Journal of microbiology, epidemiology and immunobiologyJournal of microbiology, epidemiology and immunobiologyЖурнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии0372-93112686-7613Central Research Institute for Epidemiology134210.36233/0372-9311-331REVIEWSОБЗОРЫReview ArticleTo the question of the relevance of the development and prospects for the use of the bacteriophage Streptococcus pneumoniaeК вопросу об актуальности разработки и перспективам использования препарата бактериофага Streptococcus pneumoniaehttps://orcid.org/0000-0003-3416-0902ZakharovaYuliya A.ЗахароваЮлия Александровна
Russian Federation

D. Sci. (Med.), Associate Professor, Head, Department of epidemiology of viral infections

д.м.н., доц., рук. отдела эпидемиологии вирусных инфекций

zakharova_ya@eniivi.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3584-9528IvashchenkoIvan A.ИващенкоИван Александрович
Russian Federation

senior laboratory assistant, Laboratory of respiratory viral infections, Department of epidemiology of viral infections

старший лаборант лаб. респираторных вирусных инфекций отдела эпидемиологии вирусных инфекций

zakharova_ya@eniivi.ruhttps://orcid.org/0000-0001-6140-2546BolgarovaEkaterina V.БолгароваЕкатерина Викторовна
Russian Federation

researcher, Laboratory of respiratory viral infections, Department of epidemiology of viral infections

н.с. лаб. респираторных вирусных инфекций отдела эпидемиологии вирусных инфекций

zakharova_ya@eniivi.ruYekaterinburg Research Institute of Viral Infections, State Research Center of Virology and Biotechnology “Vector”Екатеринбургский научно-исследовательский институт вирусных инфекций ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора071220229955735860712202207122022Copyright ©; 2022, Zakharova Y.A., Ivashchenko I.A., Bolgarova E.V.Copyright ©; 2022, Захарова Ю.А., Иващенко И.А., Болгарова Е.В.2022Zakharova Y.A., Ivashchenko I.A., Bolgarova E.V.Захарова Ю.А., Иващенко И.А., Болгарова Е.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://microbiol.crie.ru/jour/article/view/1342

Introduction. The prevalence of Streptococcus pneumoniae strains causing invasive forms of pneumococcal infection and the growing rates of antibiotic resistance of individual serotypes of the pathogen pose a number of urgent and socially significant tasks the search for new antimicrobial agents for prevention and treatment.

Objective. To analyze the data of scientific publications of domestic and foreign authors on the problems of practical use and prospects for the development of the bacteriophage S. pneumoniae drug aimed at the actual serotypes of the pathogen.

Results. Analysis of literary sources in scientific electronic databases and publishing houses eLibrary.Ru, ScienceDirect, Scopus, PubMed, Springerlink, Wiley Online Library, Annual reviews allowed us to summarize information about four isolated lytic bacteriophages of S. pneumoniae and their endolysins, as well as about two lysogenic phages, to present data on the clinical efficacy of streptococcal bacteriophage in pneumococcal infection in animals and humans. The results of search queries on the most significant and widespread serotypes of S. pneumoniae in the territory of the Russian Federation have established the predominance in the structure of variants 19F, 14, 9V/A, 15 A/F, 6 A/B/C/D, 3 and 23F. Some of them are characterized by a high level of antibiotic resistance and cause invasive forms of the disease, and serotypes 15 A/F/C, 6 C/D are not represented in modern vaccines, which increases the relevance of the development and use of pneumococcal bacteriophage, including intraspecific typing of significant and common serotypes.

Conclusion. Based on the analysis of the current state of the issue of pneumococcal bacteriophages, the information obtained on the circulation of topical strains of S. pneumoniae on the territory of the Russian Federation and their serotype landscape, it is concluded that the development of the bacteriophage S. pneumoniae drug is relevant as a means of targeted action for the prevention, diagnosis and personalized therapy of human diseases of pneumococcal etiology.

Введение. Распространённость штаммов Streptococcus pneumoniae, вызывающих инвазивные формы пневмококковой инфекции, и растущие показатели антибиотикорезистентности отдельных серотипов возбудителя ставят в ряд актуальных и социально значимых задач поиск новых антимикробных средств для профилактики и лечения.

Цель — провести поиск научных публикаций отечественных и зарубежных авторов о проблемах практического использования и перспективах разработки препарата бактериофага S. pneumoniae узконаправленного действия на актуальные серотипы возбудителя.

Результаты. Анализ литературных источников в научных электронных базах и издательствах eLibrary.Ru, ScienceDirect, Scopus, PubMed, Springerlink, Wiley Online Library, Annual reviews позволил обобщить сведения о 4 выделенных литических бактериофагах S. pneumoniae и их эндолизинах, а также 2 умеренных фагах, представить данные клинической эффективности стрептококкового бактериофага при пневмококковой инфекции у животных и человека. Результаты поисковых запросов о наиболее значимых и распространённых на территории России серотипах S. pneumoniae установили преобладание в структуре вариантов 19F, 14, 9V/A, 15 A/F, 6 A/B/C/D, 3 и 23F. Часть из них характеризуется высоким уровнем антибиотикорезистентности и вызывает тяжёлые формы заболевания, при этом серотипы 15 A/F/C и 6 C/D не представлены в составе современных вакцинных штаммов, что повышает актуальность разработки и использования пневмококкового бактериофага, в том числе для внутривидового типирования значимых и распространённых серотипов.

Заключение. На основании анализа современного состояния вопроса о пневмококковых бактериофагах, полученных сведений о циркуляции актуальных штаммов S. pneumoniae на территории России и их серотиповом пейзаже сделан вывод об актуальности разработки препарата бактериофага S. pneumoniae как средства направленного действия для профилактики, диагностики и персонализированной терапии заболеваний человека пневмококковой этиологии.

Streptococcus pneumoniaebacteriophagesphage therapyphage prophylaxisphage diagnosticsliterature reviewStreptococcus pneumoniaeбактериофагифаготерапияфагопрофилактикафагодиагностикалитературный обзорThe study was supported by the Russian Science Foundation grant No. 22-25-20129. https://rscf.ru/project/22-25-20129/Исследование поддержано грантом Российского научного фонда № 22-25-20129. https://rscf.ru/project/22-25-20129/Golodnova S.O., Fel'dblyum I.V., Semerikov V.V., Nikolenko V.V., Zakharova Yu.A. The prevalence of carriage of Streptococcus pneumoniae among medical specialists and evaluation of their vaccination. Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika. 2014; (1): 50–4. (in Russian)Голоднова С.О., Фельдблюм И.В., Семериков В.В., Николенко В.В., Захарова Ю.А. Распространенность носительства Streptococcus pneumoniae среди медицинских работников и оценка эффективности вакцинопрофилактики. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2014; (1): 50–4.van Hoek A.J., Andrews N., Waight P.A., Stowe J., Gates P., George R., et al. The effect of underlying clinical conditions on the risk of developing invasive pneumococcal disease in England. J. Infect. 2012; (1): 17–24. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2012.02.017Baranov A., Namazova L., Tatochenko V. Pneumococcal infection and associated diseases - a serious problem of modern health care. Pediatricheskaya farmakologiya. 2008; 5(1): 7–12. (in Russian)Баранов А., Намазова Л., Таточенко В. Пневмококковая инфекция и связанные с ней заболевания – серьезная проблема современного здравоохранения. Педиатрическая фармакология. 2008; 5(1): 7–12.Sinopal'nikov A.I., Romanovskikh A.G. The management of lower respiratory tract infections in adult patients. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2012; 14(1): 4–16. (in Russian)Синопальников А.И., Романовских А.Г. Рекомендации по ведению взрослых пациентов с инфекциями нижних дыхательных путей. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2012; 14(1): 4–16.Mayanskiy N.A., Alyab'eva N.M., Lazareva A.V., Katosova L.K. Serotype diversity and antimicrobial resistance of Streptococcus pneumoniae. Vestnik Rossiyskoy akademii meditsinskikh nauk. 2014; (7-8): 38–45. https://doi.org/10.15690/vramn.v69i7-8.1108 (in Russian)Маянский Н.А., Алябьева Н.М., Лазарева А.В., Катосова Л.К. Серотиповое разнообразие и резистентность пневмококков. Вестник Российской академии медицинских наук. 2014; (7-8): 38–45. https://doi.org/10.15690/vramn.v69i7-8.1108Sidorenko S.V., Savinova T.A., Il'ina E.N., Syrochkina M.A. Population pattern of pneumococci with lower susceptibility to penicillin and prospects of antipneumococcal vaccination to control antibiotic resistance distribution. Antibiotiki i khimioterapiya. 2011; (5-6): 11–8. (in Russian)Сидоренко С.В., Савинова Т.А., Ильина Е.Н., Сырочкина М.А. Популяционная структура пневмококков со сниженной чувствительностью к пенициллину и перспективы антипневмококковой вакцинации для сдерживания распространения антибактериальной резистентности. Антибиотики и химиотерапия. 2011; (5-6): 11–8.Mayanskiy N., Kulichenko T., Alyabieva N., Brzhozovskaya E., Ponomarenko O., Savinova T., et al. Changing serotype distribution and resistance patterns among pediatric nasopharyngeal pneumococci collected in Moscow, 2010–2017. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2019; 94(4): 385–90. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2019.02.010Savinova T.A., Filimonova O.Yu., Grudinina S.A., Sidorenko S.V. Genetic diversity of penicillin-resistant Streptococcus pneumoniae. Zhurnal infektologii. 2009; 1(4): 66–71. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2009-1-4-66-71 (in Russian)Савинова Т.А., Филимонова О.Ю., Грудинина С.А., Сидоренко С.В. Генетическое разнообразие пенициллинустойчивых Streptococcus pneumoniae. Журнал инфектологии. 2009; 1(4): 66–71. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2009-1-4-66-71Tsvetkova I.A., Belanov S.S., Gostev V.V., Kalinogorskaya O.S., Volkova M.O., Mokhov A.S., et al. Clonality of Streptococcus pneumoniae isolates in Russia, circulating from 1980 to 2017. Antibiotiki i khimioterapiya. 2019; (5-6): 22–31. https://doi.org/10.24411/0235-2990-2019-100027 (in Russian)Цветкова И.А., Беланов С.С., Гостев В.В., Калиногорская О.С., Волкова М.О., Мохов А.С. и др. Клональная структура популяции изолятов Streptococcus pneumoniae, циркулирующих в России с 1980 по 2017 гг. Антибиотики и химиотерапия. 2019; (5-6): 22–31. https://doi.org/10.24411/0235-2990-2019-100027Rodigina A.M. Pneumococcal Bacteriophage and Its Use in the Treatment Creeping Ulcer of the Cornea [Pnevmokokkovyy bakteriofag i ego primenenie dlya lecheniya polzuchey yazvy rogovitsy]. Perm': Zvezda; 1938. (in Russian)Родигина А.М. Пневмококковый бактериофаг и его применение для лечения ползучей язвы роговицы. Пермь: Звезда; 1938.Belyaev I.A., Belyaev A.M. Analysis of environmental indices of nasopharynx microflora and their influence on the carriage of Streptococcus pneumoniae invasive forms. Meditsina i ekologiya. 2017; (1): 78–88. (in Russian)Беляев И.А., Беляев А.М. Анализ экологических показателей микрофлоры носоглотки и их влияние на носительство инвазивных форм Streptococcus pneumoniae. Медицина и экология. 2017; (1): 78–88.Belyaeva E.V., Ermolina G.B., Kichikova V.V., Nikiforov V.A. A study of bacteria associations in the microbiocenosis of nasopharynx of practically healthy persons. Vestnik Nizhegorodskogo universiteta im. N.I. Lobachevskogo. 2012; (2-3): 20–4. (in Russian)Беляева Е.В., Ермолина Г.Б., Кичикова В.В., Никифоров В.А. Исследование ассоциаций бактерий в микробиоценозе слизистой носоглотки практически здоровых людей. Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. 2012; (2-3): 20–4.Khusnutdinova L.M. Modification of the biological properties of bacteria under conditions of association of indigenous and pathogenic microflora. Vestnik Orenburgskogo gosudarstvennogo universiteta. 2006; (12): 11–5. (in Russian)Хуснутдинова Л.М. Модификация биологических свойств бактерий в условиях ассоциации индигенной и патогенной микрофлоры. Вестник Оренбургского государственного университета. 2006; (12): 11–5.Fujimori I., Kikushima K., Hisamatsu K., Nozawa I., Goto R., Murakami Y. Interaction between oral alpha-streptococci and group A streptococci in patients with tonsillitis. Ann. Otol. Rhinol. Laryngol. 1997; 106: 571–4. https://doi.org/10.1177/000348949710600708Fujimori I., Yamada T. Incidence of alpha-streptococcus having inhibitory activity against beta-streptococcus in patients with tonsillitis. Nihon Jibiinkoka Gakkai Kaiho. 1992; 95(3): 400–8. https://doi.org/10.3950/jibiinkoka.95.400 (in Japanese)Dajani A.S., Tom M.C., Law D.J. Viridins, bacteriocins of alpha-hemolytic streptococci: isolation, characterization, and partial purification. Antimicrob. Agents. Chemother. 1976; 9(1): 81–8. https://doi.org/10.1128/AAC.9.1.81Tzannetis S.E., Bigis A., Konidaris N., Ioannidis H., Genimatas V., Papavassiliou J. In-vitro bacteriocin-mediated antagonism by oral streptococci against human carrier strains of staphylococci. J. Appl. Bacteriol. 1991; 70(4): 294–301. https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.1991.tb02939.xBisgaard H., Hermansen M.N., Buchvald F., Loland L., Halkjaer L.B., Bønnelykke K., et al. Childhood asthma after bacterial colonization of the airway in neonates. N. Engl. J. Med. 2007; 357(15): 1487–95. https://doi.org/10.1056/NEJMoa052632Gross E.L., Beall C.J., Kutsch S.R., Firestone N.D., Leys E.J., Griffen A.L. Beyond Streptococcus mutans: dental caries onset linked to multiple species by 16S rRNA community analysis. PLoS One. 2012; 7(10): e47722. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0047722Roberts F.A., Darveau R.P. Microbial protection and virulence in periodontal tissue as a function of polymicrobial communities: symbiosis and dysbiosis. Periodontol 2000. 2015; 69(1): 18–27. https://doi.org/10.1111/prd.12087Akimkin V.G., Alimov A.V., Polyakov V.S. The epidemiological efficiency of the use of bacteriophages for prevention of acute respiratory bacterial infections in organized groups. Bakteriologiya. 2016; 1(1): 80–7. https://doi.org/10.20953/2500-1027-2016-1-80-87 (in Russian)Акимкин В.Г., Алимов А.В., Поляков В.С. Эпидемиологическая эффективность применения бактериофагов для профилактики острых респираторных инфекций бактериальной этиологии в организованных коллективах. Бактериология. 2016; 1(1): 80–7. https://doi.org/10.20953/2500-1027-2016-1-80-87Kot W., Sabri M., Gingras H., Ouellette M., Tremblay D.M., Moineau S. Complete genome sequence of Streptococcus pneumoniae virulent Phage MS1. Genome Announc. 2017; 5(28): 4–5. https://doi.org/10.1128/genomeA.00333-17Martín-Galiano A.J., García E. Streptococcus pneumoniae: a plethora of temperate bacteriophages with a role in host genome rearrangement. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2021; 11: 775402. https://doi.org/10.3389/fcimb.2021.775402McDonnell M., Ronda C., Tomasz A. “Diplophage”: a bacteriophage of Diplococcus pneumoniae. Virology. 1975; 63(2): 577–82. https://doi.org/10.1016/0042-6822(75)90329-3Ouennane S., Leprohon P., Moineau S. Diverse virulent pneumophages infect Streptococcus mitis. PLoS One. 2015; 10(2): e0118807. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0118807Lopez R., Ronda C., Tomasz A., Portoles A. Properties of "diplophage": a lipid-containing bacteriophage. J. Virol. 1977; 24(1): 201–10. https://doi.org/10.1128/jvi.24.1.201-210.1977Lopez R., Garcia E., Garcia P., Ronda C., Tomasz A. Choline-containing bacteriophage receptors in Streptococcus pneumoniae. J. Bacteriol. 1982; 151(3): 1581–90. https://doi.org/10.1128/jb.151.3.1581-1590.1982Rosenow C., Ryan P., Weiser J.N., Johnson S., Fontan P., Ortqvist A., et al. Contribution of novel choline-binding proteins to adherence, colonization and immunogenicity of Streptococcus pneumoniae. Mol. Microbiol. 1997; 25(5): 819–29. https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.1997.mmi494.xLuo R., Mann B., Lewis W.S., Rowe A., Heath R., Stewart M.L., et al. Solution structure of choline binding protein A, the major adhesin of Streptococcus pneumoniae. EMBO J. 2005; 24(1): 34–43. https://doi.org/10.1038/sj.emboj.7600490Marks L.R, Parameswaran G.I., Hakansson A.P. Pneumococcal interactions with epithelial cells are crucial for optimal biofilm formation and colonization in vitro and in vivo. Infect. Immun. 2012; 80(8): 2744–60. https://doi.org/10.1128/IAI.00488-12Sabri M., Häuser R., Ouellette M., Liu J., Dehbi M., Moeck G, et al. Genome annotation and intraviral interactome for the Streptococcus pneumoniae virulent phage Dp-1. J. Bacteriol. 2011; 193(2): 551–62. https://doi.org/10.1128/JB.01117-10Sabri M., Häuser R., Ouellette M., Liu J., Dehbi M., Moeck G., et al. Genome annotation and intraviral interactome for the Streptococcus pneumoniae virulent phage Dp-1. J. Bacteriol. 2011; 193(2): 551–62. https://doi.org/10.1128/JB.01117-10Ronda C., López R., García E. Isolation and characterization of a new bacteriophage, Cp-1, infecting Streptococcus pneumoniae. J. Virol. 1981; 40(2): 551–9. https://doi.org/10.1128/JVI.40.2.551-559.1981Ronda C., García J.L., López R. Infection of Streptococcus oralis NCTC 11427 by pneumococcal phages. FEMS Microbiol. Lett. 1989; 53(1-2): 187–92. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.1989.tb03620.xMartín A.C., López R., García P. Analysis of the complete nucleotide sequence and functional organization of the genome of Streptococcus pneumoniae bacteriophage Cp-1. J. Virol. 1996; 70(6): 3678–87. https://doi.org/10.1128/JVI.70.6.3678-3687.1996Obregón V., García J.L., García E., López R., García P. Genome organization and molecular analysis of the temperate bacteriophage MM1 of Streptococcus pneumoniae. J. Bacteriol. 2003; 185(7): 2362–8. https://doi.org/10.1128/JB.185.7.2362-2368.2003Gindreau E., López R., García P. MM1, a temperate bacteriophage of the type 23F Spanish/USA multiresistant epidemic clone of Streptococcus pneumoniae: structural analysis of the site-specific integration system. J. Virol. 2000; 74(17): 7803–13. https://doi.org/10.1128/JVI.74.17.7803-7813.2000Loeffler J.M., Fischetti V.A. Lysogeny of Streptococcus pneumoniae with MM1 phage: improved adherence and other phenotypic changes. Infect. Immun. 2006; 74(8): 4486–95. https://doi.org/10.1128/IAI.00020-06Díaz E., López R., García J.L. EJ-1, a temperate bacteriophage of Streptococcus pneumoniae with a Myoviridae morphotype. J. Bacteriol. 1992; 174(17): 5516–25. https://doi.org/10.1128/JB.174.17.5516-5525.1992Díaz E., López R., García J.L. Role of the major pneumococcal autolysin in the atypical response of a clinical isolate of Streptococcus pneumoniae. J. Bacteriol. 1992; 174(17): 5508–15. https://doi.org/10.1128/JB.174.17.5508-5515.1992Romero P., López R., García E. Genomic organization and molecular analysis of the inducible prophage EJ-1, a mosaic myovirus from an atypical Pneumococcus. Virology. 2004; 322(2): 239–52. https://doi.org/10.1016/j.virol.2004.01.029Romero P., López R., García E. Genomic organization and molecular analysis of the inducible prophage EJ-1, a mosaic myovirus from an atypical pneumococcus. Virology. 2004; 322(2): 239–52. https://doi.org/10.1016/j.virol.2004.01.029Sheehan M.M., Garcia J.L., Lopez R., Garcia P. The lytic enzyme of pneumococcal phage Dp-1: a chimeric lysine of intergeneric origin. Mol. Microbiol. 1997; 25(4): 717–25. https://doi.org/10.1046/j.1365-2958.1997.5101880.xMonterroso B., Sáiz J.L., García P., García J.L., Menéndez M. Insights into the structure-function relationships of pneumococcal cell wall lysozymes, LytC and Cpl-1. J. Biol. Chem. 2008; 283(42): 28618–28. https://doi.org/10.1074/jbc.M802808200Young R. Bacteriophage lysis: mechanism and regulation. Microbiol. Rev. 1992; 56(3): 430–81. https://doi.org/10.1128/MR.56.3.430-481.1992Wang I.N., Smith D.L., Young R. Holins: the protein clocks of bacteriophage infections. Annu. Rev. Microbiol. 2000; 54: 799–825. https://doi.org/10.1146/annurev.micro.54.1.799Jado I., López R., García E., Fenoll A., Casal J., García P. Spanish Pneumococcal Infection Study Network. Phage lytic enzymes as therapy for antibiotic-resistant Streptococcus pneumoniae infection in a murine sepsis model. J. Antimicrob. Chemother. 2003; 52(6): 967–73. https://doi.org/10.1093/jac/dkg485Vouillamoz J., Entenza J.M., Giddey M., Fischetti V.A., Moreillon P., Resch G. Bactericidal synergism between daptomycin and the phage lysin Cpl-1 in a mouse model of pneumococcal bacteraemia. Int. J. Antimicrob. Agents. 2013; 42(5): 416–21. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2013.06.020Harhala M., Nelson D.C., Miernikiewicz P., Heselpoth R.D., Brzezicka B., Majewska J., et al. Safety studies of pneumococcal endolysins Cpl-1 and Pal. Viruses. 2018; 10(11): 638. https://doi.org/10.3390/v10110638Leprohon P., Gingras H., Ouennane S., Moineau S., Ouellette M. A genomic approach to understand interactions between Streptococcus pneumoniae and its bacteriophages. BMC Genomics. 2015; 18(16): 972. https://doi.org/10.1186/s12864-015-2134-8Avery O.T., Macleod C.M., McCarty M. Studies on the chemical nature of the substance inducing transformation of Pneumococcal types: induction of transformation by a desoxyribonucleic acid fraction isolated from Pneumococcus type III. J. Exp. Med. 1944; 79(2): 137–58. https://doi.org/10.1084/jem.79.2.137Avery O.T., Macleod C.M., McCarty M. Studies on the chemical nature of the substance inducing transformation of pneumococcal types: induction of transformation by a desoxyribonucleic acid fraction isolated from pneumococcus type III. J. Exp. Med. 1944; 79(2): 137–58. https://doi.org/10.1084/jem.79.2.137Manso A.S., Chai M.H., Atack J.M., Furi L., De Ste Croix M., Haigh R., et al. A random six-phase switch regulates pneumococcal virulence via global epigenetic changes. Nat. Commun. 