<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0372-9311</issn><issn publication-format="electronic">2686-7613</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Central Research Institute for Epidemiology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">828</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.36233/0372-9311-2020-97-3-6</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL RESEARCHES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Unknown</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Characteristics of Nasopharyngeal Carriage of Bacterial Pathogens in Children and Adults Suffering from Recurrent Respiratory Infections in Khabarovsk City in 2015–2018</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Характеристика назофарингеального носительства бактериальных патогенов у детей и взрослых с рецидивирующими респираторными заболеваниями в Хабаровске (2015–2018 гг.)</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Shmуlenko</surname><given-names>Vlada A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Шмыленко</surname><given-names>Влада Александровна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>researcher, Laboratory of bacterial infections</p><p>postgraduate student, Department of epidemiology and military epidemiology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>н.с. лаб. бактериальных инфекций</p><p>аспирант каф. эпидемиологии и военной эпидемиологии </p></bio><email>baklabhniiem@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bondarenko</surname><given-names>Albina P.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бондаренко</surname><given-names>Альбина Павловна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Med.), Laboratory of bacterial infections</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.м.н., лаб. бактериальных инфекций ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора, 680610, Хабаровск, Россия. Троценко Ольга Евгеньевна — д.м.н., директор</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Trotsenko</surname><given-names>Olga E.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Троценко</surname><given-names>Ольга Евгеньевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>D.Sci. (Med.), Director</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., директор</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Turkutyukov</surname><given-names>Vyacheslav B.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Туркутюков</surname><given-names>Вячеслав Борисович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>D.Sci. (Med.), Prof., Head, Department of epidemiology and military epidemiology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., проф., зав. кафедрой эпидемиологии и военной эпидемиологии</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bazykina</surname><given-names>Elena A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Базыкина</surname><given-names>Елена Анатольевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>junior researcher, Laboratory for the prevention of viral hepatitis and AIDS</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>м.н.с. лаб. профилактики вирусных гепатитов и СПИДа</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФБУН «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Pacific State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО «Тихоокеанский государственный медицинский университет»</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2020-06-25" publication-format="electronic"><day>25</day><month>06</month><year>2020</year></pub-date><volume>97</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>242</fpage><lpage>250</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2020-06-25"><day>25</day><month>06</month><year>2020</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2020-06-25"><day>25</day><month>06</month><year>2020</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2020, Shmуlenko V.A., Bondarenko A.P., Trotsenko O.E., Turkutyukov V.B., Bazykina E.A.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2020, Шмыленко В.А., Бондаренко А.П., Троценко О.Е., Туркутюков В.Б., Базыкина Е.А.</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Shmуlenko V.A., Bondarenko A.P., Trotsenko O.E., Turkutyukov V.B., Bazykina E.A.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Шмыленко В.А., Бондаренко А.П., Троценко О.Е., Туркутюков В.Б., Базыкина Е.А.