Epidemiological significance of detection of SARS-CoV-2 RNA among different groups of population of Moscow and Moscow Region during the COVID-19 outbreak

Vasily G. Akimkin; Акимкин Василий Геннадиевич; Stanislav N. Kuzin; Кузин Станислав Николаевич; Olga Yu. Shipulina; Шипулина Ольга Юрьевна; Svetlana B. Yatsyshina; Яцышина Светлана Борисовна; Elena V. Tivanova; Тиванова Елена Валерьевна; Anna V. Kalenskaya; Каленская Анна Валентиновна; Irina V. Solovieva; Соловьева Ирина Владимировна; Marina A. Vershinina; Вершинина Марина Анатольевна; Olga A. Kvasova; Квасова Ольга Андреевна; Antonina A. Ploskireva; Плоскирева Антонина Александровна; Marina V. Mamoshina; Мамошина Марина Васильевна; Mariya A. Elkina; Елькина Мария Александровна; Elena E. Andreeva; Андреева Елена Евгеньевна; Aleksandr V. Ivanenko; Иваненко Александр Валентинович; Olga M. Mikailova; Микаилова Ольга Михайловна

doi:10.36233/0372-9311-2020-97-3-1

Эпидемиологическое значение определения РНК SARS-CoV-2 среди различных групп населения Москвы и Московской области в период эпидемии COVID-19

Авторы: Акимкин В.Г.¹, Кузин С.Н.¹, Шипулина О.Ю.¹, Яцышина С.Б.¹, Тиванова Е.В.¹, Каленская А.В.¹, Соловьева И.В.¹, Вершинина М.А.¹, Квасова О.А.¹, Плоскирева А.А.¹, Мамошина М.В.¹, Елькина М.А.¹, Андреева Е.Е.², Иваненко А.В.³, Микаилова О.М.⁴
Учреждения:
1. ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
2. Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по г. Москве
3. ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в городе Москве»
4. Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Московской области
Выпуск: Том 97, № 3 (2020)
Страницы: 197-201
Раздел: КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ
Дата подачи: 25.06.2020
Дата принятия к публикации: 25.06.2020
Дата публикации: 25.06.2020
URL: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/823
DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-3-1
ID: 823

Цитировать

Полный текст

Аннотация
Полный текст
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора представляет приоритетные данные широкомасштабного популяционного ПЦР-исследования динамики уровня циркуляции SARS-CoV-2 среди условно здорового населения Москвы и Московской области.

Ключевые слова

РНК, SARS-CoV-2, популяционное исследование, условно здоровое население, COVID-19, эпидемический процесс

Полный текст

За период с 06.04.2020 по 24.05.2020 специалистами ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора проведено популяционное исследование, которое позволило оценить уровень циркуляции SARS-CoV-2 среди населения Москвы и Московской области. Всего обследовано 75 940 условно здоровых лиц, не имеющих симптомов респираторных заболеваний. Также с начала подъема заболеваемости COVID-19 в Московском регионе обследованы отдельные категории пациентов (n = 83 699). Исследования выполняли с помощью разработанной и производимой в ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора тест-системы «Ампли-Сенс® Cov-Bat-FL» (регистрационное удостоверение № РЗН 2014/1987 от 25.03.2020).

Из обследованной когорты условно здорового населения Московского региона РНК SARS-CoV-2 выявили у 5321 (7,01%) человека (95% ДИ¹ 6,837,19%), частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 в Москве составила 7,12% (6,87-7,37%) и в Московской области — 6,87% (6,60-7,14%), что позволяет констатировать отсутствие различий в частоте определения РНК SARS-CoV-2 в этих субъектах России.

Важное значение для оценки эпидемиологической ситуации и определения направления ее эволюции имеет динамика анализируемого показателя (рисунок).

Уровень циркуляции SARS-CoV-2 среди условно здорового населения Москвы и Московской области в период развития эпидемии COVID-19.

The rate of SARS-CoV-2 circulation among relatively healthy residents of Moscow and Moscow Region during the COVID-19 epidemic outbreak.

