<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0372-9311</issn><issn publication-format="electronic">2686-7613</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Central Research Institute for Epidemiology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">240</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.36233/0372-9311-2018-1-3-9</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL RESEARCHES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">FUNCTIONAL GROUPS OF BIFIDOFLORA OF INTESTINAL MICROBIOTA IN ASSOCIATIVE SYMBIOSIS OF HUMAN</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ГРУППЫ БИФИДОФЛОРЫ КИШЕЧНОЙ МИКРОБИОТЫ В АССОЦИАТИВНОМ СИМБИОЗЕ ЧЕЛОВЕКА</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bukharin</surname><given-names>O. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бухарин</surname><given-names>О. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Ivanova</surname><given-names>E. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Иванова</surname><given-names>Е. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Perunova</surname><given-names>N. B.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Перунова</surname><given-names>Н. Б.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Nikiforov</surname><given-names>I. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Никифоров</surname><given-names>И. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Cellular and Intracellular Symbiosis</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2018-02-28" publication-format="electronic"><day>28</day><month>02</month><year>2018</year></pub-date><volume>95</volume><issue>1</issue><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>3</fpage><lpage>9</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2019-04-10"><day>10</day><month>04</month><year>2019</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2018, Bukharin O.V., Ivanova E.V., Perunova N.B., Nikiforov I.A.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2018, Бухарин О.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б., Никифоров И.А.</copyright-statement><copyright-year>2018</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Bukharin O.V., Ivanova E.V., Perunova N.B., Nikiforov I.A.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Бухарин О.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б., Никифоров И.А.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/240">https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/240</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Aim. Aim of the research is the identification of functional groups of human gut bifidoflora based on analysis of the spectrum of metabolites features, proteome, bioprofile, immunoregulatory properties and the ability to differentiate «self/non-self» among the associative microbiota. Materials and methods. The materials are 260 strains ofbifidobacteria isolated from 122 intestinal microsymbiocenoses. Experimental studies were carried out using bacteriological, chromatographic and immunological methods. Statistical processing of material is carried out by means of the package Statistica 10.0 using of k-cluster analysis and discriminant method. Results. As a result ofthe work, 3 clusters containing strains of various types of bifidobacteria were identified. The first cluster was represented by B. bifidum and was characterized by the antipeptide activity of the strains with respect to FNO-a and INF-y, IL-10. In the second cluster of the B. longum culture predominated, where the parameters of the backbone factor of microsymbiocenosis, the ability to microbial recognition, antagonistic activity and production of acetic acid were significant. In the third cluster the species composition of bifidobacteria was diverse and products of butyric, caproic acids and their isoforms were the informative tests. Conclusion. The key function of bifido-flora in the regulation of the homeostasis of the intestinal biotope is realized by the formation of functional clusters, among which the first group participates in the formation of the cytokine balance, the second group is responsible for the discrimination of associative microbiota and direct protection of the biotope from pathogens, and the third is necessary to maintain the barrier metabolic function of enterocytes in the human large intestine.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Цель. Определение функциональных групп бифидофлоры толстого кишечника человека на основе анализа особенностей спектра метаболитов, протеома, биопрофиля, иммунорегуляторных свойств и способности проводить дифференцировку «свой-чужой» среди ассоциантов. Материалы и методы. Материалом служили 260 штаммов бифидобактерий, выделенных из 122 кишечных микросимбиоценозов. Экспериментальные исследования проводились с использованием бактериологических, хроматографического и иммунологических методов. Статистическая обработка материала выполнена средствами пакета Statistica 10.0 с использованием k-кластерного анализа и дискриминантного метода. Результаты. В результате работы определены 3 кластера, содержащих штаммы различных видов бифидобактерий. Первый кластер был представлен В. bifidum и характеризовался наличием антипептидной активности штаммов в отношении FNO-a и INF-y, IL-10. Во втором кластере преобладали культуры В. longum, где значимыми были параметры системообразующего фактора микросимбиоценоза, способность к микробному распознаванию, антагонистическая активность и продукция уксусной кислоты. В третьем кластере видовой состав бифидобактерий был разнообразен, а информативными тестами явились - продукция штаммами масляной, капроновой кислот и их изоформ. Заключение. Ключевая функция бифидофлоры в регуляции гомеостаза кишечного биотопа реализуется за счет образования функциональных кластеров, среди которых первая группа участвует в формировании цитокинового баланса, вторая - ответственна за дискриминацию ассоциативной микробиоты и прямую защиту биотопа от патогенов, а третья необходима для поддержания барьерной метаболической функции энтероцитов в толстом кишечнике человека.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>bifidobacteria</kwd><kwd>metabolic profile</kwd><kwd>persistence</kwd><kwd>cytokines</kwd><kwd>microbial «self/non-self» discrimination</kwd><kwd>strain specifity</kwd><kwd>associative symbiosis</kwd><kwd>homeostasis</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>бифидобактерии</kwd><kwd>метаболический профиль</kwd><kwd>персистенция</kwd><kwd>цитокины</kwd><kwd>микробное распознавание «свой-чужой»</kwd><kwd>штаммоспепифичность</kwd><kwd>ассоциативный симбиоз</kwd><kwd>гомеостаз</kwd></kwd-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Лобакова Е.С., Перунова Н.Б., Усвяцов Б.Я., Черкасов С.В. Симбиоз и его роль в инфекции. Екатеринбург, УрО РАН, 2011.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Бифидофлора при ассоциативном симбиозе человека. Екатеринбург, УрО РАН, 2014.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Микросимбиоценоз. Екатеринбург, УрО РАН, 2014.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б., Чайникова И.Н. Роль бифидобактерий в формировании иммунного гомеостаза человека. Журн. микробиол. 2015, 6: 98-104.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Aires J., Anglade R, Baraige F. et al. Proteomic comparison of the cytosolic proteins of three Bifidobacterium longum human isolates and B. longum NCC2705. BMC Microbiology. 2010, 10: 29.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Besten G., van Eunen K., Groen A. et al. The role of short-chain fatty acids in the interplay between diet, gut microbiota, and host energy metabolism. J. Lipid Res. 2013, 54 (9): 23252340.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Campana R., van Hemert S., Baffone W. Strain-specific probiotic properties of lactic acid bacteria and their interference with human intestinal pathogens invasion. Gut Pathog. 2017, 9:12.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Cheikhyoussef A., Pogori N., Chen H. Antimicrobial activity and partial characterization of bacteriocin-like inhibitory substances (BLIS) produced by Bifidobacterium infantis BCRC 14602. Food Control. 2009,20: 553-559.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Ferrario C., Duranti S., Milani C. et al. Exploring amino acid auxotrophy in Bifidobacterium bifidum PRL2010. Front. Microbiol. 2015,6: 1331.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Kamada N., Nunez G. Role ofthe gut microbiota in the development and function oflymphoid cells. J. Immunol. 2013, 190 (4): 1389-1395.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Martinez FA., Balciunas E.M., Converti A. et al. Bacteriocin production by Bifidobacterium spp. A review. Biotechnol. Adv. 2013, 31 (4): 482-488.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Milani C., Lugli G.A., Duranti S. et al. Genomic encyclopedia of type strains of the genus bifidobacterium. Appl. Environ. Microbiol. 2014, 80: 6290-6302.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Sampson T.R., Mazmanian S.K. Control ofbrain development, function, and behavior by the microbiome. Cell Host Microbe. 2015, 17 (5): 565-576.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Sun Y., O’Riordan M.X.D. Regulation of bacterial pathogenesis by intestinal short-chain fatty acids. Adv. Appl. Microbiol. 2013, 85:93-118.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Turroni F., Tavemiti V, Ruas-Madiedo P.etal. Bifidobacterium bifidum PRL2010 modulates the host innate immune response. Appl. Environ. Microbiol. 2014, 80 (2): 730-740.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
