Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии

0372-93112686-7613

Central Research Institute for Epidemiology

13459

Articles

Статьи

Research Article

MOLECULAR CHARACTERIZATION OF PANDEMIC INFLUENZA VIRUSES A/H1N1(sw2009) ISOLATED IN RUSSIA IN 2009 — 2010

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ВИРУСОВ ПАНДЕМИЧЕСКОГО ГРИППА A/H1N1(sw2009), ИЗОЛИРОВАННЫХ В 2009 — 2010 ГГ. В РОССИИ

Yatsyshina

S. B

Яцышина

С. Б

Minenko

A. N

Миненко

А. Н

Voloshina

P. V

Волошина

П. В

Kudryavtseva

A. V

Кудрявцева

А. В

Praded

M. N

Прадед

М. Н

Braslavskaya

S. I

Браславская

С. И

Shipulin

G. A

Шипулин

Г. А

Maleev

V. V

Малеев

В. В

Pokrovsky

V. I

Покровский

В. И

Central Research Institute of Epidemiology, Moscow, RussiaЦентральный НИИ эпидемиологии, Москва

15022011

881

NO1 (2011)

№1 (2011)

263409062023

2011

Yatsyshina S.B., Minenko A.N., Voloshina P.V., Kudryavtseva A.V., Praded M.N., Braslavskaya S.I., Shipulin G.A., Maleev V.V., Pokrovsky V.I.

Яцышина С.Б., Миненко А.Н., Волошина П.В., Кудрявцева А.В., Прадед М.Н., Браславская С.И., Шипулин Г.А., Малеев В.В., Покровский В.И.

https://creativecommons.org/licenses/by/4.0

https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/13459

Aim . Assessment of genetic diversity of influenza virus A/H1N1(sw2009) variants circulated in Russia, study of virus’ pathogenicity in humans and potential resistance to antiviral drugs. Materials and methods. Sequencing of PCR-fragments of genome of influenza viruses isolated from clinical and autopsy samples of 436 patients. Four full genome sequences of influenza viruses A/H1N1(sw2009) were obtained. Phylogenetic analysis was performed. Results. High degree of homology (98.9—100%) was found among influenza A/H1N1(sw2009) viruses in HA and NA genes as well as in their aminoacid sequences (1.3 and 1.4% respectively). Differences in other proteins did not exceed 1.1%. Diversity was found in position 222 of receptor-binding locus of HA and single amino acid polymorphism — in several internal proteins. Known mutations determining resistance to Tamiflu and Arbidol were not detected. All viruses were resistant to remantadine. Molecular markers of high pathogenicity were not found. Conclusion. High homology of influenza viruses determines low level of antigenic differences although in populations of viruses there are variants with different levels of adaptation to human organism and different affinity to receptors of upper and lower respiratory tract that can determine their different transmissibility.

Цель . Оценка генетического разнообразия циркулировавших на территории России вариантов вируса гриппа А/H1N1(sw2009), изучение патогенности вируса для человека и потенциальной чувствительности к противовирусным препаратам. Материалы и методы. Выполнено секвенирование фрагментов ПЦР генома вирусов гриппа, обнаруженных в образцах прижизненного и посмертного материала от 436 пациентов. Получены последовательности 4 полных геномов вирусов гриппа A/H1N1(sw2009). Проведен филогенетический анализ. Результаты. Показана высокая гомология (98,9—100%) вирусов по генам гемагглютинина (HA) и нейраминидазы (NA) и их аминокислотным последовательностям (1,3 и 1,4% соответственно). Различие остальных белков не превышало 1,1%. Зафиксировано разнообразие вирусов в позиции 222 в области связи НА с рецепторами и единичный полиморфизм в ряде внутренних белков. Известные мутации устойчивости к тамифлю и арбидолу обнаружены не были. Все вирусы резистентны к ремантадину. Маркеры высокой патогенности не обнаружены. Заключение. Высокая гомология вирусов гриппа свидетельствует о низком уровне антигенных различий, однако в популяции вирусов имеются варианты с различной степенью приспособленности к организму человека и разным сродством к рецепторам верхних и нижних дыхательных путей, что может обусловливать их различную трансмиссивность.

pandemic influenza virus A/H1N1 (sw2009)phylogenetic analysisTamifluremantadine

вирус пандемического гриппа А/H1N1(sw2009)филогенетический анализтамифлюремантадин

Яцышина С.Б., Миненко А.Н., Прадед М.Н. и др. Диагностика гриппа: новый вариант H1N1 в России. Эпидемиол. инфекц. бол. 2009, 6: 56-62.

Abed Y., Goyette N., Boivin G. et al. Generation and characterization of recombinant influenza A (H5N1) viruses harboring amantadine resistance mutations. Antimicrob. Agen. Chemother. 2005, 49 (2): 556-559.

Bright R.A., Medina M.J., Xu X. et al. Incidence of adamantine resistance among influenza A (H3N2) viruses isolated worldwide from 1994 to 2005: a cause for concern. Lancet. 2005, 366: 1175-81.

Conenello G., Zamarin D., Perrone L.A. A dingle mutation in the PB1-F2 of H5N1(HK/97) and 1918 influenza A virus contributes to increased virulence. PloS Pathog. 2007, 3: e141.

de Jong M.D., Thanh T.T., Khanh T.H. Oseltamivir resistance during treatment of influenza A (H5N1) infection. Engl. J. Med. 2005, 353 (25): 2667-2672.

Kumar S., Tamura K., Nei M. MEGA3: Integrated software for molecular evolutionary genetics analysis and sequence alignment. Brief. Bioinformatics. 2004, 5: 150-163.

Lipatov A.S., Andreansky S., Webby R.J. Pathogenesis of Hong Kong H5N1 influenza virus NS reassortants in mice: the role of cytokines and B- and T-cell response. J. Gen Virol. 2005, 86: 1121-1130.

Miller R.S., MacLean A.R., Gunson R.N. Occurrence of haemagglutinin mutation D222G in pandemic influenza A(H1N1) infected patients in the West of Scotland, United Kingdom, 2009—2010. Euro Surveill. 2010, 15 (16): 19546.

Miotto O., Heiny A.T., Albrecht R. Completeproteome mapping of human Influenza A adaptive mutations: implications for human transmissibility of zoonotic strains. PloS One. 2010, (2): e9025, p. 1-13. (www.plosone.org).

10.

Moscona A. Oseltamivir resistance—disabling our influenza defenses. Engl. J. Med. 2005, 353 (25): 2633-2636.

11.

Mossad S. The resurgence of swine-origin influenza A (H1N1). Clevelend Clin. J. Med. 2009, 76: 337-343.

12.

Neumann G., Noda T., Kawaoka Y. Emergence and pandemic potential of swine-origin H1N1 influenza virus. Natura. 2009, 459: 931-939.

13.

Obenauer J.C., Denson J., Mehta P.K. Largescale sequence analysis of avian influenza isolates. Science. 2006, 311 (5767): 1576-1580.

14.

Schmidtke М., Zell R., Bauer K. et al. Amantadine resistance among porcine H1N1, H1N2 and H3N2 influenza A viruses isolated in Germany between 1981 and 2001. Intervirology. 2006, 49: 286-293.

15.

Shinde V., Bridges C., Uyeki T. Triplereassortant swine influenza A (H1) in humans in the United States, 2005-2009. New Engl. J. Med. 2009, 361: 1-10.

16.

Shinya K., Ebina M., Yamada S. Avian flu: influenza virus receceptors in the human airway. Nature. 2006, 440 (7083): 435-436.

17.

WHO Preliminary review of D222G amino acid substitution in haemagglutinin of 2009 pandemic influenza A(H1N1) viruses. Wkly Epidemiol. Rec. 2010, 85 (4): 21-22.