Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology14010ArticlesСтатьиResearch ArticleQUANTITATIVE AND QUALITATIVE COMPOSITION OF AXILLA MICROBIOTA IN PRACTICALLY HEALTHY INDIVIDUALSКОЛИЧЕСТВЕННЫЙ И КАЧЕСТВЕННЫЙ СОСТАВ МИКРОБИОТЫ ПОДМЫШЕЧНЫХ ВПАДИН У ПРАКТИЧЕСКИ ЗДОРОВЫХ ЛИЦBorisovaO. YuБорисоваО. ЮAleshkinA. VАлешкинА. ВGaduaN. TГадуаН. ТBochkarevaS. SБочкареваС. СEfimovB. AЕфимовБ. АChernovaV. AЧерноваВ. АAleshkinV. AАлешкинВ. АKafarskayaL. IКафарскаяЛ. ИAfanasievS. SАфанасьевС. СVoropaevaE. AВоропаеваЕ. АRubalskyE. OРубальскийЕ. ОAfanasievM. SАфанасьевМ. СKaraulovA. VКарауловА. ВGabrichevsky Moscow Research Institute of Epidemiology and MicrobiologyМосковский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.ГабричевскогоPirogov Russian National Research Medical UniversityРоссийский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И.ПироговаPirogov National Medical-Surgical Centre Children’s Consultative-Diagnostic UnitНациональный медико-хирургический центр детский консультативно-диагностический центр им. Н.И. ПироговаSechenov First Moscow State Medical University, Moscow, RussiaПервый московский государственный медицинский университет им. И.М.Сеченова15042015922NO2 (2015)№2 (2015)172409062023Copyright ©; 2015, Borisova O.Y., Aleshkin A.V., Gadua N.T., Bochkareva S.S., Efimov B.A., Chernova V.A., Aleshkin V.A., Kafarskaya L.I., Afanasiev S.S., Voropaeva E.A., Rubalsky E.O., Afanasiev M.S., Karaulov A.V.Copyright ©; 2015, Борисова О.Ю., Алешкин А.В., Гадуа Н.Т., Бочкарева С.С., Ефимов Б.А., Чернова В.А., Алешкин В.А., Кафарская Л.И., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Рубальский Е.О., Афанасьев М.С., Караулов А.В.2015Borisova O.Y., Aleshkin A.V., Gadua N.T., Bochkareva S.S., Efimov B.A., Chernova V.A., Aleshkin V.A., Kafarskaya L.I., Afanasiev S.S., Voropaeva E.A., Rubalsky E.O., Afanasiev M.S., Karaulov A.V.Борисова О.Ю., Алешкин А.В., Гадуа Н.Т., Бочкарева С.С., Ефимов Б.А., Чернова В.А., Алешкин В.А., Кафарская Л.И., Афанасьев С.С., Воропаева Е.А., Рубальский Е.О., Афанасьев М.С., Караулов А.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/14010

Aim. Characteristics of quantitative and qualitative composition of cultured microorganisms isolated from axilla skin of practically healthy individuals. Materials and methods. 77 practically healthy individuals aged 18 to 40 years were examined. Species identification of microorganisms was carried out by culture-morphologic, tinctorial and biochemical properties using time-of-flight mass spectrometer and rpoB gene amplification with subsequent direct sequencing. Results. Quantitative evaluation of microbial composition of axilla skin microbiota in most of the practically healthy individuals varied in the 4 - 5 lg CFU/ml interval, whereas seeding of skin by this microbiota at the level of 8 lg CFU/ml was not detected. 158 strains of 24 microorganism species were identified in this biotope. Most of these strains (68.9%) belonged to Corynebacterium genus, 21.6% of strains - to Staphylococcus genus, 7.6% of strains - to Micrococcus genus and 1.9% of strains - Candida albicans. 16 species of corynebacteria were isolated with predomination of С. tuberculostearicum (40,3%), C. amycolatum (18,4%) and C. ureicelerivorans (14,8%) strains. The microbial landscape in most ofthe examined individuals (77.9%) was presented by microorganism association. Conclusion. Quantitative and qualitative species composition of cultured microorganisms isolated from axilla skin biotope of practically healthy individuals was characterized for the first time.

