СОСТАВ ПОПУЛЯЦИИ ШТАММОВ ВОЗБУДИТЕЛЯ ДИФТЕРИИ, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В РОССИИ

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Характеристика клонального состава популяции штаммов Corynebacterium diphtheriae в России с помощью MLST, а также оценка возможности использования этого метода при проведении мониторинга штаммов возбудителя дифтерийной инфекции. Материалы и методы. Изучены штаммы C.diphtheriae, выделенные в России в 1957 - 2015 гг. и присланные в референс-центр по дифтерии и коклюшу МНИИЭМ им. Г.Н.Габрического. Генотипирование С. diphtheriae с помощью MLST проводили на основе секвенирования фрагментов генов «домашнего хозяйства». Идентификацию ST осуществляли согласно PubMLST. Результаты. На территории России идентифицированы штаммы С. diphtheriae 36 сиквенс-типов (ST) - 27 ранее известных и 9 новых, выявленных нами впервые. Доминирующими были 2 сиквенс-типа ST25 и ST8 (22% и 18%). Показана взаимосвязь между фенотипическими свойствами (токсигенность и биовар) и принадлежностью штаммов C.diphtheriae к определенному сиквенс-типу - токсигенные и нетоксигенные штаммы C.diphtheriae различных биоваров характеризовались определенными сиквенс-типами. Показаны изменения клонального состава популяции C.diphtheriae в динамике эпидемического процесса дифтерийной инфекции. Заключение. Использование МЛСТ позволило охарактеризовать клональный состав популяции штаммов C.diphtheriae в России и показало перспективность применения этого метода для характеристики популяции возбудителя дифтерии, выявления эпидемически значимых штаммов и расшифровки очагов дифтерийной инфекции.

Об авторах

И. А. Чагина

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского

Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
Россия

О. Ю. Борисова

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского; Рссийский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И.Пирогова

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Л. И. Кафарская

Рссийский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И.Пирогова

Email: noemail@neicon.ru
Россия

С. С. Афанасьев

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского

Email: noemail@neicon.ru
Россия

В. А. Алешкин

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Ю. В. Несвижский

Email: noemail@neicon.ru
Россия

М. С. Афанасьев

Первый московский государственный медицинский университет им. И.М.Сеченова

Email: noemail@neicon.ru
Россия

А. В. Алешкин

Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Е. В. Юсуф

Центр гигиены и эпидемиологии в Ханты-Мансийском автономном округе Югре

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Т. И. Москвина

Центр гигиены и эпидемиологии в Челябинской области

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Л. И. Пономарева

Центр гигиены и эпидемиологии в республике Удмуртия

Email: noemail@neicon.ru
Россия

А. В. Караулов

Первый московский государственный медицинский университет им. И.М.Сеченова

Email: noemail@neicon.ru
Россия

Список литературы

  1. Комбарова С. Ю., Борисова О. Ю., Мельников В. Г. и др. Полиморфизм генов tox и dtxR у циркулирующих штаммов Corynebacterium diphtheriae. Журн. микробиол. 2009, 1:7-11.
  2. Мазурова И.К., Комбарова С.Ю., Борисова О.Ю. и др. Мониторинг возбудителя дифтерийной инфекции. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2009, 3 (46): 17-22.
  3. Мазурова И.К., Борисова О.Ю., Комбарова С.КЗ. и др. Характеристика штаммов C.diphtheriae, циркулирующих в России в различные периоды эпидемического процесса дифтерийной инфекции. Инфекция и иммунитет. 2012, 2(1 - 2): 294.
  4. Berger A., Meinel D.M., Schaffer A. et al. A case of pharyngeal diphtheria in Germany, june 2015. Infection. doi: 10.1007/sl5010-016-0882-2.
  5. Bolt F., Cassiday P., Tondella M. et al. Multilocus sequence typing identifies evidence for recombination and two distinct lineages of C.diphtheriae. J. Clin. Microbiol. 2010, 48 (11): 4177-4185.
  6. Both L., Collins S., Zoysa A. et al. Molecular and epidemiological review of toxigenic diphtheria infections in England between 2007 and 2013. JCM. 2015, 53 (2): 567-572.
  7. Fafour E., Badell E., Zasada A. et al. Characterization and comparison of invasive C.diphtheriae isolates from France and Poland. J. Clin. Microbiol. 2012, 50 (1): 173-175.
  8. Grimont E, Grimont P. Ribosomal ribonucleic acid gene restriction patterns as potential taxonomic tools. Ann. Inst. Pasteur Microbiol. 1986, 137 В (2): 165-175.
  9. Kombarova S., Kim C., Melnikov V. et al. Rapid identification of Corynebacterium diphtheriae clonal group associated with diphtheria epidemic, Russian Federation. J. Infect. Dis. 2001, 7, 1: 133-136.
  10. Mattos-Guaraldi A. L., Moreira L. O., Damasco P. V. et al. Diphtheria remains a threat to health in developing world - an overview. Memorias Instituto Oswaldo Cruz. 2003, 98: 987-993.
  11. Mokrousov I., Narvskaya O., Limeshenko E. et al. Efficent discrimination within Corynebacterium diphtheriae clonal group by a noval macroarray-based method. J. Clin. Microbiol. 2005, 43, № 4: 662-668.
  12. Popovic X, Kombarova S. J., Reeves M. W. et al. Molecular epidemiology of diphtheria in Russia. J. Infectious Diseases. 1997, 174: 1064-1072.
  13. Spratt B. G., Maiden M. C. Bacterial population genetics, evolution and epidemiology. Philosophical Transactions Royal Society B. 1999, 354: 701-710.
  14. Viguetti S., Pacheco L., Santos L. et al. Multilocus sequence types of invasive C. diphtheriae isolated in the Rio de Janeiro urban area, Brazil. J. Epidemiol. Infect. 2011, 53: 1-4.
  15. Wagner K., White J., Lucenko I. et al. Diphtheria in postepidemic period, Europe, 2000 - 2009. J. Emerg. Infect. Dis. 2012, 18 (2): 217-225.
  16. Zakikhany K., Efstratiou A. Diphtheria in Europe: current problems and new challenges. Future Microbiol. 2012, 7 (5): 595-607.
  17. Zoysa A., Efstratiou A., Hawkey P. H. et al. Molecular characterization of diphtheria toxin repressor (dtxR) genes present in nontoxigenic Corynebacterim diphtheriae strains isolated in the United Kingdom. J. Clinical Microbiology. 2005, 43, 1: 223-228.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Чагина И.А., Борисова О.Ю., Кафарская Л.И., Афанасьев С.С., Алешкин В.А., Несвижский Ю.В., Афанасьев М.С., Алешкин А.В., Юсуф Е.В., Москвина Т.И., Пономарева Л.И., Караулов А.В., 2016

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах