур [16]. Глобальное распространение детерминант устойчивости к бета-лактамным антибиотикам, в том числе карбапенемам, является результатом их распространения посредством конъюгативных плазмид. Известны 5 групп несовместимости плазмид (Inc), которые описаны в литературе как потенциально ответственные за распространение генов bla_KPC и bla_NDM у изолятов K. pneumoniae [21]. Другие мобильные генетические элементы — интегроны — могут включать кассеты устойчивости к противомикробным препаратам и дезинфектантам [37]. По данным F. Firoozeh и соавт., 100% изолятов K. pneumoniae (n = 150) с МЛУ несли гены intI [38]. В исследовании É.M. Oliveira и соавт. у клинических изолятов K. pneumoniae в госпитале г. Ресифи (Бразилия) наиболее часто обнаруживались плазмиды групп несовместимости Q и FIB [21]. Данные, полученные W.M.B.S. Martins и соавт., свидетельствуют о том, что K. pneumoniae с высококопийной плазмидой IncQ, несущей bla_KPC-2, может эффективно передавать её путём конъюгативного переноса другим штаммам [39]. Плазмида IncQ, способная реплицироваться в широком круге хозяев, была обнаружена в клиническом изоляте K. pneumoniae, выделенном от пациентов с COVID-19 в России [40]. В нашем исследовании интегроны класса 1 были детектированы у 64% K. pneumoniae, а плазмиды IncQ — у 90%. При этом выявлена значимая позитивная связь между генами ЭН qacE, qacEΔ1 и интегронами.

Заключение

Проведено исследование по распространённости генов ЭН, а также транспортёров, участвующих в оттоке ионов металлов, оценена их связь с антибиотикоустойчивостью и генами, ассоциированными с резистентностью к бета-лактамам, среди культур K. pneumoniae с МЛУ, выделенных от пациентов кардиохирургического стационара с нозокомиальной инфекцией. Показана значимая связь между устойчивостью к антибиотикам и присутствием генов ЭН, ассоциированных с устойчивостью к ЧАС, хлоргексидину и ионам цинка, что подчёркивает важность дальнейшего изучения механизмов кросс-резистентности к биоцидам для совершенствования методов борьбы с патогенами с МЛУ.

Об авторах

Вероника Сергеевна Михайловская

Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН — филиал Пермского федерального исследовательского центра УрО РАН

Email: mar@iegm.ru
ORCID iD: 0000-0002-4264-8177

инженер лаб. молекулярной биотехнологии

Россия, Пермь

Полина Александровна Селиванова

Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН — филиал Пермского федерального исследовательского центра УрО РАН

Email: mar@iegm.ru
ORCID iD: 0009-0009-3718-8602

инженер лаб. молекулярной биотехнологии

Россия, Пермь

Марина Валентиновна Кузнецова

Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН — филиал Пермского федерального исследовательского центра УрО РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: mar@iegm.ru
ORCID iD: 0000-0003-2448-4823

д. м. н., в. н. с. лаб. молекулярной биотехнологии

Россия, Пермь

Список литературы

Дополнительные файлы