Следует отметить, что значения показателя уровня циркуляции РНК SARS-CoV-2 были весьма вариабельными, причем в Московской области колебания носили более выраженный характер, чем в Москве. Так, в Московской области обращают на себя внимание 5 пиковых значений: 11.04.2020 (15,2%), 28-29.04.2020 (15,4 и 17,9% соответственно), 03.05.2020 (13,5%) и 07.05.2020 (14,7%).

Минимальные значения отмечены на фоне общего снижения частоты детекции РНК SARS-CoV-2 и составили 2,7% (20.05.2020), 2,5% (21.05.2020) и 2,8% (24.05.2020). В Москве пиковые значения были несколько ниже и зафиксированы на уровне 11,9% (16.04.2020), 11,0% (17.04.2020), 11,9% (21.04.2020), 11,2% (28.04.2020) и 10,4% (08.05.2020). Минимумы также пришлись на заключительные дни периода наблюдения — 23-24.05.2020 (1,8 и 1,9% соответственно).

По характеру кривых значений частоты детекции РНК SARS-CoV-2 среди населения нами выделены три временных отрезка (06-28.04.2020, 29.0412.05.2020 и 13-24.05.2020), для которых были рассчитаны величины тенденций динамики анализируемого показателя. Так, в период 06-28.04.2020 в Москве и Московской области зафиксирован умеренный рост с темпами прироста Троста = +1,3% и Троста = +3,0% в день соответственно. С нашей точки зрения, возрастающее количество потенциальных источников инфекции свидетельствует об интенсификации эпидемического процесса COVID-19 в исследуемых субъектах России.

В середине периода наблюдения (29.04-12.05.2020) в Москве и Московской области выявлены различия в динамике анализируемого показателя. Так, в Москве частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 в популяции стала снижаться с умеренной интенсивностью (Тсниж. = -1,8% в день), тогда как в Московской области продолжился умеренный рост (Троста = +3,3% в день).

Заключительные 10 дней периода наблюдения характеризовались высокими темпами снижения частоты определения РНК SARS-CoV-2, которые в Москве и Московской области составили Троста = -5,9% и Тсниж. = -11,1% в день соответственно.

Вместе с тем положительная тенденция развития эпидемического процесса COVID-19, установленная на основании динамики частоты обнаружения SARS-CoV-2 в популяции, не дает представления об общем эпидемиологическом благополучии. Одним из показателей, который, по нашему мнению, количественно характеризует эпидемиологическую ситуацию, является уровень циркуляции SARS-CoV-2 в популяции. Нами проведено сравнение средней частоты обнаружения РНК SARS-CoV-2 у обследованных лиц за 7-9-дневные интервалы с 06.04.2020 по 24.05.2020 (таблица).

Средняя частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 в Москве и Московской области за период 06.04-24.05.2020

The mean frequency of detection of SARS-CoV-2 RNA in Moscow and Moscow Region, 6/4/2020-24/5/2020

Срок исследования Duration of study	Москва / Moscow		Московская область / Moscow Region
Срок исследования Duration of study	%	95% ДИ 95% confidence interval	%	95% ДИ 95% confidence interval
06-12.04.2020	7,04	6,13-8,04	11,66	10,09-13,39
28.04-04.05.2020	7,60	6,90-8,35	8,53	7,63-9,50
16-24.05.2020	3,30	2,93-3,70	3,39	3,06-3,75

Можно констатировать, что в течение всего периода наблюдения в Москве и Московской области достигнуто существенное (в 3-4 раза; р < 0,001) снижение удельного веса лиц, которые являлись потенциальными источниками инфекции, что, по нашему мнению, может служить предикцией дальнейшего улучшения эпидемиологической ситуации.

Полученные данные свидетельствуют об эффективности проводимых противоэпидемических мероприятий. Так, принятый в Москве с 25.03.2020 режим самоизоляции начал оказывать значимый эффект, выражающийся в снижении удельного веса лиц, инфицированных SARS-CoV-2, примерно на 6-7-й неделе (рисунок). По нашему мнению, сроки начала влияния режима самоизоляции в Москве и начала снижения частоты обнаружения SARS-CoV-2 могут указывать на продолжительность инкубационного периода COVID-19 более 14 дней, а также на длительное выделение вируса у реконвалесцентов, что требует тщательного научного анализа [1].

