СВОЙСТВА ИЗОЛЯТОВ CRF02_AG ВИЧ1, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ НОВОСИБИРСКОЙ ОБЛАСТИ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Выделение и изучение свойств изолятов ВИЧ-1 циркулирующей рекомбинантной формы 02_AG, быстро распространяющейся в течение последних трёх лет на территории Новосибирской области. Материалы и методы. Использован протокол ВОЗ для выделения первичных изолятов ВИЧ-1; для генетической характеристики выделенных изолятов — автоматический секвенатор. Выделяли вирусспецифическую РНК и перерабатывали фрагменты ДНК области env ВИЧ-1. Осуществляли также филогенетический анализ. Результаты. Выделенные из периферической крови инфицированных ВИЧ-1 пациентов изоляты CRF02_AG ВИЧ- 1 относились к CCR5 тропным вирусам, обладали различными репродуктивными характеристиками. Большая часть изолятов ВИЧ являлась быстро реплицирующимися вирусными вариантами, характеризующимися способностью к накоплению высокой концентрации вирусного белка р24 в культуральной жидкости. В экспериментах по заражению осветленной культуральной жидкостью мононуклеарных клеток здоровых доноров были подтверждены инфекционность выделенных изолятов ВИЧ и их репродуктивные свойства. Филогенетический анализ вариантов CRF02_ AG ВИЧ-1, выделенных в Новосибирской области в 2007—2010 гг., показал, что на данной территории сформировался собственный очаг эпидемии, вызванный проникновением в человеческую популяцию CRF02_AG ВИЧ- 1. Заключение. Создана коллекция генетически и биологически охарактеризованных изолятов CRF02_AG ВИЧ-1, не распространявшихся ранее в России.

Полный текст

СВОЙСТВА ИЗОЛЯТОВ CRF02_AG ВИЧ1, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ НОВОСИБИРСКОЙ ОБЛАСТИ
×

Об авторах

Н. М Гашникова

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

П. Ф Сафронов

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

Ю. В Никонорова

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

Н. В Унагаева

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

Т. А Лаптева

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

В. В Богачев

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

П. Б Барышев

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

А. В Тотменин

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

Е. К Букин

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

Е. Ф Бочаров

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

Н. Я Черноусова

Новосибирский областной Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями, пос. Кольцово, Новосибирская область

Е. А Ставский

ГНЦ вирусологии и биотехнологии «Вектор», пос. Кольцово, Новосибирская область

Список литературы

  1. Butler I., Pandrea I., Marx P. et al. HIV ge- netic diversity: biological and public health consequences. Curr. HIV Res. 2007, 5 (1): 23-45.
  2. Bobkov A., Kazennova E., Selimova L. et al. Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: predominance of subtype A. J. Med. Virol. 2004, 74: 191-196.
  3. Carr J., Nadai Y., Eyzaguirre L. et al. Outbreak of a West African recombinant of HIV-1 in Tashkent, Uzbekistan. J. Acquir. Immun. Def. Syndr. 2005, 39 (5): 570-575.
  4. Delwart E., Shpaer EG., Louwagie J. et al. Genetic relationships determined by a DNA heteroduplex mobility assay analysis of HIV-1 env genes. Science. 1993, 262: 1257-1261.
  5. Esbjörnsson J., Månsson F., Martínez-Arias W. et al. Frequent CXCR4 tropism of HIV-1 subtype A and CRF02_AG during late-stage disease — indication of an evolving epidemic in West Africa. Retrovirology. 2010, 7:23; http://www. retrovirology.com/content/7/1/23.
  6. Eyzaguirre L., Erasilova I., Nadai Y. et al. Genetic characterization of HIV-1 strains circulating in Kazakhstan. J. Acquir. Immun. Def. Syndr. 2007, 46 (1): 19-23.
  7. http://jphmm.gobics.de.
  8. http://coreceptor.bioinf.mpi-inf.mpg.de.
  9. http://indra.mullins.microbiol.washington. edu/webpssm.
  10. Powell R., Konings F., Nanfack A. et al. Quasispecies analysis of novel HIV-1 recombinants of subtypes A and G reveals no similarity to the mosaic structure of CRF02_AG. J. Med. Virol. 2007, 79: 1270-1285.
  11. Thomson M., Vázquez de Parga E., Vinogradova A. et al. New insights into the origin of the hiv type 1 subtype a epidemic in former Soviet Union’s countries derived from se- quence analyses of preepidemically transmitted viruses. AIDS Res. Hum. Retrovir. 2007, 23 (12): 1599-1604.
  12. Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0. Mol. Biol. Evol. 2007, 24: 1596-1599.
  13. WHO-UNAIDS Guidelines for standard HIV isolation and characterization procedures, 2002.
  14. Zhang M., Foley B., Schultz A. et al. The role of recombination in the emergence of a complex and dynamic HIV epidemic. Retrovirology. 2010, 7: 25; http://www.retrovirology. com/content/7/1/25.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Гашникова Н.М., Сафронов П.Ф., Никонорова Ю.В., Унагаева Н.В., Лаптева Т.А., Богачев В.В., Барышев П.Б., Тотменин А.В., Букин Е.К., Бочаров Е.Ф., Черноусова Н.Я., Ставский Е.А., 2011

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах