Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology13762ArticlesСтатьиPERSISTENCE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA STRAINS IN PATIENTS OF FEDE RAL SCIENTIFIC CENTER OF TRANSPLANTOLOGY AND ARTIFICIAL ORGANSПЕРСИСТЕНЦИЯ ШТАММОВ PSEUDOMONAS AERUGINOSA СРЕДИ ПАЦИЕНТОВ ФНЦ ТРАНСПЛАНТОЛОГИИ И ИСКУССТВЕННЫХ ОРГАНОВAvetisyanL RАветисянЛ Р

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи

VoroninaO LВоронинаО Л

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи

ChernukhaM YuЧернухаМ Ю

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи

KundaM SКундаМ С

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи

GabrielyanN IГабриелянН И

ФНЦ трансплантологии и искусственных органов им. акад.В.И.Шумакова, Москва

LuninV GЛунинВ Г

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи

ShaginyanI AШагинянИ А

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.Гамалеи

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф.ГамалеиФНЦ трансплантологии и искусственных органов им. акад.В.И.Шумакова, Москва15082012894NO4 (2012)№4 (2012)9910409062023Copyright ©; 2012, Avetisyan L.R., Voronina O.L., Chernukha M.Y., Kunda M.S., Gabrielyan N.I., Lunin V.G., Shaginyan I.A.Copyright ©; 2012, Аветисян Л.Р., Воронина О.Л., Чернуха М.Ю., Кунда М.С., Габриелян Н.И., Лунин В.Г., Шагинян И.А.2012Avetisyan L.R., Voronina O.L., Chernukha M.Y., Kunda M.S., Gabrielyan N.I., Lunin V.G., Shaginyan I.A.Аветисян Л.Р., Воронина О.Л., Чернуха М.Ю., Кунда М.С., Габриелян Н.И., Лунин В.Г., Шагинян И.А.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13762

Aim. Study genetic diversity of P. aeruginosa strains persisting in patients of Federal Scientific Center of Transplantology and Artificial Organs, and main factors facilitating persistence of strains in the hospital. Materials and methods. 136 P. aeruginosa strains isolated from patients of the center for 3 years 6 months were genotyped by RAPD-PCR and MLST methods and studied for antibiotics resistance and presence of integrons. Results. Genetic diversity of strains persisting in hospital was established. Strains of main genotypes ST235, ST446, ST598 were isolated from patients of various surgical departments. Patients were shown to be colonized by these strains during stay in reanimation and intensive therapy department (RITD) of the hospital. Strains of dominant genotype 235 were isolated from 47% of examined patients during more than 3 years. Only genotype 235 strains contained integron with cassettes of antibiotics resistance genes blaGES5 and aadA6 in the genome. Conclusion. The data obtained show that over the period of observation in the center 1 clone of P. aeruginosa that belonged to genotype 235 dominated. This clone was endemic for this hospital and in the process of prolonged persistence became more resistant to antibiotics. Colonization of patients with these strains occurs in RITD. This confirms the necessity of constant monitoring of hospital microflora for advance detection of potentially dangerous epidemic hospital strains able to cause hospital infections.

Цель. Изучение генетического разнообразия штаммов P. aeruginosa, персистирующих среди пациентов ФНЦ трансплантологии и искусственных органов, и основных факторов, способствующих персистенции штаммов в стационаре. Материалы и методы. 136 штаммов P. aeruginosa, выделенных от пациентов центра в течение 3 лет 6 месяцев, было генотипировано методами RAPD-PCR и MLST и исследовано на антибиотикочувствительность и наличие интегронов. Результаты. Установлено генетическое разнообразие штаммов, персистирующих в стационаре. Штаммы основных генотипов ST235, ST446, ST598 выделили от пациентов различных хирургических отделений. Показано, что пациенты были колонизированы этими штаммами во время нахождения в отделении реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ) стационара. Штаммы доминирующего генотипа 235 выявляли у 47% обследованных пациентов в течение более чем 3 лет. Только штаммы генотипа 235 содержали в геноме интегрон с кассетами генов антибиотикорезистентности blaGES5 и aadA6. Заключение. Полученные данные показывают, что на протяжении периода наблюдения в центре доминировал один клон P. aeruginosa, который относился к генотипу 235. Этот клон был эндемичным для данного госпиталя и в процессе длительной персистенции становился более резистентным к антибиотикам. Колонизация пациентов этими штаммами происходит в ОРИТ. Это подтверждает необходимость постоянного мониторинга больничной микрофлоры с целью заблаговременного выявления потенциально опасных эпидемических госпитальных штаммов, способных вызвать внутрибольничные инфекции.

P. aeruginosahospital infectionpersistenceP. aeruginosaгоспитальная инфекцияперсистенцияАветисян Л.Р., Чернуха М.Ю., Габриелян Н.И. и др. Генотипические особенности штаммов Pseudomonas aeruginosa, циркулирующих в хирургическом стационаре. Журн. микробиол. 2009, 5: 33-39.МУК №28-6/34. Методические указания по эпидемиологическому надзору за внутрибольничными инфекциями. 02.09.87.Angelatou F., Litsas S.B., Kontomichalou P. Purification and properties of two gentamicinmodifying enzymes, coded by a single plasmid pPK237 originating from Pseudomonas aeruginosa. J. Antibiot. 1982, 35 (2): 235-244.Bennett P.M. Integrons and gene cassettes: a genetic construction kit for bacteria. J. Antimicrob. Chemother. 1999, 43 (1): 1-4.Bush K., Jacoby G.A. Updated functional classification of beta-lactamases. Antimicrob. Agents Chemother. 2010, 54 (3): 969-976.Chen F, Liu W.Q., Liu Z.H. et al. MutL as a genetic switch of bacterial mutability: turned on or off through repeat copy number changes. FEMS Microbiol. Lett. 2010, 312 (2): 126-132.Christensen L.D., Moser C., Jensen P.O. et al. Impact of Pseudomonas aeruginosa quorum sensing on biofilm persistence in an in vivo intraperitoneal foreign-body infection model. Microbiol. 2007, 153 (7): 2312-2320.Curran B., Jonas D., Grundmann H. et al. Development of a multilocus sequence typing scheme for the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa. J. Clin. Microbiol. 2004, 42 (12): 5644-5649.Empel J., Filczak K., Mrowka A. et al. Outbreak of Pseudomonas aeruginosa infections with PER-1 extended-spectrum ƒ-lactamase in Warsaw, Poland: further evidence for an international clonal complex. J. Clin. Microbiol. 2007, 45: 2829-2834.Lévesque C., Piché L., Larose C. et al. PCR mapping of integrons reveals several novel combinations of resistance genes. Antimicrob. Agents Chemother. 1995, 39 (1): 185-191.Levings R.S., Lightfoot D., Partridge S.R. et al. The genomic island SGI1, containing the multiple antibiotic resistance region of Salmonella enterica serovar Typhimurium DT104 or variants of it, is widely distributed in other S. enterica serovars. J. Bacteriol. 2005, 187 (13): 4401-4409.Lipsitch M., Bergstrom C.T. Modeling of antibiotic resistance in the ICU - U.S. slant. In: Infection control in the ICU environment. Weinstein R.A., Bonten M. (еd.). Kluwer, 2002.Stokes H.W., Holmes A.J., Nield B.S. et al. Gene cassette PCR: sequence-independent recovery of entire genes from environmental DNA. Appl. Environ. Microbiol. 2001, 67 (11): 5240-5246.Su J., Shi L., Yang L. et al. Analysis of integrons in clinical isolates of Escherichia coli in China during the last six years. FFMS Microbiоl. Lett. 2006, 254 (1): 75-80.The Main Site EMBL-EBI, Eurropean bioinformatics Institute (URL: http://www.ebi.ac. uk).The Main Site PubMLST of the Faculty of Zoology, Oxford University, Great Britain (URL: http://www.pubmlst.org).