Цель. Характеристика количественного и качественного состава культивируемых микроорганизмов, выделенных с кожи подмышечных впадин у практически здоровых лиц. Материалы и методы. Обследованы 77 практических здоровых лиц в возрасте от 18 до 40 лет. Видовую идентификацию микроорганизмов проводили по культуральноморфологическим, тинкториальным и биохимическим свойствам с использованием время пролетного масс-спектрометра и амплификации гена rpoB с последующим прямым секвенированием. Результаты. Количественная оценка микробного состава микробиоты кожи подмышечных впадин у большинства практически здоровых лиц варьировала в интервале 4 - 5 lg КОЕ/мл, в то время как обсемененность кожи данной микробиоты в концентрации 8 lg КОЕ/мл не обнаружено. В данном биотопе идентифицировано 158 штаммов 24 видов микроорганизмов. Из них большинство (68,9%) штаммов принадлежало к роду Corynebacterium, 21,6% штаммов - к роду Staphylococcus, 7,6% штаммов - к роду Micrococcus и 1,9% штаммов - Candida albicans. Выявлено 16 видов коринебактерий с преобладанием C.tuberculostearicum (40,3%), C.amycolatum (18,4%) и C.ureicelerivorans (14,8%) штаммов. У большинства (77,9%) обследованных лиц микробный пейзаж представлен ассоциацией микроорганизмов. Заключение. Впервые охарактеризован количественный и качественный видовой состав культивируемых микроорганизмов, выделенных из биотопа кожи подмышечных впадин у практически здоровых лиц.

microfloramicrobial landscapeCorynebacterium genusmicrobiotaaxilla skinмикрофлорамикробный пейзажрод Corynebacteriumмикробиотакожа подмышечных впадинAlatoom A., Cazanave C.J., Cunningham S.C. et al. Identification of non-diphtheriae Corynebacterium by use of matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. JCM. 2013, 23: 160-163.Bernard K. The genus Corynebacterium and other medicaly relevant coryneform-like bacteria. JCM. 2012, 50 (10): 3152-3158.Calewaert C., Kerckhof F.M., Granitsiotis M.S. et al. Characterization of Staphylococcus and Corynebacterium clusters in the human axillary region. Plos. 2013, 8 (8):e70538.Chen YE., Tsao H. The skin microbiome: current perspectives and future chalenges. J. Amer. Acad.Dermatology. 2013, 69 (1):143-155.Cogen A. L., Nizet V., Galo R. L. Skin microbiota: a source of disease or defence? Br. J. Dermatol. 2008, 158 (3): 442-455.Diez-Aguilar M., Ruiz-Garbajosa P., Fernanez-Olmos A. et al. Non-diphtheriae Corynebacterium species: an emerging respiratory pathogen. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Disease. 2012, 32 (6): 769-772.Hinic V., Lang C., Weisser M. et al. Corynebacterium tuberculostearicum: a potentialy misidentified and multiresistant Corynebacterium species isolated from clinical specimens. JCM. 2012, 50 (8): 2561-2567.Khamis A., Raoult D., Scola B. RpoB gene sequencing for identification of Corynebacterium species. J. Clin. Microbiol. 2004, 42 (9): 3925-3931.Khamis A., Raoult D., Scola B. Comparison between rpoB and 16SrRNA gene sequencing for molecular identification of 168 clinical isolates of Corynebacterium. J. Clin. Microbiol. 2005, 43 (4): 1934-1936.Mathieu A., Delmont T.O., Vogel T.M. et al. Life on human surfaces: skin metagenomics. Plos. 2013, 8 (6): e65288.Mathieu A., Vogel T.M., Simonet P. The future of skin metagenomics. Research in microbiology. 2014, 167: 69-76.Nhan T.X., Parienti J.J., Badiou G. et al. Microbiological investigation and clinical significance of Corynebacterium spp. in respiratory specimens. Diagn. Microbiol. Infect. Disease. 2012, 74: 236-241.Schommer N.N., Galo R.L. Structure and function of the human skin microbiome. Trend Microbiol. 2013, 21 (12): 660-668.