Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology13548ArticlesСтатьиResearch ArticleDETECTION OF «HYBRID» VIBRIO CHOLERAЕ ELT OR STRAINS DURING EPIDEMIC COMPLICATIONS IN SYBERIA AND FAR EASTОБНАРУЖЕНИЕ «ГИБРИДНЫХ» ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAЕ ELTOR ПРИ ЭПИДЕМИЧЕСКИХ ОСЛОЖНЕНИЯХ В СИБИРИ И НА ДАЛЬНЕМ ВОСТОКЕMironovaL. VМироноваЛ. ВBalakhonovS. VБалахоновС. ВUrbanovichL. YaУрбановичЛ. ЯPolovinkinaV. SПоловинкинаВ. СKozhevnikovaA. SКожевниковаА. СKulikalovaE. SКуликаловаЕ. СAfanasyevM. VАфанасьевМ. ВIrkutsk Research Institute for Plague Control of Syberia and Far East, RussiaИркутский научно-исследовательский про- тивочумный институт Сибири и Дальнего Востока15102011885NO5 (2011)№5 (2011)121809062023Copyright ©; 2011, Mironova L.V., Balakhonov S.V., Urbanovich L.Y., Polovinkina V.S., Kozhevnikova A.S., Kulikalova E.S., Afanasyev M.V.Copyright ©; 2011, Миронова Л.В., Балахонов С.В., Урбанович Л.Я., Половинкина В.С., Кожевникова А.С., Куликалова Е.С., Афанасьев М.В.2011Mironova L.V., Balakhonov S.V., Urbanovich L.Y., Polovinkina V.S., Kozhevnikova A.S., Kulikalova E.S., Afanasyev M.V.Миронова Л.В., Балахонов С.В., Урбанович Л.Я., Половинкина В.С., Кожевникова А.С., Куликалова Е.С., Афанасьев М.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13548

Aim. Biotyping of Vibrio cholerae eltor iso- lated during epidemic complications of cholera in Syberia and Far East by phenotypic and genotypic properties complex. Materials and methods. 45 strains of V.cholerae were studied. Phenotypic analysis was performed by using a complex of biovar determining tests. Genotyping was performed by detecting ctxAB, tcpA, toxR, rstR genes, and ctxB gene structure analysis. Results. All the V.cholerae during epidemiologic complications in Syberia in the 1970s belong to eltor biovar by phenotypic properties and have eltor specific alleles of tcpA and rstR genes, and ctxB of the third genotype in the genome. In the 1990s the strains were phenotypically matching eltor biovar, but had genetical determinants of both eltor (tcpA El, rstR El) and classical (сtxB1, rstR Cl) biovar. Conclusion. The cause of epidemic complications of cholera in Syberia in the 1970s was V.choleraе eltor with typical eltor biovar phenotypical and genotypical properties. In the 1990s cases of introduction into the region of «hybrid» V.choleraе eltor strain were ascertained, developing into acute cholera outbreaks in several cases.

Цель . Биотипирование изолированных при эпидемических осложнениях по холере в Сибири и на Дальнем Востоке V.cholerae eltor по комплексу фенотипических и генотипических признаков. Материалы и методы . Исследовано 45 штаммов V.cholerae. Фенотипический анализ проводили по комплексу тестов, определяющих принадлежность к биовару. Генотипирование осуществляли посредством детекции генов ctxAB, tcpA, toxR, rstR и анализа структуры гена ctxB. Результаты. Все V.cholerae при эпидемических осложнениях в Сибири в 70-х годах XX века относятся к биовару эльтор по фенотипическим свойствам и несут в геноме эльтор-специфические аллели гена tcpA и rstR, а также сtxB третьего генотипа. В 90-е годы штаммы фенотипически соответствовали биовару эльтор, но содержали генетические детерминанты как эльтор (tcpA El, rstR El), так и классического (сtxB1, rstR Cl) биоваров. Заключение. Причиной эпидемических осложнений по холере в Сибири в 70-е годы XX века стал V.choleraе eltor с типичными для биовара эльтор фено- и генотипическими свойствами. В 90-е годы установлены факты заноса в регион «гибридных» штаммов V.choleraе eltor с развитием в ряде случаев острых вспышек холеры.

V.choleraeV.choleraebiotyping«hybird» strainsgenotypeepidemical complicationбиотипирование«гибридные» штаммыгенотипэпидослож- нениеЛабораторная диагностика холеры. Метод. реком. МУК 4.2.2218-07. М., Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2007.Балахонов С.В., Кожевникова А.С., Куликалова Е.С. и др. Молекулярно-генетические особенности штаммов холерного вибриона, выделенных на территории Сибири и Дальнего Востока во время 7 пандемии. Журн. ифекц. патол. 2009, 16 (3): 9-16.Миронова Л.В. Молекулярно-генетические и эпидемиологические аспекты патогенности холерного вибриона (по материалам Сибири и Дальнего Востока). Дис. канд. мед. наук. Иркутск, 2004.Смирнова Н.И., Челдышова Н.Б., Горяев А.А. и др. Эволюция генома Vibrio choleraе: пути формирования атипичных штаммов. Пробл. особо опас. инф. 2008, 97 (3): 5-11.Davis B. M., Kimsey H.H., Chang W., Waldor M.K. The Vibrio cholerae O139 Calcutta bacteriophage CTXϕ is infectious and encodes a novel repressor. J. Bacteriol. 1999, 181 (21): 6779-6787.Faruque S.M., Tam V.C., Chowdhury N. et al. Genomic analysis of the Mozambique strain of Vibrio cholerae O1 reveals the origin of El Tor strains carrying classical CTX prophage. PNAS. 2007, 104 (12): 5151-5156.Karaolis D.K.R., Lan R., Kaper J.B., Reeves P.R. Comparison of Vibrio cholerae pathogenicity islands in six and seventh pandemic strains. Infect. Immun. 2001, 69 (3): 1947-1952.Lee J.H., Choi S.Y., Jeon Y.S. et al. Classification of hybrid and altered Vibrio cholerae strains by CTX prophage and RS1 element structure. J. Microbiol. 2009, 47 (6): 783-788.Morita M., Ohnishi M., Arakawa E. et al. Development and validation of a mismatch amplification mutation PCR assay to monitor the dissemination of an emerging variant of Vibrio cholerae O1 biotype El Tor. Microbiol. Immunol. 2008, 52: 314-317.Morita M., Ohnishi M., Arakawa E. et al. Emergence and genetic diversity of El Tor Vibrio cholerae O1 that possess classical biotype ctxB among travel-associated cases of cholera in Japan. J. Med. Microbiol. 2010, 59: 708-712.Nguyen B. M., Lee J. H., Cuong N.T. et al. Cholera outbreaks caused by an altered Vibrio cholerae O1 El Tor biotype strain producing classical cholera toxin B in Vietnam in 2007 to 2008. J. Clin. Microbiol. 2009, 47 (5): 1568-1571.Nusrin S., Khan G. Y., Bhuiyan N. A. et al. Diverse CTX phages among toxigenic Vibrio cholerae O1 and O139 strains isolated between 1994 and 2002 in an area where cholera is endemic in Bangladesh. Ibid. 2004, 42 (12): 5854-5856.Olsvik O., Wahlberg J., Petterson B. et al. Use of automated sequencing of polymerase chain reaction-generated amplicons to identify three types of cholera toxin subunit B in Vibrio cholera O1 strains. Ibid. 1993, 31 (1): 22-25.Safa A., Sultana J., Cam P.D. et al. Vibrio choleraе O1 hybrid El Tor strains, Asia and Africa. Emerg. Infect. Dis. 2008, 14 (6): 987-988.Safa A., Nair G.B., Kong R.Y.C. Evolution of new variants of Vibrio cholerae O1. Trends Microbiol. 2010, 18 (1): 46-54.