ГЕНОТИПИРОВАНИЕ И МОЛЕКУЛЯРНОЕ МАРКИРОВАНИЕ БАКТЕРИЙ И ВИРУСОВ В ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОМ НАДЗОРЕ ЗА АКТУАЛЬНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ
- Авторы: Жебрун А.Б1, Мукомолов С.Л1, Нарвская О.В1
-
Учреждения:
- НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург
- Выпуск: Том 88, № 4 (2011)
- Страницы: 28-36
- Раздел: Статьи
- Дата подачи: 09.06.2023
- Дата публикации: 15.08.2011
- URL: https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13510
- ID: 13510
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Цель . Определение генетических и молекулярных особенностей патогенов, циркулирующих в России на северо-западе страны и в Санкт-Петербурге, для решения вопросов распространения вызываемых ими заболеваний. Материалы и методы. Использовали методы полного и лимитированного сиквенса генов, анализ полиморфизма длин фрагментов рестрикции ДНК, сполиготипирование, VNTR-типирование, резистотипирование и др. Результаты . Получены данные о популяционной структуре и доминирующих генотипах микобактерий туберкулеза, коринебактерий, хеликобактерий, вирусов гепатитов А, В, С, папилломы человека, циркулирующих в России, на северо-западе страны и в Санкт-Петербурге. Выявлена генетическая дивергенция популяции вируса краснухи и вакцинных штаммов полиовируса в условиях массовой вакцинации. Получены доказательства более высокой эффективности методов генотипирования патогенов в эпидемиологической диагностике по сравнению с традиционным эпидемиологическим расследованием. Заключение . Методы генотипирования микро- организмов оказались полезными для решения стратегических задач современной эпидемиологии. Перспективы дальнейшего их развития связаны с получением данных о циркулирующих генотипах во всех регионах Земного шара, созданием полных баз данных о циркулирующих генотипах и внедрением этой методологии в повседневные стандарты диагностики и эпидемиологического надзора.
Об авторах
А. Б Жебрун
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург
С. Л Мукомолов
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург
О. В Нарвская
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург
Список литературы
- Жебрун А.Б. Инфекция Helicobacter pylori. СПб, Феникс, 2006.
- Жебрун А.Б., Лялина Л.В., Бичурина М.А. и др. Проблемы контроля инфекционных заболеваний. СПб, Русь, 2003.
- Жебрун А.Б.(ред.). Инфекционная заболеваемость в Северо-Западном Федеральном округе России. СПб, Феникс, 2007.
- Лаврентьева И.Н., Семериков В.В., Жебрун А.Б. и др. Краснуха в России: изменчивость возбудителя в период вакцинопрофилактики инфекции. Журн. микробиол. 2003, 3: 26-31.
- Мокроусов И.В., Оттен Т.Ф., Нарвская О.В., Вишневский Б.И. Способ экспрессного определения устойчивости к рифампицину у микобактерий туберкулеза. Патент 2287586, 2006.
- Мокроусов И.В., Оттен Т.Ф., Нарвская О.В., Вишневский Б.И. Способ экспрессного определения устойчивости к изониазиду у микобактерий туберкулеза. Патент 2339040, 2008.
- Онищенко Г.Г., Дроздов С.Г., Грачев В.П. и др. Проблемы ликвидации полиомиелита. СПб, Феникс, 2008.
- Тотолян А.А., Суворов А.Н., Дмитриев А.В. Стрептококки группы В в патологии человека. СПб, Человек, 2009.
- Ando T., Peek R. M., Pride D. et al. Polymorphisms of Helicobacter pylori HP0638 reflect geographic origin and correlate with cagA Status. J. Clin. Microbiol. 2002, 40 (1): 239-246.
- De Francesco V., Margiotta M., Zullo A. Clarithromycin-resistant genotypes and eradication of Helicobacter pylori. Ann. Intern. Med. 2006, 144 (2): 94-100.
- Garrido L., Toledo H. Novel genotypes in Helicobacter pylori involving domain V of the 23S rRNA gene. Helicobacter. 2007, 12 (5): 505-509.
- Grimont P. Grimont F., Efstratiou A. et al. International nomenclature for Corynebacterium diphtheriae ribotypes. Res. Microbiol. 2004, 155 (3): 162-166.
- Houben R.M., Glynn J.R. A systematic review and meta-analysis of molecular epidemiological studies of tuberculosis: development of a new tool to aid interpretation. Trop. Med. Int. Health. 2009, 14 (8): 892-909.
- Mokrousov I., Ly H., Otten T. Origin and primary dispersal of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: clues from human phylogeography. Genome Res. 2005, 15 (10): 1357-1364.
- Mokrousov I., Narvskaya O., Limeschenko E., Vyazovaya A. Efficient discrimination within a Corynebacterium diphtheriae epidemic clonal group by a novel macroarray-based method. J. Clin. Microbiol. 2005, 43 (4): 1662- 1668.
- Narvskaya O., Otten T., Limeschenko E. et al. Nosocomial outbreak of multidrug-resistant tuberculosis caused by a strain of Mycobacterium tuberculosis W-Beijing family in St. Petersburg, Russia. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2002, 21 (8): 596-602.
- WHO. Manual for the laboratory diagnosis of measles and rubella virus infection. Geneva, 2006.
- WHO. Imported wild poliovirus causing poliomyelitis, Bulgaria, 2001. Weekly Epidemiol. Rec. 2001, 76 (43):332-335.