ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДЕТЕРМИНАНТ Pks-ОСТРОВА ПАТОГЕННОСТИ У КЛИНИЧЕСКИХ ШТАММОВ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Определение c помощью ПЦР частоты встречаемости генов clbB, clbN, clbA и clbQ Рks-острова патогенности у клинических штаммов энтеробактерий. Материалы и методы. Исследовано 112 штаммов различных родов энтеробактерий, включая 16 музейных и 96 клинических изолятов. Изоляты были представлены Escherichia spp. (n=68), Klebsiella (n=16), Enterobacter (n=9), Serratia (n=7) и другими минорными видами семейства Enterobacteriacae (n=12). 59 штаммов изолированы из мочи при уроинфекции, 26 - из кишечника пациентов с дисбиозами и 11 - от детей с осложнениями после трнсплантации печени. Наличие у бактерий генов clbB, clbN, clbA и clbQ определяли c помощью мультиплексной ПЦР. Результаты. Среди 41 уропатогенных E.coli выявлено 15 (36,6%) Pks-положительных штаммов, несущих 4 clb-гена, что составило 27,1% от общего числа энтеробактерий, выделенных из мочи. Среди 44 клинических изолятов других видов энтеробактерий выявлен только один Pks-позитивный штамм K.рneumoniae. Энтеробактерии, изолированные при гнойно-воспалительных осложнениях после трансплантации печени (n=11) и выделенные из кишечного содержимого при дисбиозах (n=26), были Pks-негативными. Заключение. Гены clbB, clbN, clbA и clbQ Pks-острова, обнаруженные у 36,6% урологических штаммов E.coli, являются маркерами патогенности клинических изолятов внекишечного происхождения и указывают на целесообразность их выявления с помощью ПЦР.

Об авторах

С. В Фиалкина

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи, Москва

В. М Бондаренко

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи, Москва

Ю. Л Набока

Ростовский государственный медицинский университет, Ростов-на-Дону

Е. А Мирошниченко

Ростовский государственный медицинский университет, Ростов-на-Дону

Список литературы

  1. Бондаренко В.М. Генетические маркеры вирулентности условно патогенных бактерий. Журн. микробиол. 2011, 3: 95-100.
  2. Бондаренко В.М., Фиалкина С.В., Лысенко Т.И. и др. Генетические детерминанты патогенности E.coli, изолированных из мочи и фекалий детей с различными клиническими вариантами инфекции мочевой системы. Журн. микробиол. 2004, 4: 3-7.
  3. Набока Ю.Л., Коган М.И., Васильева Л.И. и др. Бактериальная микст-инфекция у женщин с хроническим рецидивирующим циститом. Журн.микробиол. 2011, 1: 8-12.
  4. Ahmed N., Dobrindt U., Hacker J. et al. Genomic fluidity and pathogenic bacteria: applications in diagnostics, epidemiology, and intervention. Nat. Rev. Microbiol. 2008; 6: 387-394.
  5. Boyd E.F., Almagro-Moreno S., Parent M.A. Genomic islands are dynamic, ancient integrative elements in bacterial evolution. Trends Microbiol. 2009, 17: 47-53.
  6. Bronowski C., Smith S.L., Yokota K. et al. A subset of mucosa-associated Escherichia coli isolates from patients with colon cancer, but not Crohn’s disease, share pathogenicity islands with urinary pathogenic E. coli. Microbiology. 2008, 154: 571-583.
  7. Cuevas-Ramos G., Petit C.R., Marcq I. et al. Escherichia coli induces DNA damage in vivo and triggers genomic instability in mammalian cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010, 107 (25): 11537-11542.
  8. Dobrindt U., Hochhut B., Hentschel U. et al. Genomic islands in pathogenic and environmental microorganisms. Nat. Rev. Microbiol. 2004, 2: 414-424.
  9. Grozdanov L., Raasch C., Schulze J. et al. Analysis of the genome structure of the nonpathogenic probiotic Escherichia coli strain Nissle 1917. J. Bacteriol. 2004, 186: 5432-5441.
  10. Hacker J., Blum-Oehler G., Muhldorfer I. et al. Pathogenicity islands of virulent bacteria: structure, function and impact on microbial evolution. Mol.Microbiol.1997, 23: 1089-1097.
  11. Homburg S., Oswald E., Hacker J. et al. Expression analysis of the colibactin gene cluster coding for a novel polyketide in Escherichia coli. FEMS Microbiol. Lett. 2007, 275 (2): 255-262.
  12. Johnson J.R., Johnston B., Kuskowski M.A. et al., Molecular epidemiology and phylogenetic distribution of the Escherichia coli pks genomic island. Clin Microbiol. 2008, 46 (12): 3906-3911.
  13. Le Gall T., Clermont O., Gouriou S. et al. Extraintestinal virulence is a coincidental byproduct of commensalism in B2 phylogenetic group Escherichia coli strains. Mol. Biol. Evol. 2007. 24: 2373-2384.
  14. Lloyd A.L., Smith S.N., Eaton A.K. Genomic islands of uropathogenic E.coli contribute to virulence. J. Bacteriol. 2009, 191 (11): 3469-3481.
  15. Nougayrede J.P., Homburg S., Taieb F. et al. Escherichia coli induces double-strand breaks in eukaryotic cells. Science. 2006, 313: 848-851.
  16. Putze J., Hennequin C., Nougayrède J.P. et al. Genetic structure and distribution of the colibactin genomic island among members of the family Enterobacteriaceae. Infect. Immun. 2009, 77 (11): 4696-4703.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Фиалкина С.В., Бондаренко В.М., Набока Ю.Л., Мирошниченко Е.А., 2011

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах