ЭПИДЕМИЧЕСКИЕ ВАРИАНТЫ НОРОВИРУСОВ ГЕНОТИПА GII.4 В НИЖНЕМ НОВГОРОДЕ В 2006 - 2012 ГГ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Генотипирование норовирусов, циркулировавших на территории Нижнего Новгорода в течение шести эпидсезонов (2006 - 2012 гг.), выявление доминирующих геновариантов и анализ их смены. Материалы и методы. Материалом для исследования служили образцы фекалий детей, госпитализированных в отделение кишечных инфекций одного из инфекционных стационаров Нижнего Новгорода. Норовирусы выявляли методом обратной транскрипции полимеразной цепной реакции. Генотипы и геноварианты норовирусов определяли путем анализа нуклеотидных последовательностей участков вирусного генома, кодирующих капсидный белок и РНК-зависимую РНК-полимеразу. Результаты. При обследовании 6589 детей с острой кишечной инфекцией в период с июля 2006 г. по июнь 2012 г. норовирусы обнаружены в 17,55% случаев. Для 114 изолятов норовирусов определены нуклеотидные последовательности участков генов капсидного белка и/или полимеразы. Генотипирование показало, что на территории Нижнего Новгорода циркулировали норовирусы восьми различных генотипов - GII.1, GII.2, GII.3, GII.4, GII.6, GII.7, GII.12, GII.13 при доминировании в течение всего периода наблюдения норовирусов GII.4. Установлена сходная с общемировой динамика смены эпидемических вариантов норовирусов генотипа GII.4, сопровождавшейся ростом частоты обнаружения норовирусов у детей, госпитализированных с острой кишечной инфекцией. Показана также кратковременная циркуляция весной 2008 г. норовируса субварианта GII.4 2006b-NN 2008 и распространение в эпидсезон 2009, 2010 гг. норовируса генотипа GII.12. Заключение. Полученные результаты свидетельствуют о необходимости мониторинга циркуляции норовирусов с целью раннего выявления новых вариантов вируса, которые могут обусловить рост заболеваемости норовирусной инфекцией.

Об авторах

Н. В Епифанова

Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии

Л. Б Луковникова

Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии

Н. А Новикова

Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии

О. В Парфенова

Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии

С. Г Фомина

Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии

Список литературы

  1. Боднев С.А. Молекулярно-эпидемиологическое исследование норовирусной инфекции у детей раннего возраста Новосибирска. Автореф. дис.канд. биол. наук, 2009.
  2. Буланова И. А. Титова Л. В., Самодова О. В. и др. Этиологическая структура вирусных диарей у детей в Архангельской области. Инфекционные болезни. 2008, 6 (1): 58-60.
  3. Епифанова Н.В., Новикова Н.А. Рекомбинантный норовирус GII.Pg_GII.12 у детей с острой кишечной инфекцией. Эпидемиология и гигиена. 2013, 12 (2): 22-26.
  4. Луковникова Л.Б., Епифанова Н.В., Новиков Д.В., Новикова Н.А. Генетическое разнообразие калицивирусов человека, обнаруженных у детей с гастроэнтеритом в Нижнем Новгороде. Вопросы вирусологии. 2009, 54 (6): 24-28.
  5. Подколзин А.Т., Мухина А.А., Шипулин Г.Г. и др. Изучение этиологии острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных в инфекционные отделения стационаров Москвы. Инфекционные болезни. 2004, 2 (4): 85-91.
  6. Bull R., Tu E., McIver C. et al. Emergence of a new norovirus genotype II.4 variant associated with global outbreaks of Gastroenteritis. J. Clin. Microbiol. 2006, 44 (2): 327-333.
  7. Hansen S., Stamm-Balderjahn S., Zuschneid I. et. al. Closure of medical departments during nosocomial outbreaks: data from a systematic analysis of the literature. J. Hosp. Infect. 2007, 65 (4): 348-353.
  8. Hoa Tran T.N., Trainor E., Nakagomi T. et. al. Molecular epidemiology of noroviruses associated with acute sporadic gastroenteritis in children: Global distribution of genogroups, genotypes and GII.4 variants. J. Clin. Virol. 2013, 56 (3): 269-277.
  9. Jiang X., Huang P.W, Zhong W. M. et al. Design and evaluation of a primer pair that detects both Norwalk- and Sapporo-like Caliciviruses by RT-PCR. J. Virol. Methods. 1999, 83 (1-2): 145-154.
  10. Kageyama T., Kojima S., Shinohara M. et al. Broadly reactive and highly sensitive assay for Norwalk-like viruses based on real-time quantitative reverse transcription-PCR. J. Clin. Microbiol. 2003, 41 (4): 1548-1557.
  11. Kapikian A.Z., Wyatt R.G., Dolin R. et. al. Visualization by immune electron microscopy of a 27-nm particle associated with acute infectious nonbacterial gastroenteritis. J. Virol. 1972, 10 (5): 1075-1081.
  12. Koopmans M. Progress in understanding Norovirus epidemiology. Curr. Opin. Infect. Dis. 2008, 21 (5): 544-552.
  13. Kroneman A., Vennema H., Deforche K. et al. An automated genotyping tool for enteroviruses and noroviruses. J. Clin. Virol. 2011, 51 (2): 121-125.
  14. Phan T.G., Kaneshi K., Ueda Y. et al. Genetic heterogeneity, evolution, and recombination in noroviruses. J. Med. Virol. 2007, 79 (9): 1388-1400.
  15. Siebenga J., Vennema H., Renchens B. et al. Epochal evolution of GGII.4 norovirus capsid proteins from 1995 to 2006. J. Virol. 2007, 81 (18): 9932-9941.
  16. Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011, 28 (10): 2731-2739.
  17. van Beek J., Kroneman A., Vennema H., Koopmans M. NoroNet report, April 2013. http:// www.rivm.nl/en/Topics/Topics/N/NoroNet.
  18. van Beek J., Ambert-Balay K., Botteldoorn N. et al. NoroNet. Indications for worldwide increased norovirus activity associated with emergence of a new variant of genotype II.4, late 2012. Euro Surveill. 2013, 18 (1): 8-9.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Епифанова Н.В., Луковникова Л.Б., Новикова Н.А., Парфенова О.В., Фомина С.Г., 2014

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах