Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology13908ArticlesСтатьиReview ArticleIMPROVEMENT OF TYPIFICATION OF NATURAL FOCI OF PLAGUE BASED ON ECOLOGICAL-GENETIC ANALYSIS OF YERSINIA PESTISСОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ ТИПИЗАЦИИ ПРИРОДНЫХ ОЧАГОВ ЧУМЫ НА ОСНОВЕ ЭКОЛОГО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА YERSINIA PESTISKutyrevV. VКутыревВ. ВPopovN. VПоповН. ВEroshenkoG. AЕрошенкоГ. АKaravaevaT. BКараваеваТ. БRussian Research Institute of Plague Control Microb, Saratov, RussiaРоссийский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб», Саратов15102013905NO5 (2013)№5 (2013)10711109062023Copyright ©; 2013, Kutyrev V.V., Popov N.V., Eroshenko G.A., Karavaeva T.B.Copyright ©; 2013, Кутырев В.В., Попов Н.В., Ерошенко Г.А., Караваева Т.Б.2013Kutyrev V.V., Popov N.V., Eroshenko G.A., Karavaeva T.B.Кутырев В.В., Попов Н.В., Ерошенко Г.А., Караваева Т.Б.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13908

Contemporary features of distribution of various subspecies and biovars of plague causative agent by landscape-geographical zones and mountain belts on the territory of Russia and other CIS countries are examined. The most widely spread in plain and mountain natural foci were noted to be Yersinia pestis main subspecies medieval biovar strains. Strains of Y. pestis non-main subspecies are spread in mountain landscapes of Altai, Caucasus, Tian Shan. Change of dominating species of rodents considered as the main carriers of plague was noted not to result in change of genetic and biochemical characteristics of Y. pestis strains. Perspectives of study of «micro-focality» of plague are emphasized for deciphering the mechanism of the enzootic.

Рассмотрены современные особенности распределения различных подвидов и биоваров возбудителя чумы по ландшафтно-географическим зонам и поясам гор на территорий России и других стран СНГ. Отмечено, что наиболее широкое распространение в равнинных и горных природных очагах имеют штаммы средневекового биовара основного подвида Yersinia pestis. Штаммы неосновных подвидов Yersinia pestis распространены в горных ландшафтах Алтая, Кавказа, Тянь-Шаня. Отмечено, что смена доминирующих видов грызунов, рассматриваемых в качестве основных носителей чумы, не приводит к изменению генетических и биохимических характеристик штаммов Yersinia pestis. Подчеркнута перспективность изучения феномена «микроочаговости» чумы для расшифровки механизма энзоотии.

Yersinia pestisYersinia pestisecological-genetic analysisnatural fociecological-epizootological types of enzootic territories«micro-focality»эколого-генетический анализприродные очагиэколого-эпизоотологические типы энзоотичных территорий«микроочаговость»Ерошенко Г.А., Одиноков Г.Н., Куклева Л.М. и др. Стандартный алгоритм молекулярного типирования штаммов Yersinia pestis. Журн. микробиол. 2012, 3: 25-35.Каримова Т.Ю., Неронов В.М. Природные очаги чумы Палеарктики. М., Наука. 2007.Коренберг Э.И. Природная очаговость инфекций: современные проблемы и перспективы исследований. Зоол. журнал. 2010, 89, 1: 5-17.Куклева Л.М. Ерошенко Г.А., Куклев В.Е. и др. Изучение вариабельности нуклеотидной последовательности генов rha локуса у штаммов Yersinia pestis основного и неосновных подвидов. Молекул. генет., микробиол. и вирусол. 2008, 2: 23-27.Кутырев В.В., Ерошенко Г.А., Попов Н.В. и др. Молекулярные механизмы взаимодействия возбудителя чумы с беспозвоночными животными. Молекул. генет., микробиол. и вирусол. 2009, 4: 7-12.Кутырев В.В., Проценко О.А. Классификация и молекулярно-генетические исследования Yersinia pestis. Пробл. особо опасных инф. 1998, 4 (58): 11-12.Кучерук В.В., Росицкий Б. Природная очаговость инфекций - основные термины и понятия. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 1984, 2: 7-16.Литвин В.Ю., Коренберг Э.И. Природная очаговость болезней: развитие концепции к исходу века. Паразитология. 1999, 33 (3): 179-191.Одиноков Г.Н., Ерошенко ГА., Видяева Н.А. и др. Структурно-функциональный анализ генов nap оперона у штаммов Yersinia pestis разных подвидов. Пробл. особо опасных инф. 2008, 4 (98): 40-42.Одиноков Г.Н., Ерошенко ГА., Куклева Л.М. и др. Определение генетических основ ауксотроф-ности штаммов Yersinia pestis кавказского подвида. Генетика. 2012, 48, 4: 457-464.Природные очаги чумы Кавказа, Прикаспия, Средней Азии и Сибири. Г.Г. Онищенко, В.В. Кутырев (ред.). М., Медицина, 2004.Павлова А.И. Ерошенко Г.А. Одиноков Г.Н. и др. Анализ генетической изменчивости штаммов Yersinia pestis средневекового биовара из природных очагов чумы России и Монголии. Пробл. особо опасных инф. 2012, 4 (114): 49-53.Попов Н.В., Слудский А.А., Попов Ю.А. и др. Совершенствование принципов типизации природных очагов чумы на территории России и других стран СНГ Пробл. особо опасных инф. 2005, 2 (90): 32-35.Achtman M., Morelli G., Zhu P. et al. Microevolution and history of the plague bacillus, Yersinia pestis. Proc. Natl. Acad. Sci.USA. 2004, 101: 17837-17842.Deng W, Burland V., Plunkett G. et al. Genome sequence of Yersinia pestis KIM. J. Bacteriol. 2002, 184: 4601-4611.Filippov A.A., Solodovnikov N.S., Kukleva L.M. et al. Plasmid composition of Yersinia pestis strains of different origin. FEMS Microbiol. Lett. 1990, 67: 45-48.Eroshenko G.A., Kutyrev V.V. Biochemical and genetic peculiarities and the phylogenetic relationship of the non-main subspecies in the general scheme of the plague agent evolution. Advances in Experimental Medicine and Biology. 2012, 954 (1): 45-51.Motin V.L., Georgescu A.M., Elliot J.M. et al. Genetic variability of Yersinia pestis isolates as predicted by IS100 genotyping and analysis of structural genes encoding glycerol-3-phosphate dehydrogenase (glpD). J. Bacteriol. 2002, 184: 1019-1027.Parhill J., Wren B.W, Thomson N.R. et al. Genome sequence of Yersinia pestis, the causative agent of plague. Nature. 2001, 413: 523-527.