Отправить статью по E-mail ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДА МУЛЬТИПЛЕКСНОЙ ПЦР-РВ ДЛЯ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ДИАГ-НОСТИКИ КИШЕЧНЫХ ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ
- Авторы: Марова АА1, Оксанич АС1, Каира АН1, Мескина ЕР2, Медведева ЕА2, Иванова ОЕ3, Лукашев АН3, Кюрегян КК3, Калинкина МА4, Егорова ОВ4, Зверев ВВ1, Файзулоев ЕБ1, Marova AA5, Oksanich AS5, Kaira AN5, Meskina ER5, Medvedeva EA5, Ivanova OE5, Lukashev AN5, Kyuregyan KK5, Kalinkina MA5, Egorova OV5, Zverev VV5, Faizuloev EB5
-
Учреждения:
- НИИ вакцин и сывороток им. И.И.Мечникова
- Московский областной научно-исследовательский клинический интитут им. М.Ф.Владимирского, Москва
- Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им.М.П.Чумакова, Московская область
- ИТЦ Биологически активные соединения и их применение, Москва
- Выпуск: Том 89, № 6 (2012)
- Страницы: 39-45
- Раздел: Статьи
- URL: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13711
- ID: 13711
Цитировать
Полный текст
Аннотация
дифференциального выявления в различных биологических образцах 11 групп кишечных вирусов:
аденовирусов, энтеровирусов, полиовирусов, вирусов гепатитов А и Е, ротавирусов групп А и С,
ортореовирусов, норовирусов, саповирусов и астровирусов. Материалы и методы. Для оценки чувствительности выявления кишечных вирусов использовали панели изолятов вирусов и клинических
образцов, охарактеризованные референтными методами. Из исследуемых образцов выделяли нуклеиновые кислоты и проводили мультиплексную реакцию ОТ и ПЦР-РВ. Результаты.
Чувствительность лабораторного набора реагентов (ЛНР) при сравнении с результатами референтных методов составила 100% для ротавируса А, аденовирусов, энтеровирусов и норовирусов, 88,9%
для вируса гепатита Е и 92,3% для вируса гепатита А, а диагностическая специфичность - 99,4%.
При анализе 697 клинических образцов от больных с симптомами острой кишечной инфекции
нуклеиновые кислоты различных кишечных вирусов были выявлены в 71,7%. Заключение. Показано,
что метод мультиплексной ОТ ПЦР-РВ является эффективным методом этиологической диагностики кишечных вирусных инфекций. Было продемонстрировано, что с помощью ЛНР этиологию
кишечных заболеваний можно установить в 63 - 72%, а у детей с водянистой диареей - примерно
в 90% случаев.
Ключевые слова
Об авторах
А А Марова
НИИ вакцин и сывороток им. И.И.МечниковаНИИ вакцин и сывороток им. И.И.Мечникова
А С Оксанич
НИИ вакцин и сывороток им. И.И.МечниковаНИИ вакцин и сывороток им. И.И.Мечникова
А Н Каира
НИИ вакцин и сывороток им. И.И.МечниковаНИИ вакцин и сывороток им. И.И.Мечникова
Е Р Мескина
Московский областной научно-исследовательский клинический интитут им. М.Ф.Владимирского, МоскваМосковский областной научно-исследовательский клинический интитут им. М.Ф.Владимирского, Москва
Е А Медведева
Московский областной научно-исследовательский клинический интитут им. М.Ф.Владимирского, МоскваМосковский областной научно-исследовательский клинический интитут им. М.Ф.Владимирского, Москва
О Е Иванова
Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им.М.П.Чумакова, Московская областьИнститут полиомиелита и вирусных энцефалитов им.М.П.Чумакова, Московская область
А Н Лукашев
Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им.М.П.Чумакова, Московская областьИнститут полиомиелита и вирусных энцефалитов им.М.П.Чумакова, Московская область
К К Кюрегян
Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им.М.П.Чумакова, Московская областьИнститут полиомиелита и вирусных энцефалитов им.М.П.Чумакова, Московская область
М А Калинкина
ИТЦ Биологически активные соединения и их применение, МоскваИТЦ Биологически активные соединения и их применение, Москва
О В Егорова
ИТЦ Биологически активные соединения и их применение, МоскваИТЦ Биологически активные соединения и их применение, Москва
В В Зверев
НИИ вакцин и сывороток им. И.И.МечниковаНИИ вакцин и сывороток им. И.И.Мечникова
Е Б Файзулоев
НИИ вакцин и сывороток им. И.И.МечниковаНИИ вакцин и сывороток им. И.И.Мечникова
A A Marova
A S Oksanich
A N Kaira
E R Meskina
E A Medvedeva
O E Ivanova
A N Lukashev
K K Kyuregyan
M A Kalinkina
O V Egorova
V V Zverev
E B Faizuloev
Список литературы
- Оксанич А.С., Файзулоев Е.Б., Никонова А.А. и др. Мультиплексная ПЦР в режиме реального времени для быстрого выявления энтеровирусов, аденовирусов, вируса гепатита А в клинических образцах. Журн. микробиол. 2007, 5: 65-70.
- Ребриков Д.В. ПЦР в реальном времени, М., БИНОМ. 2009.
- Casas I., Avellon A., Mosquera M. et al. Molecular identification of adenoviruses in clinical samples by analyzing a partial hexon genomic region. J. Clin. Microbiol. 2005, 43 (12): 6176-6182.
- Hodges K., Gill R. Infectious diarrhea: Cellular and molecular mechanisms. Gut Microbes. 2010, 1 (1): 4-21.
- Knipe D.M., Howley P.M. Fields virology. Lippincott Williams and Wilkins, 2007.
- Nasri D., Bouslama L., Omar S. et al. Typing of human enterovirus by partial sequencing of VP2. J. Clin. Microbiol. 2007, 45 (8): 2370-2379.
- Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. J. Clin. Microbiol. 2006, 44 (8): 2698-2704.
- Oberste M.S., Maher K., Kilpatrick D.R. et al. Typing of human enteroviruses by partial sequencing of VP1. J. Clin. Microbiol. 1999, 37 (5): 1288- 1293.
- Okoh A.I., Sibanda T., Gusha S.S. Inadequately treated wastewater as a source of human enteric viruses in the environment. Int. J. Environ. Res. Public. Health. 2010, 7 (6): 2620-2637.
- Petri W.A., Miller M., Binder H.J. et al. Enteric infections, diarrhea, and their impact on function and development. J. Clin. Invest. 2008, 118 (4): 1277-1290.
- Podkolzin A.T., Fenske E.B., Abramycheva N.Y. et al. Hospital-based surveillance of rotavirus and other viral agents of diarrhea in children and adults in Russia, 2005-2007. J. Infect. Dis. 2009, 200 (11): 228-233.
- Ramani S., Kang G. Viruses causing childhood diarrhea in the developing world. Curr. Opin. Infect. Dis. 2009, 22 (5): 477-482.
- Witso E., Palacios G., Cinek O. et al. High prevalence of human enterovirus a infections in natural circulation of human enteroviruses. J. Clin. Microbiol. 2006, 44 (11): 4095-4100.
- Yoshida T., Kasuo S., Azegami Y. et al. Characterization of sapoviruses detected in gastroenteritis outbreaks and identification of asymptomatic adults with high viral load. J. Clin. Virol. 2009, 45 (1): 67-71.
Дополнительные файлы
