ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ HAEMOPHILUS INFLUENZAE СЕРОТИПА B, ИЗОЛИРОВАННЫХ В РЕГИОНАХ РОССИИ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель. Проведение генотипирования штаммов Hib, изолированных в регионах России, и характеристика генетических связей типированных штаммов со штаммами, выделенными на других территориях. Материалы и методы. Методом мультилокусного секвенирования-типирования проведена генетическая характеристика 31 штамма Haemophilus influenzae серотипа b, выделенного в регионах России в период 2005-2008 гг. Результаты. У изученных штаммов наблюдается 11 вариантов сиквенс-типов, шесть из которых были описаны в предыдущих иссле- дованиях, пять - впервые выявлены при про- ведении данной работы. Наиболее часто встречались штаммы с ST-92 (13, или 42% штаммов) и ST-6 (6, или 19% штаммов). Типированные штаммы распределены по двум клональным комплексам. Клональный комплекс «А1/А2» («ST-6») объединяет все типированные штаммы, за исключением штамма с ST-93, входящего в клональный комплекс «B1b» («ST-93»). Большинство изученных штаммов (19, или 61%) имеют отличие от «центрального» сиквенс-типа клонального комплекса «А1/А2» («ST-6») не более чем по одному аллелю. Заключение. Клональная структура исследованных штаммов аналогична распределению, наблюдаемому у московских и зарубежных штаммов.

Об авторах

К. О Миронов

Центральный НИИ эпидемиологии, Москва

А. Е Платонов

Центральный НИИ эпидемиологии, Москва

М. К Николаев

Центральный НИИ эпидемиологии, Москва

И. С Королева

Центральный НИИ эпидемиологии, Москва

Г. А Шипулин

Центральный НИИ эпидемиологии, Москва

Список литературы

  1. Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Шипулин Г.А. Генетические взаимоотношения московских и зарубежных штаммов Haemophilus influenzae серотипа b. Журн. микробиол. 2006, 6: 14-20.
  2. Платонов А.Е., Миронов К.О., Яцышина С.Б. и др. Характеристика московских штаммов Haemophilus influenzae типа b методом мультилокусного секвенирования-типирования. Мол. ген. микробиол. вирусол. 2003, 2: 21-25.
  3. Платонов А.Е., Королева И.С., Платонова О.В. и др. Заболеваемость гнойными менингитами у детей в возрасте до 5 лет в Москве. Эпидемиол. инфекц. бол. 2006, 4: 36-43.
  4. Платонов А.Е., Николаев М.К. Заболеваемость гнойными менингитами у детей в возрасте до 5 лет в регионах России. Там же. 2007, 3: 10-18.
  5. Cerquetti M., Cardines R., Ciofi Degli Atti M.L. et al. Presence of multiple copies of the capsulation b locus in invasive Haemophilus influenzae type b (Hib) strains isolated from children with Hib conjugate vaccine failure. J. Infect. Dis. 2005, 192 (5): 819-823.
  6. Feil E.J., Li B.C., Aanensen D.M. et al. eBURST: inferring patterns of evolutionary descent among clusters of related bacterial genotypes from multilocus sequence typing data. J. Bacteriol. 2004, 186 (5): 1518-1530.
  7. Jolley K.A., Chan M.S., Maiden M.C. mlstdbNet - distributed multi-locus sequence typing (MLST) databases. BMC Bioinformatics. 2004, 5: 86.
  8. Meats E., Feil E.J., Stringer S. et al. Characterization of encapsulated and noncapsulated Haemophilus influenzae and determination of phylogenetic relationships by multilocus sequence typing. J. Clin. Microbiol. 2003, 41 (4): 1623-1636.
  9. Peltola H. Worldwide Haemophilus influenzae type b disease at the beginning of the 21st century: global analysis of the disease burden 25 years after the use of the polysaccharide vaccine and a decade after the advent of conjugates. Clin. Microbiol. Rev. 2000, 13 (2): 302-317.
  10. Platonov A.E., Griffiths U.K., Voeykova M.V. et al. Economic evaluation of Haemophilus influenzae type b vaccination in Moscow, Russian Federation. Vaccine. 2006, 24 (13): 2367-2376.
  11. Schouls L., van der Heide H., Witteveen S. et al. Two variants among Haemophilus influenzae serotype b strains with distinct bcs4, hcsA and hcsB genes display differences in expression of the polysaccharide capsule. BMC Microbiol. 2008, 8: 35.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Миронов К.О., Платонов А.Е., Николаев М.К., Королева И.С., Шипулин Г.А., 2010

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: ПИ № ФС77-75442 от 01.04.2019 г.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах