Aim. Analysis of differences in protein spectra of various bifidobacteria strains of intestine microsymbiocenosis using identification results from MALDI-TOF mass-spectrometer. Materials and methods. Results ofmass-spectrometry («Bruker Daltonics», Germany) for 57 intestine isolates of Bifidobacterium spp. are provided. 500 laser impulses were used for obtaining every mass-spectrum; parameters of mass-spectrometer were optimized for the 1000 - 18000 m/z (mass to charge) range. Results. Comparative analysis of mass-spectrometry biomarkers for Bifidobacterium genus members has detected variations in the quantity of peaks (4 to 56) among both various species and within bifidobacteria species, that reflects uniqueness of the protein profile of separate strains. Along with biomarkers, specific for most cultures, significant differences of the examined peaks were detected, including among microorganisms, that belong to the same species. As such, for B. bifidum species strains - only in 67±7.5% of cultures the presence of common peaks in the 9282 - 9901 m/z was detected, whereas protein spectra in other ranges differed by both quantity and molecular mass. Conclusion. Differences in protein profile of Bifidobacterium genus microorganisms reflect uniqueness of protein spectra (proteome) of every separate strain, determining their functional activity, features of interaction with associative microsymbionts and host organism in human associative symbiosis.
Цель. Анализ различия белкового спектра у различных штаммов бифидобактерий кишечного микросимбиоценоза с использованием результатов идентификации на масс-спектрометре MALDI-TOF. Материалы и методы. Приведены результаты масс-спектрометрии («Bruker Daltonics», Германия) 57 кишечных изолятов Bifidobacterium spp. Для получения каждого масс-спектра использовали 500 лазерных импульсов, параметры масс-спектрометра оптимизировали для диапазона от 1000 до 18 000 m/z (масса на заряд). Результаты. Сравнительный анализ биомаркеров масс-спектрометрии представителей рода Bifidobacterium выявил варьирование количества пиков (от 4 до 56) как среди различных видов, так и внутри вида бифидобактерий, что отражает уникальность протеом-ного профиля отдельных штаммов. Наряду с биомаркерами, специфичными для большинства культур, были выявлены существенные различия рассматриваемых вершин, в том числе и среди микроорганизмов, принадлежащих к одному виду. Так, для штаммов вида B. bifidum - только у 67±7,5% культур выявлено наличие общих пиков в диапазоне 9282-9901 m/z, тогда как в других диапазонах белковые спектры отличались и по количеству, и по молекулярной массе. Заключение. Различия белкового профиля микроорганизмов рода Bifidobacterium отражают уникальность спектра белков (протеома) каждого отдельного штамма, определяя их функциональную активность, особенности взаимодействия с ассоциативными микросимбионтами и организмом хозяина при ассоциативном симбиозе человека.