ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВИРУСОВ ГРИППА A/H3N2 И В, ЦИРКУЛИРОВАВШИХ В РОССИИ В 2013 - 2015 ГГ

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Установить генетическую характеристику, провести филогенетический анализ и определение молекулярных маркеров резистентности к этиотропным препаратам вирусов гриппа A/H3N2 и В, циркулировавших в России в 2013 - 2015 гг. Материалы и методы. Исследованы 80 биологических образцов, содержащих РНК вируса гриппа A/H3N2, и 31 образец, содержащий РНК вируса гриппа В. Секвенирование фрагментов ПЦР выполнялось на ABI-3100 PRIZM™ GeneticAnalyzer (AppliedBiosystems, США) и с использованием MiSeq (Illumina, США). Обработка и анализ данных проводились с помощью программ CLC v.3.6.5., DNASTAR и BioNumerics v.6.5. Результаты. В 2013 - 2014 гг. доминировали вирусы гриппа A/H3N2 клайда ЗС.З, подобные вакцинному штамму A/Texas/50/2012, 10% принадлежали к субклайду ЗС.2а и 10% - к ЗС.ЗЬ. Подавляющее большинство (81%) вирусов 2014 - 2015 гг. вошли в клайд ЗС.2а, доля вирусов, относящихся к ЗС.ЗЬ и ЗС.За, составляла 9% и 10%. Среди исследованных вирусов гриппа В превалировали Ямагата-подобные, лишь 1 вирус в 2014 - 2015 гг. относился к линии Виктория, обнаружен 1 реассортант линий Ямагата и Виктория. Во всех вирусах гриппа A/H3N2 выявлена мутация устойчивости к ремантадину S31N (белок М2). Мутации, определяющие устойчивость к озельтамивиру (ген NA), вирусов гриппа A/H3N2 и В обнаружены не были. Заключение. Подъем заболеваемости гриппом в 2014 - 2015 гг. обусловлен появлением вирусов гриппа A/H3N2 и В, отличающихся по антигенному составу от циркулировавших ранее и от вошедших в вакцину, что привело к решению ВОЗ заменить компоненты A/H3N2 и В вакцины 2015 -- 2016 гг. Одновременная циркуляция двух линий вируса гриппа В и появление их реассортантов свидетельствует о целесообразности применения четырехвалентной вакцины, включающей обе линии.

