<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0372-9311</issn><issn publication-format="electronic">2686-7613</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Central Research Institute for Epidemiology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">14188</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">MONITORING FOR NEISSERIA MENINGITIDIS SPECIES USING SEQUENCING OF VARIABLE FRAGMENTS OF SURFACE PROTEINS FetA AND PorA GENES</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>МОНИТОРИНГ БАКТЕРИЙ ВИДА NEISSERIA MENINGITIDIS НА ОСНОВАНИИ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ВАРИАБЕЛЬНЫХ ФРАГМЕНТОВ ПОВЕРХНОСТНЫХ БЕЛКОВ FetA И PorA</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Mironov</surname><given-names>K. O</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Миронов</surname><given-names>К. О</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Platonov</surname><given-names>A. E</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Платонов</surname><given-names>А. Е</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff4"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Koroleva</surname><given-names>I. S</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Королева</surname><given-names>И. С</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff4"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Tagachenkova</surname><given-names>T. A</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Тагаченкова</surname><given-names>Т. А</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff4"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Zakroeva</surname><given-names>I. M</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Закроева</surname><given-names>И. М</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff4"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Zaikin</surname><given-names>V. L</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Заикин</surname><given-names>В. Л</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff4"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Solovyeva</surname><given-names>L. Ya</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Соловьева</surname><given-names>Л. Я</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff4"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Braslavskaya</surname><given-names>S. I</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Браславская</surname><given-names>С. И</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff4"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Shipulin</surname><given-names>G. A</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Шипулин</surname><given-names>Г. А</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff4"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Central Research Institute of Epidemiology</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Центральный НИИ эпидемиологии, Инфекционная клиническая больница №1, Москва</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Infectious Diseases Clinical Hospital No. 1, Moscow, Russia</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Центральный НИИ эпидемиологии, Инфекционная клиническая больница №1, Москва</institution></aff></aff-alternatives><aff id="aff3"><institution>Infectious Diseases Clinical Hospital No. 1, Moscow, Russia</institution></aff><aff id="aff4"><institution>Central Research Institute of Epidemiology</institution></aff><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2009-06-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>06</month><year>2009</year></pub-date><volume>86</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en">NO3 (2009)</issue-title><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>23</fpage><lpage>27</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2023-06-13"><day>13</day><month>06</month><year>2023</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2009, Mironov K.O., Platonov A.E., Koroleva I.S., Tagachenkova T.A., Zakroeva I.M., Zaikin V.L., Solovyeva L.Y., Braslavskaya S.I., Shipulin G.A.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2009, Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Тагаченкова Т.А., Закроева И.М., Заикин В.Л., Соловьева Л.Я., Браславская С.И., Шипулин Г.А.</copyright-statement><copyright-year>2009</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Mironov K.O., Platonov A.E., Koroleva I.S., Tagachenkova T.A., Zakroeva I.M., Zaikin V.L., Solovyeva L.Y., Braslavskaya S.I., Shipulin G.A.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Тагаченкова Т.А., Закроева И.М., Заикин В.Л., Соловьева Л.Я., Браславская С.И., Шипулин Г.А.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/14188">https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/14188</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Aim. To perform advanced antigenic characterization of meningococci belonging to serogroups A and B and circulating in Moscow according to modern nomenclature of Neisseria meningitidis strains. Materials and methods. Method of typing of «VR» fragment of FetA protein together with methods of genetic subtyping and multilocus sequence typing was used. Results. Detailed information about studied strains was inputed in Internet database - http://pubmlst.org/neisseria/. Typing of serogroup B strains did not allow to define dominating variant of «VR» fragment of FetA protein which is in accordance with subtyping data obtained previously. Serogroup A strains were notable for less variability of «VR» fragment variants: 6 variants were detected. For the majority of serogroup A strains, it was possible to trace connection between belonging of the strain to particular genetic subgroup and its revealed antigenic profile. For strains from genetic subgroup VI, antigenic profile P1.5-2, 10; F1-5 detected in 14 (18%) strains was typical, whereas antigenic profile P1.5-2, 10; F3-5 was typical for genetic subgroup X and was detected in 50 (63%) strains. Antigenic profile P1.5-2, 10-67; F3-5 was detected in 5 (6%) strains, and other 10 antigenic profiles were revealed in one strain each. Conclusion. Prevalence of strains with antigenic profile P1.5-2, 10; F3-5 is explained by change of predominant genetic subgroup from subgroup VI to subgroup X in Moscow population serogroup A meningococci observed after 2003.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Цель. Проведение расширенной антигенной характеристики менингококков серогрупп А и В, циркулирующих на территории Москвы, в соответствии с современной номенклатурой обозначения штаммов Neisseria meningitidis. Материалы и методы . Применена методика типирования фрагмента «VR» белка FetA в сочетании с методиками генетического субтипирования и мультилокусного секвенирования-типирования. Результаты . Подробная информация об исследованных штаммах внесена в Интернет-базу данных http://pubmlst.org/ neisseria/. Типирование штаммов серогруппы В не позволяет выделить преобладающий вариант фрагмента «VR» белка FetA, что согласуется с данными субтипирования, полученными ранее. Штаммы серогруппы А отличает меньшее разнообразие наблюдаемых вариантов фрагмента «VR» белка FetA: выявлено 6 вариантов. Для штаммов серогруппы А в большинстве случаев удается проследить связь между принадлежностью штамма к определенной генетической субгруппе и выявленным антигенным профилем. Для штаммов генетической субгруппы VI характерен антигенный профиль P1.5-2, 10; F1-5, обнаруженный у 14 (18%) штаммов; для штаммов генетической субгруппы X - антигенный профиль P1.5-2, 10; F3-5, обнаруженный у 50 (63%) штаммов. Антигенный профиль P1.5-2, 10-67; F3-5 найден у 5 (6%) штаммов, остальные антигенные профили, выявленные у 10 штаммов, встречаются однократно. Заключение . Преобладание штаммов с антигенным профилем P1.5-2, 10; F3-5 объясняется наблюдаемой в московской популяции менингококков серогруппы А сменой преобладающей генетической субгруппы после 2003 г. с генетической субгруппы VI на генетическую субгруппу Х.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Neisseria meningitidis</kwd><kwd>multilocus sequence typing</kwd><kwd>subtyping</kwd><kwd>FetA protein</kwd><kwd>Moscow</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>мультилокусное секвенирование-типирование</kwd><kwd>субтипирование</kwd><kwd>белок FetA</kwd><kwd>Москва</kwd></kwd-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Королева И.С., Белошицкий Г.В., Закроева И.М. и др. О современных особенностях менингококковой инфекции в Москве. Эпидемиол. вакцинопроф. 2008, 3: 21 - 25.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С. и др. Генетические субгруппы бактерий Neisseria meningitidis серогруппы А, выделенных от больных генерализованными формами менингококковой инфекции на территории Москвы в 1969 - 2006 гг. Журн. микробиол. 2008, 1: 7 - 12.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Миронов К.О., Платонов А.Е., Королева И.С., Шипулин Г.А. Анализ московской популяции Neisseria meningitidis методом мультилокусного секвенирования-типирования. Там же. 2006, 2: 31 - 36.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Миронов К.О., Платонов А.Е., Шипулин Г.А. и др. Генетическое субтипирование Neisseria meningitidis. Эпидемиол. инфекц. бол. 2005, 3: 23 - 28.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Achtman M., van der Ende A., Zhu P. et al. Molecular epidemiology of serogroup A meningitis in Moscow, 1969 to 1997. Emerg. Infect. Dis. 2001, 7 (3): 420 - 427.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Jolley K.A., Brehony C., Maiden M.C. Molecular typing of meningococci: recommendations for target choice and nomenclature. FEMS Microbiol. Rev. 2007, 31 (1): 89 - 96.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Russell J.E., Jolley K.A., Feavers I.M. et al. PorA variable regions of Neisseria meningitidis. Emerg. Infect. Dis. 2004, 10 (4): 674 - 678.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Thompson E.A., Feavers I.M., Maiden M.C. Antigenic diversity of meningococcal enterobactin receptor FetA, a vaccine component. Microbiology. 2003, 149 (Pt. 7): 1849 - 1858.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Urwin R., Russell J.E., Thompson E.A. et al. Distribution of surface protein variants among hyperinvasive meningococci: implications for vaccine design. Infect. Immun. 2004, 72 (10): 5955 - 5962.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