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/828">https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/828</self-uri><abstract xml:lang="en"><p><bold>Objective</bold>. To designate the nasopharyngeal carriage of bacterial pathogens among children and adults diagnosed with recurrent respiratory diseases residing in the Khabarovsk city during a four-year period.</p> <p><bold>Materials and methods</bold>. Nasopharyngeal and oral swabs obtained from 7,043 children and adults were tested using classical bacteriological methods. In order to grow “difficult-to-culture” microorganisms a columbian agar with addition of 5% defibrinated sheep blood, incubation in the atmosphere rich with CO<sub>2</sub> (5%), bacteriological analyzer Vitek 2 Compact were used. Real-time PCR was used to confirm the identification of S. pyogenes.</p> <p><bold>Results.</bold> A high level of nasopharyngeal pathogens carriage (47%) was detected. The most prevalent microorganisms were as follows: S. pneumoniae (47%), M. catarrhalis (30.4%), H. influenzaе (17.5%), S. pyogenes (5.2%). The age groups at risk were children aged 0–6 years for S. pneumoniae and children aged 7–12 years for S. pyogenes. An emerging trend it the level of nasopharyngeal carriage of S. pneumoniae observed in 2018 was followed by the increase of registered incidence of pneumococcal pneumonia.</p> <p><bold>Conclusion</bold>. Nasopharyngeal carriage of S. pneumoniae imposes a high risk of community-acquired pneumonia and other pneumococci-associated diseases, predominantly in children.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p><bold>Цель работы</bold> — по материалам четырёхлетних наблюдений представить характеристику назофарингеального носительства бактериальных патогенов у детей и взрослых с рецидивирующими респираторными заболеваниями в г. Хабаровск.</p> <p><bold>Материалы и методы</bold>. Мазки из ротоглотки и носоглотки от 7043 детей и взрослых исследованы классическим бактериологическим методом. Для диагностики микроорганизмов использованы: колумбийский агар с добавлением 5% дефибринированной крови барана с инкубацией посевов в атмосфере 5% СО<sub>2</sub> , бактериологический анализатор «Vitek 2 Compact», метод ПЦР в реальном времени для подтверждения культур S. pyogenes.</p> <p><bold>Результаты</bold>. Выявлен высокий уровень носительства назофарингеальных патогенов (76,4%) со следующим ранговым положением основных возбудителей: S. pneumoniae (47%), M. catarrhalis (30,4%), H. influenzaе (17,5%), S. pyogenes (5,2%). Возрастные группы риска — дети 0–6 лет для S. pneumoniae и дети 7–12 лет для S. pyogenes. Намечающийся рост уровней носительства S. pneumoniae в 2018 г. сопровождался повышением регистрируемой заболеваемости пневмококковой пневмонией.</p> <p><bold>Заключение</bold>. Назофарингеальное носительство S. pneumoniae обусловливает высокий риск развития внебольничных пневмоний и других пневмококк-ассоциированных заболеваний преимущественно у детей.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>respiratory infections</kwd><kwd>nasopharyngeal bacterial pathogens</kwd><kwd>tendencies of nasopharyngeal carriage levels</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>респираторные заболевания</kwd><kwd>назофарингеальные бактериальные патогены</kwd><kwd>тенденции уровней носительства</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Самсыгина Г.А., Выжлова Е.Н. Ещё раз о проблемах понятия «часто болеющие дети». Педиатрия. Журнал им. Г.Н. Сперанского. 2016; 95(4): 209-15.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Рамазанова Б.А., Ералиева Л.Т., Мустафина К.К., Колоскова Е.А. Мультицентровое исследование распространённости назофарингеального носительства Streptococcus pneumoniae на отдельных территориях Республики Казахстан до и после начала противопневмококковой вакцинации. Антибиотики и химиотерапия. 2017; 5-6(62): 35-42.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Борисова О.Ю., Гуров А.В., Гадуа Н.Т., Ефимов Б.А., Кафарская Л.И., Афанасьев С.С. и др. Микробиоценоз нёбных миндалин у практически здоровых лиц. Вестник оториноларингологии. 2018; 83(5): 31-5. DOI: http://doi.org/10.17116/otorino20188305131</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Зарипова А.З., Баязитова Л.Т., Тюпкина О.Ф., Чазова Т.А., Тюрин Ю.А., Исаева Г.Ш. и др. Фенотипические и генотипические свойства Streptococcus pneumoniae при бактерионосительстве. Практическая медицина. 2018; 16(9): 106-12.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Тюркина С.И., Минасян В.С., Савенкова М.С., Китайгородский А.П., Овечкина Н.В., Кац Т.Г. и др. Лечение и профилактика аденоидитов бактериальными лизатами у часто болеющих детей. Детские инфекции. 2013; 12(1): 26-30.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Чеботарёва Т.А., Мазанкова Л.Н., Хоперскова А.П., Малиновская В.В., Кольцов В.Д., Брагина Г.С. Рекуррентные инфекции органов дыхания у детей и программы иммунореабилитации. Детские инфекции. 2014; (3): 61-4.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Наумкина Е.В., Матущенко Е.В., Калитина И.И., Абросимова О.А., Пядочкина Т.В., Матущенко А.И. Особенности микробиоты дыхательных путей при заболеваниях респираторного тракта. Бактериология. 2017; 2(3): 16-20. DOI: http://doi.org/10.20953/2500-1027-2017-3-16-20</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Шабалдин А.В., Шабалдина Е.В., Симбирцев А.С. Особенности микробиома верхних отделов респираторного тракта у детей с рецидивирующими респираторными заболеваниями. Инфекция и иммунитет. 2017; 7(4): 341-9. DOI: http://doi.org/10.15789/2220-7619-2017-4-341-349</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Peterson S.W., Knox N.C., Golding G.R., Tyler S.D., TylerA.D., Mabon P., еt al. A study of the infant nasal microbiome development over the first year of life and relation to their primary adult caregivers using cpn 60 universal target (UT) as a phylogenetic marker. PLoS One. 2016; 11(3): е0152493. DOI: http://doi.org/10.1371/journal.pone.0152493</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Teo S.M., Mok D., Pham K., Kusel M., Serralha M., Troy N., et al. The infant nasopharyngeal microbiome impacts severity of lower respiratory infection and risk of asthma development. Cell Host Microbe. 2015; 17(5): 704-15. DOI: http://doi.org/10/1016/j.chom.2015.03.008</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Dickson R.P., Martinez F.J., Huffnagle G.B. The role of the microbiome in exacerbations of chronic lung diseases. Lancet. 2014; 384(9944): 691-702. DOI: http://doi.org/10.1016/S0140-6736(14)61136-3</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Методические указания МУ 4.2.2039-05. Методы контроля. Биологические и микробиологические факторы. Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории. М.; 2001.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Богданович Т.М., Стецюк О.У., Кречикова О.И., Боронина Л.Г., Катосова Л.К., Фаустова М.Е. Выделение, идентификация, и определение чувствительности к антибиотикам Haemophilus influenzaе. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2000; 2(2): 93-9.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Боронина Л.Г. Лабораторные методы обнаружения, идентификации и определения резистентности к антибиотикам Haemophilus influenzaе. Екатеринбург; 2006.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Гриценко В.А., Мавзютов А.Р., Пашкова Т.М., Карташова О.Л., Тяпаева Я.В., Белозерцева Ю.П. Генетический профиль Staphylococcus aureus, выделенных от бактерионосителей и больных с инфекционно-воспалительной патологией. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2018; (4): 56-62. DOI: http://doi.org/10.36233/0372-9311-2018-4-56-62</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Шмыленко В.А., Бондаренко А.П., Троценко О.Е., Туркутюков В.Б. Частота обнаружения бактерий Moraxella catarrhalis у детей с рекуррентным течением респираторных заболеваний г. Хабаровска в 2016–2017 годах. Бюллетень физиологии и патологии дыхания. 2018; (68): 52-6. DOI: http://doi.org/10.12737/ article_5b18b82fc43524.59761242</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Каравянская Т.Н., Бутакова Л.В. и др. Внутригодовая динамика уровней носительства пневмококка и заболеваемости внебольничной пневмонией в г. Хабаровске в 2015 году. Бюллетень физиологии и патологии дыхания. 2016; (62): 16-21. DOI: http://doi.org/10.12737/23245</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Simell B.I., Auranen K., Käyhty H., Goldblatt D., Dagan R., O'Brien K.L. Pneumococcal Carriage Group. The fundamental link between pneumococcal carriage and disease. Expert Rev. Vaccines. 2012; 11(7): 841-55. DOI: http://doi.org/10.1586/erv.12.53</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е. Эпидемиология назофарингеального носительства пневмококков в семейных очагах. Тихоокеанский медицинский журнал. 2018; (3): 54-7. DOI: http://doi.org/10.17238/PmJ1609-1175.2018.3.54-57</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Таточенко В.К. Пневмококковая инфекция вошла в число управляемых. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2010; (3): 102-8.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