Об авторах

С. Б. Яцышина

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии

Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
Россия

А. Н. Рентеева

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии

Email: noemail@neicon.ru
Россия

А. В. Валдохина

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии

Email: noemail@neicon.ru
Россия

М. А. Елькина

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии

Email: noemail@neicon.ru
Россия

А. С. Сперанская

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Е. В. Пимкина

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Р. Р. Минтаев

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии

Email: noemail@neicon.ru
Россия

М. Л. Маркелов

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии

Email: noemail@neicon.ru
Россия

В. В. Малеев

Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Список литературы

  1. База данных GISAID EpiFluTM. Электронный ресурс http://flusurver.bii.a-star.edu.sg/ MUTATI ON S/H 3N 2_Human_2013_Switzerland9715293/НА_ 13 8_stat.html.
  2. База данных GISAID EpiFluTM. Электронный ресурс http://flusurver.bii.a-star.edu.sg/ MUTATIONS/H3N2_Human_2013_Switzerland9715293/HA_154_stat.html
  3. Данные НИИ гриппа. Эпидемиологическая ситуация. Лабораторная диагностика гриппа и ОРВИ, http://www.influenza.spb.ru/system/epidemiological_situation/laboratory_ diagnostics/?year=2015&week=22.
  4. Письмо Роспотребнадзора от 30.06.2014 № 01/7281-14-32. Об итогах эпидсезона по гриппу и ОРВИ 2013/2014. http://rospotrebnadzor.ru/upload/iblock/088/pismo-po-itogam-sezona-gripp.pdf.
  5. Письмо Роспотребнадзора от 28.07.2015 № 1042. Об итогах эпидсезона по гриппу и ОРВИ 2014/2015гг и задачах на предстоящий эпидсезон 2015/2016 гг, www.stupenil5. edusite.ru/DswMedia/itogigripp-2015.doc.
  6. Ambrose C.S., Levin MJ. Therationale for quadrivalent influenza vaccines. Hum. Vaccin. Immunother. 2012, 8 (1): 81-88.
  7. Busch M.G., Bateman A.C., Landolt G.A. et al. Identification of amino acids in the HA of H3 influenza viruses that determine infectivity levels in primary swine respiratory epithelial cells. Virus Res. 2008, 133 (2): 269-279.
  8. Chen J.M., Guo Y.J., Wu K.Y. et al. Exploration of the emergence of the Victoria lineage of influenza В virus. Arch. Virol. 2007, 152 (2): 415-422.
  9. Chen R., Holmes E.C. The evolutionary dynamics of human influenza В virus. J. Mol. Evol. 2008, 66 (6): 655-663.
  10. CockbumW.C., Delon P.J., Ferreira W. Origin and progress of the 1968-69 Hong Kong influenza epidemic. Bull. World Health Organ. 1969, 41 (3): 345-348.
  11. ECDC European Centre. Influenza virus characterization summary Europe, July 2012. http:// ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/CNRL-July-2012.pdf.
  12. ECDC European Centre. Influenza virus characterization summary Europe, July 2015. http:// ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/influenza-virus-characterisation-july-2015. pdf.
  13. Koel B.F., Burke D.F., Bestebroer T.M. et al. Substitutions near the receptor binding site determine major antigenic change during influenza virus evolution. Science. 2013, 342 (6161): 976-979.
  14. Lee М-S., Chen J. S-E. Predicting antigenic variants of influenza A/H3N2 viruses. Emerg. Infect. Dis. 2004, 10 (8): 1385-1390.
  15. Morbidity and Mortality Weekly Report. CDC Centers, USA. http://www.cdc.gov/mmwr.
  16. Review of the 2012-2013 winter influenza season, northern hemisphere. Weekly Epidemiol. Rec. 2013,88 (22): 225-232.
  17. Rota P.A., Wallis T.R., Harmon M.W. et al. Cocirculation of two distinct evolutionary lineages of influenza type В virus since 1983. Virology. 1990, 175 (1): 59-68.
  18. Smith D.J., Lapedes A.S., de Jong J.C. et al. Mapping the antigenic and genetic evolution of influenza virus. Science. 2004, 305 (5682): 371-376.
  19. Wang Q., Tian X., ChenX., Ma J. Structural basis for receptor specificity of influenza В virus hemagglutinin. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2007, 104 (43): 16874-16879.
  20. WHO Influenza Centre, London. Recommended composition of influenza virus vaccines for use in the 2013-14 (2014-15) (2015-16) northern hemisphere influenza season. http://www. who.int/influenza/vaccines/virus/recommendations/2013_ 14_north/en/ (2014_ 15), (201516).
  21. WHO Influenza Centre, London. Report prepared for the WHO annual consultation on the composition of influenza vaccine forthe Northern Hemisphere 2015/16.23rd -25th February 2015.
  22. WHO Influenza Centre, St Petersburg, Russia. Digest of Influenza Surveillance in Russia, Seasons 2009-2013. http://www.influenza.spb.ru/files/rii-digest-2013.pdf.
  23. WHO. Summary of neuraminidase amino acid substitutions associated with reduced inhibition by neuraminidase inhibitors, http://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory/antiviral_sus-ceptibility/avwg2014_nai_substitution_table.pdf.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Яцышина С.Б., Рентеева А.Н., Валдохина А.В., Елькина М.А., Сперанская А.С., Пимкина Е.В., Минтаев Р.Р., Маркелов М.Л., Малеев В.В., 2016

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах