Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology13700ArticlesСтатьиVIBRIO CHOLERAE STRAINS CERTIFICATIONПАСПОРТИЗАЦИЯ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAEKislichkinaA AКисличкинаА А

ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, пос. Оболенск, Московская область

StepanshinaV NСтепаншинаВ Н

ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, пос. Оболенск, Московская область

NizovaA VНизоваА В

ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, пос. Оболенск, Московская область

MayskayaN VМайскаяН В

ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, пос. Оболенск, Московская область

MukhinaT NМухинаТ Н

ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, пос. Оболенск, Московская область

MironovaR IМироноваР И

ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, пос. Оболенск, Московская область

ShemyakinI GШемякинИ Г

ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, пос. Оболенск, Московская область

KislichkinaA A

State Scientific Centre of Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow region, Russia

StepanshinaV N

State Scientific Centre of Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow region, Russia

NizovaA V

State Scientific Centre of Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow region, Russia

MayskayaN V

State Scientific Centre of Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow region, Russia

MukhinaT N

State Scientific Centre of Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow region, Russia

MironovaR I

State Scientific Centre of Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow region, Russia

ShemyakinI G

State Scientific Centre of Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow region, Russia

ГНЦ прикладной микробиологии и биотехнологии, пос. Оболенск, Московская областьState Scientific Centre of Applied Microbiology and Biotechnology, Obolensk, Moscow region, Russia15122012896NO6 (2012)№6 (2012)222609062023Copyright ©; 2012, Kislichkina A.A., Stepanshina V.N., Nizova A.V., Mayskaya N.V., Mukhina T.N., Mironova R.I., Shemyakin I.G., Kislichkina A.A., Stepanshina V.N., Nizova A.V., Mayskaya N.V., Mukhina T.N., Mironova R.I., Shemyakin I.G.Copyright ©; 2012, Кисличкина А.А., Степаншина В.Н., Низова А.В., Майская Н.В., Мухина Т.Н., Миронова Р.И., Шемякин И.Г., Kislichkina A.A., Stepanshina V.N., Nizova A.V., Mayskaya N.V., Mukhina T.N., Mironova R.I., Shemyakin I.G.2012Kislichkina A.A., Stepanshina V.N., Nizova A.V., Mayskaya N.V., Mukhina T.N., Mironova R.I., Shemyakin I.G., Kislichkina A.A., Stepanshina V.N., Nizova A.V., Mayskaya N.V., Mukhina T.N., Mironova R.I., Shemyakin I.G.Кисличкина А.А., Степаншина В.Н., Низова А.В., Майская Н.В., Мухина Т.Н., Миронова Р.И., Шемякин И.Г., Kislichkina A.A., Stepanshina V.N., Nizova A.V., Mayskaya N.V., Mukhina T.N., Mironova R.I., Shemyakin I.G.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13700

Aim. Certification of V. cholerae strains stored at State collection of pathogenic microorganisms and cell cultures SCPM - Obolensk. Materials and methods. 50 V. cholerae strains were studied. Real-time PCR with primers to genes ctxA, ctxB, ace, zot, tсpА, toxR, hlyA, rtxC, rfbO1, ompU, ompW was used. Results. Membership of the studied strains in V. cholerae species was confirmed by molecular-biological methods. 46 strains belong to O1 serogroup, 42 of those - El Tor toxigenic, having all the virulence genes and 4 nontoxigenic strains. A strain had ace, zot, tсpA, toxR, rtxC, hlyA, ompU genes. 2 strains had ace, toxR, rtxC, hlyA genes, a strain had only toxR gene which is a global regulatory gene. 2 of the 4 serogroup O1 strains were non-toxigenic and had all the virulence genes (ctxA, ctxB, ace, zot, tсpA, toxR, rtxC, hlyA, ompU). 1 nontoxigenic strain has ace, zot, toxR, hlyA, ompU genes, and the other - toxR, hlyA genes. Conclusion. Genome certificates of all the V. cholerae strains stored in State collection of pathogenic microorganisms and cell cultures SCPM - Obolensk were created. Markers of epidemic threat - ctxA, ctxB, tcpA, toxR and additional virulence genes were determined.

Цель. Паспортизация штаммов V. cholerae, находящихся на хранении в Государственной коллекции патогенных микроорганизмов и клеточных культур ГКПМ - Оболенск. Материалы и методы. Исследовано 50 штаммов V. cholerae. Использован метод ПЦР в реальном времени с праймерами к генам - ctxA, ctxB, ace, zot, tсpА, toxR, hlyA, rtxC, rfbO1, ompU, ompW. Результаты. Молекулярно-биологическими методами подтверждена принадлежность исследованных штаммов к виду V. cholerae. К серогруппе О1 относятся 46 штаммов, из них - 42 токсигенных Эль-Тор, имеющих все гены, контролирующие вирулентность, и четыре нетоксигенных штамма. У одного штамма обнаружены гены ace, zot, tсpA, toxR, rtxC, hlyA, ompU. У двух штаммов присутствуют гены ace, toxR, rtxC, hlyA; у одного штамма выявлен только ген toxR, который является глобальным регуляторным геном. Два из четырех штаммов серогруппы не О1 являются токсигенными, имеющими все гены, контролирующие вирулентность (ctxA, ctxB, ace, zot, tсpA, toxR, rtxC, hlyA, ompU). Один нетоксигенный штамм имеет гены ace, zot, toxR, hlyA, ompU, а второй штамм - гены toxR, hlyA. Заключение. Составлены геномные паспорта для всех штаммов V. cholerae, хранящихся в Государственной коллекции патогенных микроорганизмов и клеточных культур ГКПМ - Оболенск. Определены маркеры эпидемической опасности - ctxA, ctxB, tcpA, toxR и дополнительные гены вирулентности.

Vibrio choleraeVibrio choleraeO1 serogoruptoxigenic strainsvirulence genesсерогруппа О1токсигенные штаммы гены вирулентностиЕрошенко Г.А., Осин А.В., Щелканова Е.Ю. и др. Сравнительный анализ геномов вирулентных и авирулентных штаммов V. cholerae О139. Мол. генет. микробиол. вирусол. 2004, 2: 11-16.Коротяев А.И., Бабичев С.А. Медицинская микробиология. СПб, СпецЛит, 2000.Лабораторная диагностика холеры: Методические указания. М., Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2007.Москвитина Э.А. Современные тенденции в развитии седьмой пандемии холеры. Проблемы особо опасных инфекций. 2008, 95 (1): 22-26.Савельев В.Н., Винокуров С.И., Дорошенко И.Г. и др. Эпидемиологическая и неэпидемиологическая форма холеры Эль-Тор: этиология, клиника, эпидемиология. Эпидемиол. инфекц. бол. 2009, 5: 57-59.Смирнова Н.И., Горяев А.А., Кутырев В.В. Эволюция генома возбудителя холеры в современный период. Мол. генет. микробиол. вирусол. 2010, 4:11-19.Faruque S.M., Albert M.J., Mekalanos J.J. Epidemiology, genetics, and ecology of toxigenic Vibrio cholerae. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998, 62 (4): 1301-1314.Sheahan K.-L., Cordero C. L., Fullner Satchell K. J. Autoprocessing of the Vibrio cholerae RTX toxin by the cysteine protease domain. EMBO J. 2007, 26: 2552-2561.Singh D.V., Matte M.H., Matte G.R.et al. Molecular analysis of Vibrio cholerae O1, O139, non-O1, and non-O139 strains: clonal relationships between clinical and environmental isolates. Appl. Environ. Microbiol. 2001, 67 (2): 910-921.http://www.who.int/ru/.