Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology1878310.36233/0372-9311-628SMVGQJREVIEWSОБЗОРЫReview ArticleOrganoid (3D-cell) cultures in the assessment of cross-species virus transmissionОрганоидные (3D-клеточные) культуры в оценке способности вирусов к межвидовым переходамhttps://orcid.org/0000-0002-4315-6959KuznetsovaTatyana A.КузнецоваТатьяна Алексеевна
Russian Federation

Dr. Sci. (Med.), main researcher, Laboratory of immunobiological preparates

д-р мед. наук, г. н. с. лаб. иммунобиологических препаратов

takuznets@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7000-5833GalkinaIrina V.ГалкинаИрина Вячеславовна
Russian Federation

Cand. Sci. (Med.), leading researcher, International scientific and educational center for biosafety, Department of epidemiology, microbiology and parasitology, School of Medicine and Life Sciences

канд. мед. наук, в. н. с. Международного научно-образовательного центра биобезопасности при кафедре эпидемиологии, микробиологии и паразитологии Школы медицины и наук о жизни

galkina333@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1981-1079KryzhanovskySergey P.КрыжановскийСергей Петрович
Russian Federation

Dr. Sci. (Med.), Deputy Chairman for scientific work, Presidium of the Far Eastern Branch of the Russian Academy of Sciences

д-р мед. наук, зам. председателя Президиума Дальневосточного отделения Российской академии наук по научной работе

kryzhanovskiy@hq.febras.ruhttps://orcid.org/0000-0001-8610-7623ShchelkanovMikhail Yu.ЩелкановМихаил Юрьевич
Russian Federation

Dr. Sci. (Biol.), Director, G.P. Somov Institute of Epidemiology and Microbiology; Head, Department of epidemiology, microbiology and parasitology, School of medicine and life sciences, Far Eastern Federal University

д-р биол. наук, директор НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова; зав. каф. эпидемиологии, микробиологии и паразитологии Школы медицины и наук о жизни Дальневосточного федерального университета

adorob@mail.ruG.Р. Somov Institute of Epidemiology and MicrobiologyНаучно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова РоспотребнадзораFar Eastern Federal UniversityДальневосточный федеральный университетFar Eastern Branch of the Russian Academy of SciencesДальневосточное отделение Российской академии наук1507202510233703801103202511072025Copyright ©; 2025, Kuznetsova T.A., Galkina I.V., Kryzhanovsky S.P., Shchelkanov M.Y.Copyright ©; 2025, Кузнецова Т.А., Галкина И.В., Крыжановский С.П., Щелканов М.Ю.2025Kuznetsova T.A., Galkina I.V., Kryzhanovsky S.P., Shchelkanov M.Y.Кузнецова Т.А., Галкина И.В., Крыжановский С.П., Щелканов М.Ю.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/18783

The aim of this review is to characterize the possibilities of using organoid (3D-cell) cultures to assess the ability of viruses for cross-species transmission.

Sources from Web of Science, PubMed, Scopus, Elsevier, Google Scholar, and eLIBRARY.RU databases as of February 2025 were used.

In addition to classical methods of epidemiologic diagnostics and surveillance of viral infections, molecular genetic technologies (polymerase chain reaction and sequencing) are widely used in the epidemiologic surveillance system. As the best world experience shows, the use of organoid (3D-cell) cultures is promising in addressing these issues. This review analyzes data on the use of organoid (3D-cell) cultures of human and animal origin to study immunopathogenesis, as well as to assess the ability of a number of viruses (SARS-CoV-2, influenza, Zika, measles, etc.) for cross-species transmission, which determines their pandemic potential

Цель обзора — охарактеризовать возможности применения органоидных (3D-клеточных) культур для оценки способности вирусов к межвидовым переходам.

Использованы источники из баз данных Web of Science, PubMed, Scopus, Elsevier, Google Scholar и eLIBRARY.RU по состоянию на февраль 2025 г.

В работе системы эпидемиологического надзора, помимо классических методов эпидемиологической диагностики и надзора за вирусными инфекциями, широко применяются молекулярно-генетические технологии (полимеразная цепная реакция и секвенирование). Как показывает передовой мировой опыт, в решении этих вопросов перспективным является использование органоидных (3D-клеточных) культур. В настоящем обзоре проанализированы данные по применению органоидных (3D-клеточных) культур человеческого и животного происхождения для изучения иммунопатогенеза, а также оценки способности ряда вирусов (SARS-CoV-2, гриппа, Зика, кори и др.) к межвидовым переходам, что обусловливает их пандемический потенциал.

revieworganoid (3D-cell) culturesvirusescross-species transmissionepidemiologyобзорорганоидные (3D-клеточные) культурывирусымежвидовые переходыэпидемиологияGovernment of the Russian FederationПравительство Российской Федерации141-00089-21-00Попова А.Ю., Зайцева Н.В., Май И.В. Опыт методической поддержки и практической реализации риск-ориентированной модели санитарно-эпидемиологического надзора: 2014–2017 гг. Гигиена и санитария. 2018;97(1):5–9. Popova A.Yu., Zaytseva N.V., May I.V. Experience of methodological support and practical implementation of the risk-oriented model of sanitary-epidemiological surveillance in 2014–2017. Gigiena i Sanitaria (Hygiene and Sanitation, Russian journal). 2018;97(1):5–9. DOI: https://doi.org/10.18821/0016-9900-2018-97-1-5-9 EDN: https://elibrary.ru/ywrndrЩелканов М.Ю., Ананьев В.Ю., Кузнецов В.В., Шуматов В.Б. Ближневосточный респираторный синдром: когда вспыхнет тлеющий очаг? Тихоокеанский медицинский журнал. 2015;(2):94–8. Shchelkanov M.Yu., Ananiev V.Yu., Kuznetsov V.V., Shumatov V.B. Middle Eastr espiratory syndrome: when will smouldering focus outbreak? Pacific Medical Journal. 2015;(2):94–8. EDN: https://elibrary.ru/ulfnffЩелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Львов Д.К. Коронавирусы человека (Nidovirales, Coronaviridae): возросший уровень эпидемической опасности. Лечащий врач. 2013;(10):49–54. Shchelkanov M.Yu., Kolobukhina L.V., Lvov D.K. Human coronaviruses (Nidovirales, Coronaviridae): increased level of epidemic threat. Lechaschi Vrach. 2013;(10):49–54. EDN: https://elibrary.ru/takhvrЩелканов М.Ю., Ананьев В.Ю., Кузнецов В.В., Шуматов В.Б. Эпидемическая вспышка Ближневосточного респираторного синдрома в Республике Корея (май-июль 2015 г.): причины, динамика, выводы. Тихоокеанский медицинский журнал. 2015;(3):89–93. Shchelkanov M.Yu., Ananiev V.Yu., Kuznetsov V.V., Shumatov V.B. Epidemic outbreak of MERS in the Republic of Korea (May-July, 20015): reasons, dynamics, conclusions. Pacific Medical Journal. 2015;(3):89–93. EDN: https://elibrary.ru/ulhaerПопова А.Ю., Щелканов М.Ю., Крылова Н.В. и др. Генотипический портрет SARS-CoV-2 на территории Приморского края в период пандемии COVID-19. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024;101(1):19–35. Popova A.Yu., Shchelkanov M.Yu., Krylova N.V., et al. Genotypic portrait of SARS-CoV-2 in Primorsky Krai during the COVID-19 pandemic. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2024;101(1):19–35. DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-497 EDN: https://elibrary.ru/pujffaРудаков Н.В., Пеньевская Н.А. Федеральный проект «Санитарный щит страны — безопасность для здоровья (предупреждение, выявление, реагирование)». Национальные приоритеты России. 2024;(2):47–59. Rudakov N.V., Penyevskaya N.A. Federal project "The country’s sanitary shield – health safety (prevention, detection, response)" is the most important stage in the implementation of the national security strategy of the Russian Federation. National Priorities of Russia. 2024;(2):47–59. EDN: https://elibrary.ru/beaecfАкимкин В.Г., Семененко Т.А., Хафизов К.Ф. и др. Стратегия геномного эпидемиологического надзора. Проблемы и перспективы. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024;101(2):163–72. Akimkin V.G., Semenenko T.A., Khafizov K.F. Genomic surveillance strategy. Problems and perspectives. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2024;101(2):163–72. DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-507 EDN: https://elibrary.ru/mymnikКузнецова Т.А., Беседнова Н.Н., Алиев М.Р., Щелканов М.Ю. Клеточные культуры в вирусологии: от прошлого к будущему. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024;101(1):143–53. Kuznetsova T.A., Besednova N.N., Aliev M.R., Shchelkanov M.Yu. The cell cultures in virology: from the past to the future. Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology. 2024;101(1):143–53. DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-421 EDN: https://elibrary.ru/xsaecyDolskiy A.A., Grishchenko I.V., Yudkin D.V. Cell cultures for virology: usability, advantages, and prospects. Int. J. Mol. Sci. 2020;21(21):7978. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms21217978Jonas O., Seifman R. Do we need a global virome project? Lancet Glob. Health. 2019;7(10):e1314–6. DOI: https://doi.org/10.1016/S2214-109X(19)30335-3Carlson C.J., Albery G.F., Merow C., et al. Climate change increases cross-species viral transmission risk. Nature. 2022;607(7919):555–62. DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-022-04788-wChoudhury P.R., Saha T., Goel S., et al. Cross-species virus transmission and its pandemic potential. Bull. Natl Res. Cent 2022;46(1):18. DOI: https://doi.org/10.1186/s42269-022-00701-7Кузнецова Т.А., Алиев М.Р., Михалко А.А., Щелканов М.Ю. 3D клеточные культуры: перспективы использования в вирусологии. Инфекция и иммунитет. 2025;14(6):1045–62. Kuznetsova T.A., Aliev M.R., Mikhalko A.A., Shchelkanov M.Yu. 3D cell cultures: prospects for use in virology. Russian Journal of Infection and Immunity. 2025; 14(6):1045–62. DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-DCC-17656 EDN: https://elibrary.ru/ucpvibPajkrt D., Krenn V., Rocha-Pereira J. Editorial: Human organoid technology for virus research. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2023;13:1155252. DOI: https://doi.org/10.3389/fcimb.2023.1155252Yan J., Monlong J., Cougoule C., et al. Mapping the scientific output of organoids for animal and human modeling infectious diseases: a bibliometric assessment. Vet. Res. 2024;55(1):81. DOI: https://doi.org/10.1186/s13567-024-01333-7Chen K.G., Mallon B.S., Park K., et al. Pluripotent stem cell platforms for drug discovery. Trends Mol. Med. 2018;24(9):805–20. DOI: https://doi.org/10.1016/j.molmed.2018.06.009Liu S., Xie B., Song X., et al. Self-formation of RPE spheroids facilitates enrichment and expansion of hiPSC-derived RPE generated on retinal organoid induction platform. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2018;59(13): 5659–69. DOI: https://doi.org/10.1167/iovs.1723613Suarez-Martinez E., Suazo-Sanchez I., Celis-Romero M., Carnero A. 3D and organoid culture in research: physiology, hereditary genetic diseases and cancer. Cell Biosci. 2022;12(1):39. DOI: https://doi.org/10.1186/s13578-022-00775-wLancaster M.A., Knoblich J.A. Generation of cerebral organoids from human pluripotent stem cells. Nat. Protoc. 2014;9(10):2329–40. DOI: https://doi.org/10.1038/nprot.2014.158Yakoub A.M., Sadek M. Development and characterization of human cerebral organoids: an optimized protocol. Cell Transplant. 2018;27(3):393–406. DOI: https://doi.org/10.1177/0963689717752946Qian X., Jacob F., Song M.M., et al. Generation of human brain region-specific organoids using a miniaturized spinning bioreactor. Nat. Protoc. 2018;13(3):565–80. DOI: https://doi.org/10.1038/nprot.2017.152Hematian A., Sadeghifard N., Mohebi R., et al. Traditional and modern cell culture in virus diagnosis. Osong Public Health Res. Perspect. 2016;7(2):77–82. DOI: https://doi.org/10.1016/j.phrp.2015.11.011De Oliveira L.F., Filho D.M., Marques B.L., et al. Organoids as a novel tool in modelling infectious diseases. Semin. Cell Dev. Biol. 2023;144:87–96. DOI: https://doi.org/10.1016/j.semcdb.2022.09.003Sridhar A., Simmini S., Ribeiro C.M.S., et al. A perspective on organoids for virology research. Viruses. 2020;12(11):1341. DOI: https://doi.org/10.3390/v12111341Barrila J., Crabbé A., Yang J., et al. Modeling host-pathogen interactions in the context of the microenvironment: three-dimensional cell culture comes of age. Infect. Immun. 2018;86(11):e00282-18. DOI: https://doi.org/10.1128/IAI.00282-18Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Alkhovsky S.V., Deryabin P.G. Zoonotic Viruses of Northern Eurasia. Taxonomy and Ecology. Academic Press;2015. DOI: https://doi.org/10.1016/C2014-0-01020-9Щелканов М.Ю., Леонова Г.Н., Галкина И.В., Андрюков Б.Г. У истоков концепции природной очаговости. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2021;(5):16–25. Shchelkanov M.Yu., Leonova G.N., Galkina I.V., Andryukov B.G. At the origins of the natural focality concept. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2021;(5):16–25. DOI: https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-338-5-16-25 EDN: https://elibrary.ru/kfstljЛьвов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.;2013. Lvov D.K., ed. Viruses and Viral Infections of Humans and Animals. Handbook of Virology. Moscow;2013. DOI: https://elibrary.ru/tlzmhfMusso D., Ko A.I., Baud D. Zika virus infection — after the pandemic. N. Engl. J. Med. 2019;381(15):1444–57. DOI: https://doi.org/10.1056/NEJMra1808246Cugola F.R., Fernandes I.R., Russo F.B., et al. The Brazilian Zika virus strain causes birth defects in experimental models. Nature. 2016;534(7606):267–71. DOI: https://doi.org/10.1038/nature18296Schultz E.M., Jones T.J., Xu S., et al. Cerebral organoids derived from a Parkinson's patient exhibit unique pathogenesis from Chikungunya virus infection when compared to a non-Parkinson's patient. Pathogens. 2021;10(7):913. DOI: https://doi.org/10.3390/pathogens10070913Tatsuo H., Ono N., Tanaka K., Yanagi Y. SLAM (CDw150) is a cellular receptor for measles virus. Nature. 2000;406(6798): 893–7. DOI: https://doi.org/10.1038/35022579Noyce R.S., Richardson C.D. Nectin 4 is the epithelial cell receptor for measles virus. Trends Microbiol. 2012;20(9):429–39. DOI: https://doi.org/10.1016/j.tim.2012.05.006Donadoni M., Cakir S., Bellizzi A., et al. Modeling HIV-1 infection and NeuroHIV in hiPSCs-derived cerebral organoid cultures. J. Neurovirol. 2024;30(4):362–79. DOI: https://doi.org/10.1007/s13365-024-01204-zWatanabe Y., Kimura I., Hashimoto R., et al. Virological characterization of the 2022 outbreak-causing monkeypox virus using human keratinocytes and colon organoids. J. Med. Virol. 2023;95(6):e28827. DOI: https://doi.org/10.1002/jmv.28827Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Любченко Е.Н. и др. Рукокрылые: общая характеристика отряда. Владивосток;2021. Shchelkanov M.Yu., Tabakaeva T.V., Lyubchenko E.N., et al. Chiropterans: General Characteristics of the Order. Vladivostok;2021. DOI: https://doi.org/10.24866/7444-5119-6Antonucci J., Gehrke L. Cerebral organoid models for neurotropic viruses. ACS Infect. Dis. 2019;5(12):1976–9. DOI: https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.9b00339Щелканов М.Ю., Магассуба Н.Ф., Дедков В.Г. и др. Природный резервуар филовирусов и типы связанных с ними эпидемических вспышек на территории Африки. Вестник Российской академии медицинских наук. 2017;72(2):112–9. Shchelkanov M.Yu., Magassouba N.F., Dedkov V.G., et al. Natural reservoir of filoviruses and types of associated epidemic outbreaks in Africa. Annals of the Russian Academy of Medical Sciences. 2017;72(2):112–9. DOI: https://doi.org/10.15690/vramn803 EDN: https://elibrary.ru/yntsevWerschler N., Penninger J. Generation of human blood vessel organoids from pluripotent stem cells. J. Vis. Exp. 2023;(191). DOI: https://doi.org/10.3791/64715Щелканов М.Ю., Попова А.Ю., Дедков В.Г. и др. История изучения и современная классификация коронавирусов (Nidovirales: Coronaviridae). Инфекция и иммунитет. 2020;10(2):221–46. Shchelkanov M.Yu., Popova A.Yu., Dedkov V.G., et al. History of investigation and current classification of coronaviruses (Nidovirales: Coronaviridae). Russian Journal of Infection and Immunity. 2020;10(2):221–46. DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-HOI-1412 EDN: https://elibrary.ru/kziwrqHuang X.Y., Chen Q., Sun M.X., et al. A pangolin-origin SARS-CoV-2-related coronavirus: infectivity, pathogenicity, and cross-protection by preexisting immunity. Cell Discov. 2023;9(1):59. DOI: https://doi.org/10.1038/s41421-023-00557-9Han Y., Yang L., Lacko L.A., Chen S. Human organoid models to study SARS-CoV-2 infection. Nat. Methods. 2022;19(4):418–28. DOI: https://doi.org/10.1038/s41592-022-01453-ySiddiqi H.K., Libby P., Ridker P.M. COVID-19 — a vascular disease. Trends Cardiovasc. Med. 2021;31(1):1–5. DOI: https://doi.org/10.1016/j.tcm.2020.10.005Ramani A., Muller L., Ostermann P.N., et al. SARS-CoV-2 targets neurons of 3D human brain organoids. EMBO J. 2020;39(20):e106230. DOI: https://doi.org/10.15252/embj.2020106230Zhou J., Li C., Liu X., et al. Infection of bat and human intestinal organoids by SARS-CoV-2. Nat. Med. 2020;26(7):1077–83. DOI: https://doi.org/10.1038/s41591-020-0912-6Щелканов М.Ю., Кириллов И.М., Шестопалов А.М. и др. Эволюция вируса гриппа А/H5N1 (1996–2016). Вопросы вирусологии. 2016;61(6):245–56. Shchelkanov M.Yu., Kirillov I.M., Shestopalov A.M., et al. Evolution of influenza A/H5N1 virus (1996–2016). Problems of Virology. 2016;61(6):245–56. DOI: https://doi.org/10.18821/0507-4088-2016-61-6-245-256 EDN: https://elibrary.ru/xehnfhЛьвов Д.К., Бурцева Е.И., Щелканов М.Ю. и др. Распространение нового пандемического вируса гриппа A(H1N1)v в России. Вопросы вирусологии. 2010;55(3):4–9. Lvov D.K., Burtseva E.I., Shchelkanov M.Yu., et al. Spread of new pandemic influenza A(H1N1)v virus in Russia. Problems of Virology. 2010;55(3):4–9. EDN: https://elibrary.ru/muekipChen Y.W., Huang S.X., de Carvalho A.L.R.T., et al. A three-dimensional model of human lung development and disease from pluripotent stem cells. Nat. Cell Biol. 2017;19(5):542–9. DOI: https://doi.org/10.1038/ncb3510Tang H., Abouleila Y., Si L., et al. Human organs-on-chips for virology. Trends Microbiol. 2020;28(11):934–46. DOI: https://doi.org/10.1016/j.tim.2020.06.005Hui K.P.Y., Ching R.H.H., Chan S.K.H., et al. Tropism, replication competence, and innate immune responses of influenza virus: an analysis of human airway organoids and ex vivo bronchus cultures. Lancet Respir. Med. 2018;6(11):846–54. DOI: https://doi.org/10.1016/S2213-2600(18)30236-4Long J.S., Mistry B., Haslam S.M., Barclay W.S. Host and viral determinants of influenza A virus species specificity. Nat. Rev. Microbiol. 2019;17(2):67–81. DOI: https://doi.org/10.1038/s41579-018-0115-zBhowmick R., Derakhshan T., Liang Y., et al. A three-dimensional human tissue-engineered lung model to study influenza A infection. Tissue Eng. Part A. 2018;24(19-20):1468–80. DOI: https://doi.org/10.1089/ten.tea.2017.0449Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Бовин Н.В. и др. Корреляция между рецепторной специфичностью штаммов пандемического вируса гриппа А (H1N1) pdm09, изолированных в 2009–2011 гг., структурой рецептор-связывающего сайта и вероятностью развития летальной первичной вирусной пневмонии. Вопросы вирусологии. 2012;57(1):14–20. Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Bovin N.V., et al. Correlation between the receptor specificity of pandemic influenza a (H1N1)pdm09 virus strains isolated in 2009–2011 and the structure of the receptor-binding site and the probability of fatal primary viral pneumonia. Problems of Virology. 2012;57(1):14–20. EDN: https://elibrary.ru/oximwzShaheen M.N.F. The concept of one health applied to the problem of zoonotic diseases. Rev. Med. Virol. 2022;32(4):e2326. DOI: https://doi.org/10.1002/rmv.2326Tomori O., Oluwayelu D.O. Domestic animals as potential reservoirs of zoonotic viral diseases. Annu. Rev. Anim. Biosci. 2023;11:33–55. DOI: https://doi.org/10.1146/annurev-animal-062922-060125Bourdon G., Cadoret V., Charpigny G., et al. Progress and challenges in developing organoids in farm animal species for the study of reproduction and their applications to reproductive biotechnologies. Vet. Res. 2021;52(1):42. DOI: https://doi.org/10.1186/s13567-020-00891-wJaewon C., Eun-Hye H., Hyun-Jeong K. Disease modeling in organoid cultures: a new tool for studying viruses. Organoid. 2022;2:e15. DOI: https://doi.org/10.51335/organoid.2022.2.e15Sang Y., Miller L.C., Nelli R.K., Giménez-Lirola L.G. Harness organoid models for virological studies in animals: а cross-species perspective. Front. Microbiol. 2021;12:725074. DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.725074Elbadawy M., Saito N., Kato Y., et al. Establishment of a bat lung organoid culture model for studying bat-derived infectious diseases. Sci. Rep. 2025;15(1):4035. DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-025-88621-0Schutgens F., Clevers H. Human organoids: tools for understanding biology and treating diseases. Annu. Rev. Pathol. 2020;15:211–34. DOI: https://doi.org/10.1146/annurev-pathmechdis-012419-032611Wilson S.S., Mayo M., Melim T., et al. Optimized culture conditions for improved growth and functional differentiation of mouse and human colon organoids. Front. Immunol. 2021;11:547102. DOI: https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.547102Holthaus D., Delgado-Betancourt E., Aebischer T., et al. Harmonization of protocols for multi-species organoid platforms to study the intestinal biology of toxoplasma gondii and other protozoan infections. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2021;10:610368. DOI: https://doi.org/10.3389/fcimb.2020.610368Li H., Wang X., Wang Y., et al. Cross-species single-cell transcriptomic analysis reveals divergence of cell composition and functions in mammalian ileum epithelium. Cell Regen. 2022;11(1):19. DOI: https://doi.org/10.1186/s13619-022-00118-7Corrò C., Novellasdemunt L., Li V.S.W. A brief history of organoids. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2020;319(1):C151–65. DOI: https://doi.org/10.1152/ajpcell.00120.2020Hofer M., Lutolf M.P. Engineering organoids. Nat. Rev. Mater. 2021;6(5):402–20. DOI: https://doi.org/10.1038/s41578-021-00279-yGabriel V., Zdyrski C., Sahoo D.K., et al. Adult animal stem cell-derived organoids in biomedical research and the one health paradigm. Int. J. Mol. Sci. 2024;25(2):701. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms25020701Dawson H.D., Sang Y., Lunney J. K. Porcine cytokines, chemokines and growth factors: 2019 update. Res. Vet. Sci. 2020;131:266–300. DOI: https://doi.org/10.1016/j.rvsc.2020.04.022Kar S.K., Wells J.M., Ellen E.D., et al. Organoids: a promising new in vitro platform in livestock and veterinary research. Vet. Res. 2021;52(1):43. DOI: https://doi.org/10.1186/s13567-021-00904-2Seeger B. Farm animal-derived models of the intestinal epithelium: recent advances and future applications of intestinal organoids. Altern. Lab. Anim. 2020;48(5-6):215–33. DOI: https://doi.org/10.1177/0261192920974026Pain B. Organoids in domestic animals: with which stem cells? Vet. Res. 2021;52(1):38. DOI: https://doi.org/10.1186/s13567-021-00911-3Luo H., Zheng J., Chen Y., et al. Utility evaluation of porcine enteroids as PDCoV infection model in vitro. Front. Microbiol. 2020;11:821. DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.00821Li Y., Yang N., Chen J., et al. Next-generation porcine intestinal organoids: an apical-out organoid model for swine enteric virus infection and immune response investigations. J. Virol. 2020; 94(21):e01006–20. DOI: https://doi.org/10.1128/JVI.01006-20Topfer E., Pasotti A., Telopoulou A., et al. Bovine colon organoids: from 3D bioprinting to cryopreserved multi-well screening platforms. Toxicol. In Vitro. 2019;61:104606. DOI: https://doi.org/10.1016/j.tiv.2019.104606Liu M., Yu W., Jin J., et al. Copper promotes sheep pancreatic duct organoid growth by activation of an antioxidant protein 1-dependent MEK-ERK pathway. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2020;318(4):C806–16. DOI: https://doi.org/10.1152/ajpcell.00509.2019Ishimura A., Iwatsuki K., Imai H. Establishment of intestinal organoids from common marmosets. Organoids. 2025;4(1):3. DOI: https://doi.org/10.3390/organoids4010003Penning L., van den Boom R. Companion animal organoid technology to advance veterinary regenerative medicine. Front. Vet. Sci. 2023;10:1032835. DOI: https://doi.org/10.3389/fvets.2023.1032835Sahoo D. Canine intestinal organoids as a novel in vitro model of intestinal drug permeability: a proof-of-concept study. Cells. 2023;12(9):1269. DOI: https://doi.org/10.3390/cells12091269Haaker M.W., Kruitwagen H.S., Vaandrager A.B., et al. Identification of potential drugs for treatment of hepatic lipidosis in cats using an in vitro feline liver organoid system. J. Vet. Intern. Med. 2020;34(1):132–8. DOI: https://doi.org/10.1111/jvim.15670Conceicao C., Thakur N., Human S., et al. The SARS-CoV-2 Spike protein has a broad tropism for mammalian ACE2 proteins. PLoS Biol. 2020;18(12):e3001016. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001016Sang E.R., Tian Y., Gong Y., et al. Integrate structural analysis, isoform diversity, and interferon-inductive propensity of ACE2 to predict SARS-CoV2 susceptibility in vertebrates. Heliyon. 2020;6(9):e04818. DOI: https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2020.e04818Zhang B.Z., Chu H., Han S., et al. SARS-CoV-2 infects human neural progenitor cells and brain organoids. Cell Res. 2020;30(10):928–31. DOI: https://doi.org/10.1038/s41422-020-0390-x