ГЕНОТИПИРОВАНИЕ И МОЛЕКУЛЯРНОЕ МАРКИРОВАНИЕ БАКТЕРИЙ И ВИРУСОВ В ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОМ НАДЗОРЕ ЗА АКТУАЛЬНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель . Определение генетических и молекулярных особенностей патогенов, циркулирующих в России на северо-западе страны и в Санкт-Петербурге, для решения вопросов распространения вызываемых ими заболеваний. Материалы и методы. Использовали методы полного и лимитированного сиквенса генов, анализ полиморфизма длин фрагментов рестрикции ДНК, сполиготипирование, VNTR-типирование, резистотипирование и др. Результаты . Получены данные о популяционной структуре и доминирующих генотипах микобактерий туберкулеза, коринебактерий, хеликобактерий, вирусов гепатитов А, В, С, папилломы человека, циркулирующих в России, на северо-западе страны и в Санкт-Петербурге. Выявлена генетическая дивергенция популяции вируса краснухи и вакцинных штаммов полиовируса в условиях массовой вакцинации. Получены доказательства более высокой эффективности методов генотипирования патогенов в эпидемиологической диагностике по сравнению с традиционным эпидемиологическим расследованием. Заключение . Методы генотипирования микро- организмов оказались полезными для решения стратегических задач современной эпидемиологии. Перспективы дальнейшего их развития связаны с получением данных о циркулирующих генотипах во всех регионах Земного шара, созданием полных баз данных о циркулирующих генотипах и внедрением этой методологии в повседневные стандарты диагностики и эпидемиологического надзора.

Об авторах

А. Б Жебрун

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург

С. Л Мукомолов

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург

О. В Нарвская

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург

Список литературы

  1. Жебрун А.Б. Инфекция Helicobacter pylori. СПб, Феникс, 2006.
  2. Жебрун А.Б., Лялина Л.В., Бичурина М.А. и др. Проблемы контроля инфекционных заболеваний. СПб, Русь, 2003.
  3. Жебрун А.Б.(ред.). Инфекционная заболеваемость в Северо-Западном Федеральном округе России. СПб, Феникс, 2007.
  4. Лаврентьева И.Н., Семериков В.В., Жебрун А.Б. и др. Краснуха в России: изменчивость возбудителя в период вакцинопрофилактики инфекции. Журн. микробиол. 2003, 3: 26-31.
  5. Мокроусов И.В., Оттен Т.Ф., Нарвская О.В., Вишневский Б.И. Способ экспрессного определения устойчивости к рифампицину у микобактерий туберкулеза. Патент 2287586, 2006.
  6. Мокроусов И.В., Оттен Т.Ф., Нарвская О.В., Вишневский Б.И. Способ экспрессного определения устойчивости к изониазиду у микобактерий туберкулеза. Патент 2339040, 2008.
  7. Онищенко Г.Г., Дроздов С.Г., Грачев В.П. и др. Проблемы ликвидации полиомиелита. СПб, Феникс, 2008.
  8. Тотолян А.А., Суворов А.Н., Дмитриев А.В. Стрептококки группы В в патологии человека. СПб, Человек, 2009.
  9. Ando T., Peek R. M., Pride D. et al. Polymorphisms of Helicobacter pylori HP0638 reflect geographic origin and correlate with cagA Status. J. Clin. Microbiol. 2002, 40 (1): 239-246.
  10. De Francesco V., Margiotta M., Zullo A. Clarithromycin-resistant genotypes and eradication of Helicobacter pylori. Ann. Intern. Med. 2006, 144 (2): 94-100.
  11. Garrido L., Toledo H. Novel genotypes in Helicobacter pylori involving domain V of the 23S rRNA gene. Helicobacter. 2007, 12 (5): 505-509.
  12. Grimont P. Grimont F., Efstratiou A. et al. International nomenclature for Corynebacterium diphtheriae ribotypes. Res. Microbiol. 2004, 155 (3): 162-166.
  13. Houben R.M., Glynn J.R. A systematic review and meta-analysis of molecular epidemiological studies of tuberculosis: development of a new tool to aid interpretation. Trop. Med. Int. Health. 2009, 14 (8): 892-909.
  14. Mokrousov I., Ly H., Otten T. Origin and primary dispersal of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: clues from human phylogeography. Genome Res. 2005, 15 (10): 1357-1364.
  15. Mokrousov I., Narvskaya O., Limeschenko E., Vyazovaya A. Efficient discrimination within a Corynebacterium diphtheriae epidemic clonal group by a novel macroarray-based method. J. Clin. Microbiol. 2005, 43 (4): 1662- 1668.
  16. Narvskaya O., Otten T., Limeschenko E. et al. Nosocomial outbreak of multidrug-resistant tuberculosis caused by a strain of Mycobacterium tuberculosis W-Beijing family in St. Petersburg, Russia. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2002, 21 (8): 596-602.
  17. WHO. Manual for the laboratory diagnosis of measles and rubella virus infection. Geneva, 2006.
  18. WHO. Imported wild poliovirus causing poliomyelitis, Bulgaria, 2001. Weekly Epidemiol. Rec. 2001, 76 (43):332-335.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Жебрун А.Б., Мукомолов С.Л., Нарвская О.В., 2011

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах