Отправить статью по E-mail МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ИЗОЛЯТОВ ПАРВОВИРУСА B19, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ СЕВЕРОЗАПАДНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА
- Авторы: Хамитова И.В.1, Останкова Ю.В.1, Антипова А.Ю.1, Семенов А.В.2, Лаврентьева И.Н.1
-
Учреждения:
- Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
- Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. И.П.Павлова, Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И.Мечникова
- Выпуск: Том 95, № 6 (2018)
- Страницы: 55-61
- Раздел: Статьи
- Дата подачи: 10.04.2019
- Дата публикации: 28.12.2018
- URL: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/329
- DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-2018-6-55-61
- ID: 329
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Цель. Генотипирование и молекулярно-генетическая характеристика парвовируса В19, циркулирующего на территории Северо-Западного федерального округа. Материалы и методы. В работе были использованы образцы сыворотки крови от 821 пациента с макуло-папулезной сыпью, поступившие в Санкт-Петербургский Региональный Центр по надзору за корью и краснухой в 2009-2017 гг., отрицательные по антителам IgM-корь и IgM-краснуха. В настоящем исследовании мы применили генотипирование на основе прямого секвенирования NS1/VP1 области генома парвовируса В19. Результаты. ДНК вируса выявлена у 59 (42,4%) серопозитивных больных. Для оценки гетерогенности изолятов были выбраны 14 образцов от пациентов из географически удаленных регионов СЗФО, разного возраста, вне зависимости от пола, с высокой вирусной нагрузкой (106-107 копий/мл). При филогенетическом анализе было показано, что во всех изолятах выявлен только генотип 1А. При этом нуклеотидные последовательности можно разделить на две подгруппы: 13 изолятов (92,8%) относились к подгруппе 1А2, один изолят к подгруппе 1А1. Заключение. Внедрение скрининга B19 от пациентов с лихорадкой/сыпью способно представить значимую информацию о распространенности парвовирусной инфекции в Российской Федерации. Выявление новых мутаций вируса и дальнейший анализ их возможных взаимосвязей с течением заболевания может помочь в разработке лекарств, а также в разработке эффективной вакцины против парвовируса В19.
Ключевые слова
Об авторах
И. В. Хамитова
Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Автор, ответственный за переписку.
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Ю. В. Останкова
Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Email: noemail@neicon.ru
Россия
А. Ю. Антипова
Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Email: noemail@neicon.ru
Россия
А. В. Семенов
Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. И.П.Павлова, Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И.Мечникова
Email: noemail@neicon.ru
Россия
И. Н. Лаврентьева
Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Email: noemail@neicon.ru
Россия
Список литературы
- Broliden K., Tolfvenstam T., Norbeck O. Clinical aspects of parvovirus B19 infection. J. Intern. Med. 2006, 260(4): 285-304.
- Candotti D., Etiz N., Parsyan A. et al. Identification and characterization of persistent human erythrovirus infection in blood donor samples. J. Virol. 2004, 78: 2169-12178.
- Cohen B.J., Gandhi J., Clewley J.P. Genetic variants of parvovirus B19 identified in the United Kingdom: implications for diagnostic testing. J. Clin. Virol. 2006, 36(2): 152-155.
- Duffy S., Shackelton L.A., Holmes E.C. Rates of evolutionary change in viruses: patterns and determinants. Nat. Rev. Genet. 2008, 9: 267-276.
- Gallinella G., Venturoli S., Manaresi E. et al. B19 virus genome diversity: epidemiological and clinical correlations. J. Clin. Virol. 2003, 28(1):1-13.
- Hubschen J.M., Mihneva Z., Mentis A.F. et al. Phylogenetic analysis of human parvovirus B19 sequences from eleven different countries confirms the predominance of genotype 1 and suggests the spread of genotype 3b. J. Clin. Microbiol. 2009, 47(11): 3735-3738.
- Kuhl U., Lassner D., Pauschinger M. et al. Prevalence of erythrovirus genotypes in the myocardium of patients with dilated cardiomyopathy. J. Med. Virol. 2008, 80(7):1243-1251.
- Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution. 2016, 33(7):1870-1874.
- Molenaar-de Backer M.W., Lukashov V.V., van Binnendijk R.S. et al. Global co-existence of two evolutionary lineages of parvovirus B19 1a, different in genome-wide synonymous positions. PLoS One. 2012, 7(8): e43206.
- Norja P., Hokynar K., Aaltonen L.M. et al. Bioportfolio: lifelong persistence of variant and prototypic erythrovirus DNA genomes in human tissue. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006, 103(19):7450-7453.
- Sanabani S., Neto W. K., Pereira J. et al. Sequence variability of human erythroviruses present in bone marrow of Brazilian patients with various parvovirus B19-related hematological symptoms. J. Clin. Microbiol. 2006, 44: 604-606.
- Servant A., Laperche S., Lallemand F. et al. Genetic diversity within human erythroviruses: identification of three genotypes. J. Virol. 2002, 76: 9124-9134.
- Shackelton L.A., Holmes E.C. Phylogenetic evidence for the rapid evolution of human B19 erythrovirus. J. Virol. 2006, 806: 3666-3669.
- Suzuki M., Yoto Y., Ishikawa A. et al. Analysis of nucleotide sequences of human parvovirus B19 genome reveals two different modes of evolution, a gradual alteration and a sudden replacement: a retrospective study in Sapporo, Japan, from 1980 to 2008. J. Virol. 2009, 83:10975-10980.
- Toan N.L., Duechting A., Kremsner P.G. et al. Phylogenetic analysis of human parvovirus B19, indicating two subgroups of genotype 1 in Vietnamese patients. J. Gen. Virol. 2006, 87: 2941-2949.
Дополнительные файлы
