ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА sak0192 STREPTOCOCCUS AGALACTIAE В КАЧЕСТВЕ МОЛЕКУЛЯРНОЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО МАРКЕРА
- Авторы: Рождественская А.С1, Bhide M.2, I.Mikula J.2, Mikula I.2, Дмитриев А.В1
-
Учреждения:
- НИИ экспериментальной медицины, СанктПетербург
- Университет ветеринарной медицины, Кошице, Словакия
- Выпуск: Том 86, № 5 (2009)
- Страницы: 38-43
- Раздел: Статьи
- Дата подачи: 09.06.2023
- Дата публикации: 15.10.2009
- URL: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13293
- ID: 13293
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Цель. Изучение структуры гена sak0192 у штаммов Streptococcus agalactiae, выделенных от животных, и оценка возможности ее использования в качестве молекулярно-эпидемиологического маркера. Материалы и методы. Использовано 114 штаммов S.agalactiae, выделенных из коровьего молока. Наличие гена sak0192 и генов патогенности bac, bca, scpB определяли методом ПЦР. Аллели гена sak0192 идентифицировали методом SSCP, а их нуклеотидные последовательности определяли секвенированием. Результаты. У штаммов S.agalactiae в гене sak0192 выявлены прямые повторы и спейсеры, а также обнаружена гетерогенность нуклеотидной последовательности гена. Среди 114 штаммов обнаружено 8 различных аллелей гена sak0192, пять из которых оказались характерными только для штаммов, выделенных от животных. Комплексный анализ аллели гена sak0192 и наличия генов bac, bca и scpB выявил 16 различных генетических вариантов, лишь 3 из которых оказались характерны для штаммов, выделенных от животных и от человека. Заключение. Полиморфизм гена sak0192 может быть использован для диагностики и дифференциации штаммов S.agalactiae, а в сочетании с комбинацией генов патогенности bac, bca и scpB — для выявления эпидемически значимых клонов — возбудителей заболеваний человека и животных.
Ключевые слова
Полный текст
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА sak0192 STREPTOCOCCUS AGALACTIAE В КАЧЕСТВЕ МОЛЕКУЛЯРНОЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО МАРКЕРА×
Об авторах
А. С Рождественская
НИИ экспериментальной медицины, СанктПетербург
M. Bhide
Университет ветеринарной медицины, Кошице, Словакия
Jr. I.Mikula
Университет ветеринарной медицины, Кошице, Словакия
I. Mikula
Университет ветеринарной медицины, Кошице, Словакия
А. В Дмитриев
НИИ экспериментальной медицины, СанктПетербург
Список литературы
- Дмитриев А.В., Шен А.Д., Тотолян А.А. Ген sak0192 Streptococcus agalactiae содержит прямые повторы и спейсеры — генетические маркеры для характеристики штаммов. Мол. ген. микробиол. вирусол. 2007, 4: 37-41.
- Bassam B.J., Caetano-Anollés G., Gresshoff P.M. Fast and sensitive silver staining of DNA in polyacrylamide gels. Anal. Biochem. 1991, 196: 80-83.
- Bohnsack J.F., Whiting. A., Gottschalk M. et al. The population structure of invasive and colonizing strains of Streptococcus agalactiae from neonates of six U.S. academic centers from 1995 to 1999. J. Clin. Microbiol. 2008, 46: 1285-1291.
- Dmitriev A., Shakleina E., Tkacikova L. et al. Genetic heterogeneity of the pathogenic potentials of human and bovine group B streptococci. Folia Microbiol. 2002, 47: 291-295.
- Dmitriev.A., Tkacikova L., Suvorov A. et al. Comparative genetic study of group B streptococcal strains of human and bovine origin. Ibid. 1999, 44: 449-453.
- Dmitriev A., Totolian A., Tkacikova L. et al. Features of the genome structure of group B streptococci of bovine origin. Folia Veterinaria. 2001, 45: 57-63.
- Duarte R.S., Bellei B.C., Miranda O.P. et al. Distribution of antimicrobial resistance and virulence-related genes among Brazilian group B streptococci recovered from bovine and human sources. Antimicrob. Agents Chemother. 2005, 49: 97-103.
- Hery-Arnaud G., Bruant G., Lanotte P. et al. Mobile genetic elements provide evidence for a bovine origin of clonal complex 17 of Streptococcus agalactiae. Appl. Environ. Microbiol. 2007, 73: 4668-4672.
- Jensen N.E., Aarestrup F.M. Epidemiological aspects of group B streptococci of bovine and human origin. Epidemiol. Infect. 1996, 117: 417-422.
- Keefe G.P. Can. Streptococcus agalactiae mastitis: a review. Vet. J. 1997, 38: 429-437.
- Luan S., Granlund M., Sellin M. et al. Multilocus sequence typing of Swedish invasive group B Streptococcus isolates indicates a neonatally associated genetic lineage and capsule switching. J. Clin. Microbiol. 2005, 43: 3727-3733.
- Martinez G., Harel J., Higgins R. et al. Characterization of Streptococcus agalactiae isolates of bovine and human origin by randomly amplified polymorphic DNA analysis. Ibid. 2000, 38: 71-78.
- Regan J.A., Klebanoff M.A., Nugent R.P. et al. VIP Study Group. Colonization with group B streptococci in pregnancy adverse outcome. Am. J. Obstet. Gynecol. 1996, 174: 1354-1360.
- Shakleina E., Dmitriev A., Tkacikova L. et al. Presence of IS elements in group B streptococci of bovine origin. Ind. J. Med. Red. 2004, 119 (suppl.): 242-246.
- Tettelin H., Masignani V., Cieslewicz M.J. et al. Genome analysis of multiple pathogenic isolates of Streptococcus agalactiae: implications for the microbial «pan-genome». Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005, 102: 13950-13955.