ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ ВИРУСА ЛИХОРАДКИ ЗАПАДНОГО НИЛА, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ЮГЕ РОССИИ, КАК МЕТОД ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО РАССЛЕДОВАНИЯ: ПРИНЦИПЫ И РЕЗУЛЬТАТЫ

Цель. Характеристика штаммов вируса лихорадки Западного Нила (ВЗН), циркулировавших на юге России в 1999—2010 гг. Материалы и методы. Амплификация РНК ВЗН непосредственно из клинического материала, комаров и тканей птиц с помощью ПЦР; прямое секвенирование нуклеотидных последовательностей и их сравнительный анализ. Результаты. Во время вспышек лихорадки Западного Нила (ЛЗН) в 1999 г. и в 2000—2003 гг. в Волгоградской и Астраханской областях циркулировали родственные, но различающиеся геноварианты ВЗН субгенотипа 1а — волгоградский и астраханский. В 2005 г. волгоградский геновариант ВЗН был занесен и на территорию Астраханской области, вызвав наряду с астраханским новый подъем заболеваемости. В 2004 г. в крови 2 больных ЛЗН из Ростовской области была найдена РНК ВЗН генотипа 2; это был первый клинический случай ЛЗН, вызванный ВЗН генотипа 2, за пределами Африки. Вспышка ЛЗН в 2007 г. в Волгоградской области была вызвана именно этим уникальным геновариантом ВЗН, который можно предварительно назвать российским. Наконец, во время крупной вспышки ЛЗН в 2010 г. в Волгоградской и Ростовской областях в клиническом материале вновь обнаруживали только РНК ВЗН генотипа 2 российского геноварианта. Заключение. После заноса ВЗН определенного геноварианта он способен в течение нескольких лет сохраняться в природных очагах на юге России. Возможно также исчезновение одного клона ВЗН с заменой или вытеснением его другим. Определение генетических характеристик циркулирующих в России штаммов ВЗН — важный элемент эпидемиологического надзора за ЛЗН и борьбы с этим заболеванием.

вирус лихорадки Западного Нила, генотипы, циркуляция, эпидемиологический надзор