МУЛЬТИЛОКУСНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ ТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ В РОССИИ В 2002 - 2012 ГГ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Характеристика современных штаммов C.diphtheriae, выделенных в России, с помощью мультилокусного секвенирования ДНК (MLST). Материалы и методы. Изучено 28 токсигенных штаммов C.diphtheriae, выделенных в России в 2002-2012 гг. и присланных в референс-центр по дифтерии и коклюшу МНИИЭМ им. Г.Н.Габричевского. Генотипирование штаммов С. diphtheriae с помощью MLST проводили на основе секвенирования фрагментов генов atpA, dnaE, dnaK , fusA, leuA, odhA и rpoB. Идентификацию аллелей и ST осуществляли согласно EMBL/GenBank и PubMLST, для кластерного анализа использовали eBurst подход. Результаты. С помощью MLST охарактеризованы современные токсигенные штаммы C.diphtheriae, выделенные в России в 2002-2012 гг. Идентифицировано 8 генотипов (ST41, ST5, ST8, ST28, ST25, ST44, ST-new1 и ST-new2), доминирующими среди которых были три - ST8, ST28 и ST-new1. Большинство токсигенных штаммов принадлежат к биовару gravis и ST8. Среди штаммов биовара mitis отмечается большая гетерогенность по принадлежности к ST, но с преимущественным преобладанием штаммов ST28. Заключение. Использование MLST позволило охарактеризовать современную циркулирующую популяцию токсигенных штаммов C.diphtheriae, выделенных в России, и показало перспективность применения этого метода для характеристики популяции возбудителя дифтерии и выявления эпидемически значимых штаммов, а также сопоставления их с генетической структурой зарубежных штаммов.

Об авторах

О. Ю Борисова

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского

И. К Мазурова

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского

И. А Чагина

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского

А. С Пименова

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского

Е. Е Донских

Российский научно-исследовательский медицинский университет им. Н.И.Пирогова, Москва

В. А Алешкин

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского

Список литературы

  1. Комбарова С.Ю., Мазурова И.К., Мельников В.Г. и др. Генетическая структура штаммов Corynebacterium diphtheriae, выделенных в России при разной интенсивности эпидемического процесса дифтерии. Журн. микробиол. 2001, 3: 3-8.
  2. Комбарова С.Ю. Микробиологический молекулярно-генетический мониторинг возбудителя дифтерийной инфекции. Автореф. дис. д-ра биол. наук, 2007.
  3. Комбарова С.Ю., Борисова О.Ю., Мельников В.Г. и др. Наблюдение за циркуляцией штаммов C.diphtheriae, различающихся по признаку токсигенности. Медицинский альманах. 2009, 2 (7): 108-111.
  4. Мазурова И.К. Комплексная система лабораторной диагностики и наблюдения за возбудителем дифтерии. Автореф. дисс. д-ра мед. наук, 1993.
  5. Мазурова И.К., Комбарова С.Ю., Борисова О.Ю. и др. Мониторинг возбудителя дифтерийной инфекции. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2009, 3 (46): 17-22.
  6. Максимова Н.М., Маркина С.С., Яцковский К.А. и др. Развитие эпидемического процесса дифтерии в России в условиях высокого уровня специфического иммунитета. Медицинский альманах. 2009, 2 (7): 105-108.
  7. Максимова Н.М., Маркина С.С., Яцковский К.А. и др. Дифтерия в России в 2005-2009 годах. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2010, 3 (52): 31-36.
  8. Мазурова И.К., Мельников В.Г., Комбарова С.Ю. и др. Методические указания. МУ 4.2.698-98 «Лабораторная диагностика дифтерийной инфекции». М., Интэрсэн, 1998.
  9. Bolt F., Cassiday P., Tondella M. et al. Multilocus sequence typing identifies evidence for recombination and two distinct lineages of C.diphtheriae. J. Clin. Microbiol. 2010, 48 (11): 4177-4185.
  10. Grimont F., Grimont P. Ribosomal ribonucleic acid gene restriction patterns as potential taxonomic tools. Ann. Inst. Pasteur Microbiol. 1986, 137 В (2): 165-175.
  11. Grimont P., Grimont F., Efstraiou A. et al. International nomenclature for C.diphtheriae ri-botypes.Res. Microbiol. 2004, 153 (3): 162-166.
  12. Fafour E., Badell E., Zasada A. et al. Characterization and comparison of invasive C.diphtheriae isolates from France and Poland. J. Clin. Microbiol. 2012, 50 (1): 173-175.
  13. Maiden M., Bygraves J., Feil E. et al. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms. Proc. Natl. Acad. Sci. 1998, 95 (6): 3140-3145.
  14. Viguetti S., Pacheco L., Santos L. et al. Multilocus sequence types of invasive C. diphtheria isolated in the Rio de Janeiro urban area. Brazil. J. Epidemiol. Infect. 2011, 53:1-4.
  15. Zakikhany K., Efstratiou A. Diphtheria in Europe: current problems and new challenges. Future Microbiol. 2012, 7 (5): 595-607.
  16. Wagner K., White J., Lucenko I. et al. Diphtheria in postepidemic period, Europe, 2000-2009. J. Emerg. Infect. Dis. 2012, 18 (2): 217-225.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Борисова О.Ю., Мазурова И.К., Чагина И.А., Пименова А.С., Донских Е.Е., Алешкин В.А., 2013

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах