Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology5210.36233/0372-9311-2016-3-70-74ORIGINAL RESEARCHESОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯCOMPARISON OF DIAGNOSTIC EFFECTIVENESS OF METHODS OF DETECTION OF COXIELLA BURNETII IN BLOOD OF PATIENTS WITH Q FEVER BASED ON AMPLIFICATION OF 16S rRNA GENE FRAGMENTS (STANDARD PCR) AND groEL GENE (REALTIME PCR)СРАВНЕНИЕ ДИАГНОСТИЧЕСКОЙ ЭФФЕКТИВНОСТИ МЕТОДОВ ДЕТЕКЦИИ COXIELLA BURNETII В КРОВИ БОЛЬНЫХ ЛИХОРАДКОЙ КУ НА ОСНОВЕ АМПЛИФИКАЦИИ ФРАГМЕНТОВ ГЕНА 16S рРНК (СТАНДАРТНАЯ ПЦР) И ГЕНА groEL (ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ)PanferovaYu. A.ПанфёроваЮ. А.
Russian Federation
FreilikhmanO. A.ФрейлихманО. А.
Russian Federation
TokarevichN. K.ТокаревичН. К.
Russian Federation
KarpenkoS. F.КарпенкоС. Ф.
Russian Federation
GalimzyanovKh. M.ГалимзяновХ. М.
Russian Federation
Pasteur Research Institute of Epidemiology and MicrobiologyНИИ эпидемиологии и микробиологии им. ПастераAstrakhan State Medical UniversityАстраханский государственный медицинский университет28062016933707410042019Copyright ©; 2016, Panferova Y.A., Freilikhman O.A., Tokarevich N.K., Karpenko S.F., Galimzyanov K.M.Copyright ©; 2016, Панфёрова Ю.А., Фрейлихман О.А., Токаревич Н.К., Карпенко С.Ф., Галимзянов Х.М.2016Panferova Y.A., Freilikhman O.A., Tokarevich N.K., Karpenko S.F., Galimzyanov K.M.Панфёрова Ю.А., Фрейлихман О.А., Токаревич Н.К., Карпенко С.Ф., Галимзянов Х.М.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/52

Aim. Comparison of diagnostic capabilities of 2 variants of PCR for detection of Coxiella burnetii persistence in dynamics of infectious process in patients with Q fever. Materials and methods. 110 samples of clinical material, obtained from patients with Q fever in an endemic region for this infection (Astrakhan region), were studied. The samples were studied in a standard PCR (marker - 16S rRNA gene fragment) and in real-time PCR (RT-PCR) (marker - groEL gene fragment). Results. Both markers were established to be perspective for detection of C. burnetii DNA in clinical material, and RT-PCR detects positive result including late stages of the disease (illness day 21 - 31). Conclusion. This study is the first Russian publication on comparison on different PCR variants for detection of C. burnetii in blood of Q fever patients in dynamics of the infectious process.

Цель. Сравнение диагностических возможностей двух вариантов ПЦР для выявления персистенции Coxiella burnetii в динамике инфекционного процесса у больных лихорадкой Ку. Материалы и методы. Было исследовано 110 проб клинического материала, полученного от больных лихорадкой Ку в эндемичном для данной инфекции регионе (Астраханская область). Пробы были исследованы в стандартной ПЦР (маркер - фрагмент гена 16S рРНК) и в ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ) (маркер - фрагмент гена groEL). Результаты. Было установлено, что оба маркера являются перспективными для обнаружения ДНК С. burnetii в клиническом материале, а РВ-ПЦР выявляет положительный результат, в том числе на поздних сроках заболевания (21 - 31 день болезни). Заключение. Данная работа является первой российской публикацией о сравнении разных вариантов ПЦР для выявления С. burnetii в крови больных Ку-лихорадкой в динамике инфекционного процесса.

Coxiella burnetiiQ feverCoxiella burnetiiPCRreal-time PCRsensitivitydiagnostic effectivenessлихорадка КуПЦРПЦР в режиме реального временичувствительностьдиагностическая эффективностьБармин А.Н., Колчин Е.А., Шуваев Н.С., Дмитриева М.В. Анализ проявления природно-очаговых заболеваний на территории Астраханской обл. Естес. науки. 2012, 3 (40): 44-50.Садретдинов Р.А, Галимзянов Х.М. Гемодинамические типы микроциркуляции у больных инфекционными лихорадками. Фундамент, исслед. 2010, 7: 63-66.Фрейлихман О.А., Панфёрова Ю.А., Токаревич Н.К. Совершенствование метода детекции Coxiella burnetii в биологическом материале на основе амплификации гена groEL. Журн. микробиол. 2010, 4: 71-74.Arricau-Bouvery N., HauckY., BejaouiA. etal. Molecular characterisation of Coxiella burnetii isolates by infrequent restriction site-PC Rand MLVA typing. BMC Microbiology. 2006,6 (38). doi: 10.1186/1471-2180-6-38.Bielawska-Drozd A., Cieslik P., Mirski T. et al. Q fever - selected issues. Ann. Agric. Environmental Med. 2013, 20 (2): 222-232.Freylikhman O., Tokarevich N., Suvorov A. et al. persistence in three generation of mice after application of live attenuated human M-44 vaccine against Q fever. Ann. N.Y. Acad. Sci. 2003, 990: 496-499.Jaton K., Peter O., Raoult D. et al. Development of a high throughput PCR to detect Coxiella burnetii and its application in a diagnostic laboratory over a 7-year period. New Microbes New Infect. 2013, 1 (1): 6-12. doi: 10/1002/2052-2975.8.MarrieT., Raoult D. Qfever-a review and issues for the next century. Int. J. Antimicrob. Agents. 1997, 8 (3): 145-161. doi: 10.1016/S0924-8579(96)00369-X.Maurin M., Raoult D. Q fever. Clin. Microbiol. Rev. 1999, 12 (4): 518-553.Raele D., Garofolo G., Galante D. et al. Molecular detection of Coxiella burnetii using an alternative loop-mediated isothermal amplification assay. Veterinaria Italiana. 2015, 51 (1): 73-78. doi: 10.12834/VetIt.3041168.4.Tilburg J., Melchers W., Pettersson A. et al. Interlaboratory evaluation of different extraction and real-time PCR methods for detection of Coxiella burnetii in serum. J. Clin. Microbiol. 2010, 48 (11): 3924-3927. doi: 10.1128/JCM.01006-10.van Schaik E., Chen C., Mertens K. et al. Molecular pathogenesis of obligate intracellular bacterium. Nat. Rev. Microbiol. 2013, 11 (8): 561-573. doi: 10.1038/nrmicro3049.