Вместе с тем такое улучшение эпидемиологической ситуации недостаточно для радикальной отмены ограничительных мероприятий, поскольку, как очевидно, еще не сформирован достаточный популяционный иммунитет к РНК SARS-CoV-2. По предварительным данным, на этапе эпидемии, определяемом как стабилизация (по динамике заболеваемости COVID-19) — с 16.05.2020 по 24.05.2020, частота обнаружения специфических антител к SARS-CoV-2 у случайной выборки людей в Московском регионе составляет 12-15%, что полностью коррелирует с полученными нами данными о частоте циркуляции вируса среди населения.

Определение РНК SARS-CoV-2 в различных группах пациентов имело высокую диагностическую значимость. Так, у пациентов с предварительным диагнозом «острая респираторная вирусная инфекция» в 81,65% (81,18-82,11%) случаев была выявлена РНК SARS-CoV-2. Это дает основания считать, что на фоне эпидемии COVID-19 этот этиологический агент является основным для данной нозологической формы. Среди пациентов с диагнозом «пневмония», установленным на основании клинической картины, РНК SARS-CoV-2 обнаружили в 70,92% (70,22-72,61%) случаев. Весьма высокой следует считать частоту обнаружения РНК SARS-CoV-2 у лиц, имевших контакт с заболевшими COVID-19, — 65,78% (65,23-66,33%). Тот факт, что 2/3 контактных лиц оказались инфицированы, свидетельствует о высокой степени вирулентности SARS-CoV-2, что соответствует более поздней модели распространения COVID-19 [2, 3]. Отдельную группу составили пациенты, обследование которых проведено по назначению врача. В период эпидемии частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 составила 77,34% (76,53-78,13%).

Полученные результаты позволяют констатировать, что диагностика SARS-CoV-2 методом ПЦР в условиях развивающейся эпидемии COVID-19 на территории России имеет крайне важное и самостоятельное значение. Во-первых, обследование на наличие РНК SARS-CoV-2 позволяет своевременно выявлять и изолировать потенциально опасных в эпидемиологическом отношении лиц, а также обеспечивать этиологическую дифференциальную диагностику с другими острыми респираторными заболеваниями и гриппом, что имеет принципиально важное значение в качестве меры профилактики распространения SARS-CoV-2. Во-вторых, точное определение этиологии заболевания — необходимое условие для правильного выбора тактики ведения пациента. В-третьих, проведенное динамическое популяционное исследование показало, что получаемые результаты позволяют оценивать стадию развития эпидемического процесса COVID-19 [4].

В нашем случае в первую неделю (0612.04.2020) частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 среди случайно выбранных здоровых людей составила в Москве 7,04%, в Московской области — 11,66%. Это означало, что 1 из 10-13 человек, которые считают себя здоровыми, инфицирован и является потенциальным источником заражения для других людей. Именно такие носители вируса поддерживали высокую интенсивность эпидемического процесса в Москве и Московской области.

В середине анализируемого периода (28.0404.05.2020) в Москве частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 осталась на прежнем уровне (7,60%), тогда как в Московской области отмечено некоторое ее снижение (8,53%). Принципиально важным является существенное снижение удельного веса инфицированных лиц в последнюю неделю (1624.05.2020). В Москве и Московской области РНК SARS-CoV-2 выявлена у 3,30 и 3,39% обследуемых лиц соответственно.

Таким образом, частота циркуляции SARS-CoV-2 в популяции — исключительно важный интегративный эпидемиологический показатель, который позволяет объективно оценивать интенсивность эпидемического процесса и эффективность проводимых противоэпидемических мероприятий [5].

Массовый популяционный скрининг на наличие РНК SARS-CoV-2 является важнейшим противоэпидемическим мероприятием, позволяющим получить объективную информацию о развитии эпидемического процесса в режиме реального времени. С учетом его значимости для оценки эпидемиологической ситуации показатель удельного веса инфицированных лиц среди здоровой популяции, свидетельствующий об уровне циркуляции вируса среди населения, очевидно, будет использоваться в системе эпидемиологического надзора в качестве одного из параметров мониторинга [5, 6].