Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology13612ArticlesСтатьиShort CommunicationDEVELOPMENT AND USE OF TEST-SYSTEMS FOR MOLECULAR-GENETIC DETECTION OF OUT-OF-HOSPITAL PNEUMONIA AGENTSРАЗРАБОТКА И ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ТЕСТСИСТЕМ ДЛЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ДЕТЕКЦИИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ВНЕБОЛЬНИЧНОЙ ПНЕВМОНИИMavzyutovA. RМавзютовА. РMirsayapovaI. AМирсаяповаИ. АBaymievA. KhБаймиевА. Х.KhasanovaG. FХасановаГ. ФMavzyutovaG. AМавзютоваГ. АOchilovaR. AОчиловаР. АBashkiria State Medical UniversityБашкирский государственный медицинский университетResearch Institute of Biochemistry and GeneticsИнститут биохимии и генетики15122011886NO6 (2011)№6 (2011)697209062023Copyright ©; 2011, Mavzyutov A.R., Mirsayapova I.A., Baymiev A.K., Khasanova G.F., Mavzyutova G.A., Ochilova R.A.Copyright ©; 2011, Мавзютов А.Р., Мирсаяпова И.А., Баймиев А.Х., Хасанова Г.Ф., Мавзютова Г.А., Очилова Р.А.2011Mavzyutov A.R., Mirsayapova I.A., Baymiev A.K., Khasanova G.F., Mavzyutova G.A., Ochilova R.A.Мавзютов А.Р., Мирсаяпова И.А., Баймиев А.Х., Хасанова Г.Ф., Мавзютова Г.А., Очилова Р.А.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13612

Aim. Search of new targets and improvements of molecular-genetic detection methods of species specific DNA fragments of out-of-hospital pneumonia (OP) infection agents in sputum. Materials and methods. Species specific oligonucleotide primers to Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Branhamella catarrhalis were selected. 103 sputum samples from OP patients and 15 from practically healthy humans were test by using PCR and bacteriological method. Results. Mixed bacterial flora was detected by bacteriologic method in OP in 26 cases (25.2%). 14 patients (13.6%) had B.catarrhalis DNA in sputum, 12 patients (11.6%) - S.pneumoniaе, H.influenzae was detected in 11 examined individuals (10.7%), K.pneumoniae (7.9%) - in 8. In 32 cases (30%) etiology of OP could not be deciphered bacteriologically. B.catarrhalis was detected in 19 (18.5%) of OP patients, S.pneumoniaе - in 17 (16.5%), H.influenzaе and K.pneumoniae - in 14.5% and 12.6% (15 and 13 patients) respectively by using the developed PCR primers. In 16.5% cases (17 patients) positive results against several bacteria species simultaneously were obtained by PCR method, in 3.9% (4 patients) P.aeruginosawas detected. Conclusion. Use of PCR for detection of out-of-hospital pneumonia agents DNA significantly increases informativity of the study when compared with bacteriological method.

Цель. Поиск новых мишеней и усовершенствование способов молекулярно-генетической детекции в мокроте видоспецифических фрагментов ДНК возбудителей внебольничной пневмонии (ВП). Материалы и методы. Подобраны видоспецифичные олигонуклеотидные праймеры к Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Branhamella catarrhalis. Бактериологическим методом и при использовании ПЦР протестировано 103 образца мокроты больных ВП и 15 практически здоровых людей. Результаты. Бактериологическим методом при ВП в 26 случаях (25,2%) выявлена смешанная бактериальная флора. У 14 больных (13,6%) в мокроте обнаружена ДНК B. catarrhalis, у 12 пациентов (11,6%) - S. pneumoniaе, H. influenzae была выявлена у 11 обследуемых (10,7%), K.pneumoniae в 8 случаях (7,9%). В 32 случаях (30%) бактериологически этиологию ВП расшифровать не удалось. При использовании ПЦР с разработанными праймерами B. catarrhalis выявлены у 19 (18,5%) больных ВП; S. pneumoniaе - у 17 (16,5%); H. influenzaе и K.pneumoniae - в 14,5 и 12,6% (15 и 13 пациентов) случаев. В 16,5% случаев (17 больных) методом ПЦР были получены положительные результаты одновременно к нескольким видам бактерий, в 3,9% случаев (4 больных) обнаружены P. aeruginosa. Заключение. Применение ПЦР для обнаружения ДНК возбудителей внебольничной пневмонии значительно повышает информативность исследования в сравнении с бактериологическим методом.

PCRout-of-hospital pneumoniacausative agentmolecular-genetic detectionПЦРвнебольничная пневмониявозбудителимолекулярная детекцияБондаренко В.М. Генетические маркеры вирулентности условно патогенных бактерий. Журн. микробиол. 2011, 3: 94-99.Зубков М.Н. Этиология и патогенез внебольничных пневмоний у взрослых. Пульмонология. 2005, 5: 53-60. Контактная информация: Мавзютов А.Р., д.м.н., 450000, Уфа, ул. Ленина, 3, р.т. (3472) 22-41-73Чучалин А.Г. Клинические рекомендации. Пульмонология. М., Гэотар-Медиа, 2007.Abdeldaim G.M., Stralin K., Kirsebom L.A. et al. Detection of Haemophilus influenzae in respiratory secretions from pneumonia patients by quantitative realtime polymerase chain reaction. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2009, 64 (4): 366373.Murdoch D.R., Anderson T.P., Beynon K.A. et al. Evaluation of a PCR assay for detection of Streptococcus pneumoniae in respiratory and nonrespiratory samples from adults with community-acquired pneumonia. J. Clin. Microbiol. 2003, 41: 60-63.Utine G., Pinar C. Pleural fluid PCR method for detection of Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae in pediatric parapneumonic effusions. Respiration. 2008, 75: 437-442.Wang Y., Kong F., Yang Y., Gilbert G.L. A multiplex PCR-based reverse line blot hybridization (mPCR/RLB) assay for detection of bacterial respiratory pathogens in children with pneumonia. Pediatric Pulmonology. 2008, 43: 150-159.