2014; 5: 5055. https://doi.org/10.1038/ncomms6055Weiser J.N., Austrian R., Sreenivasan P.K., Masure H.R. Phase variation in pneumococcal opacity: relationship between colonial morphology and nasopharyngeal colonization. Infect. Immun. 1994; 62(6): 2582–9. https://doi.org/10.1128/IAI.62.6.2582-2589.1994Kim J.O., Weiser J.N. Association of intrastrain phase variation in quantity of capsular polysaccharide and teichoic acid with the virulence of Streptococcus pneumoniae. J. Infect. Dis. 1998; 177(20): 368–77. https://doi.org/10.1086/514205Kim J.O., Weiser J.N. Association of intrastrain phase variation in quantity of capsular polysaccharide and teichoic acid with the virulence of Sreptococcus pneumoniae. J. Infect. Dis. 1998; 177(20): 368–77. https://doi.org/10.1086/514205Messaoudi M., Milenkov M., Albrich W.C., van der Linden M.P.G., Bénet T., Chou M., et al. The relevance of a novel quantitative assay to detect up to 40 major Streptococcus pneumoniae serotypes directly in clinical nasopharyngeal and blood specimens. PLoS ONE. 2016; 11(3):e0151428. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0151428Zaripova A.Z., Bayazitova L.T., Tyupkina O.F., Chazova T.A., Tyurin Yu.A., Isaeva G.Sh., et al. Phenotypic and genotypic properties of Streptococcus pneumoniae in case of bacteria carrying. Prakticheskaya meditsina. 2018; 16(9): 106–12. (in Russian)Зарипова А.З., Баязитова Л.Т., Тюпкина О.Ф., Чазова Т.А., Тюрин Ю.А., Исаева Г.Ш. и др. Фенотипические и генотипические свойства Streptococcus pneumoniae при бактерионосительстве. Практическая медицина. 2018; 16(9): 106–12.Feldman C., Anderson R. Epidemiology, virulence factors and management of the Pneumococcus. F1000Res. 2016; 5: 2320 https://doi.org/10.12688/f1000research.9283.1Feldman C., Anderson R. Epidemiology, virulence factors and management of the pneumococcus. F1000Res. 2016; 5: 2320 https://doi.org/10.12688/f1000research.9283.1Zaytsev A.A., Akimkin V.G., Briko N.I. Vaccines for the prevention of pneumococcal infections: a case study of adults from organized collectives. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. Aktual'nye voprosy. 2018; (4): 72–81. https://doi.org/10.18565/epidem.2018.4.72-81 (in Russian)Зайцев А.А., Акимкин В.Г., Брико Н.И. Вакцинопрофилактика пневмококковых инфекций: в фокусе взрослые из организованных коллективов. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2018; (4): 72–81. https://doi.org/10.18565/epidem.2018.4.72-81Protasova I.N., Bakhareva N.V., Per'yanova O.V., Elistratova T.A., Koval' M.V. Changing Streptococcus pneumoniae serotypes in children vaccinated with 7-valent conjugate vaccine. Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika. 2014; (5): 67–71. (in Russian)Протасова И.Н., Бахарева Н.В., Перьянова О.В., Елистратова Т.А., Коваль М.В. Смена серотипов Streptococcus pneumoniae у детей, вакцинированных 7-валентной конъюгированной вакциной. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2014; (5): 67–71.Namazova-Baranova L.S., Fedoseenko M.V., Vishneva E.A., Selimzyanova L.R., Chemakina D.S. Theoretical background and real results: a data review on vaccine prevention of pneumococcal infection in the world. Pediatricheskaya farmakologiya. 2018; 15(1): 58–74. https://doi.org/10.15690/pf.v15i1.1844 (in Russian)Намазова-Баранова Л.С., Федосеенко М.В., Вишнёва Е.А., Селимзянова Л.Р., Чемакина Д.С. Теоретические основы и реальные результаты: обзор материалов по вакцинопрофилактике пневмококковой инфекции в мире. Педиатрическая фармакология. 2018; 15(1): 58–74. https://doi.org/10.15690/pf.v15i1.1844Briko N.I., Korshunov V.A., Lomonosov K.S. Pneumococcal infection in Russia: state of the issue. Vestnik Rossiyskoy akademii meditsinskikh nauk. 2021; (1): 28–42. https://doi.org/10.15690/vramn1404 (in Russian)Брико Н.И., Коршунов В.А., Ломоносов К.С. Пневмококковая инфекция в Российской Федерации: состояние проблемы. Вестник Российской академии медицинских наук. 2021; (1): 28–42. https://doi.org/10.15690/vramn1404Kozlov R.S., Chagaryan A.N., Kozlova L.V., Murav'ev A.A. Serological characteristics and antimicrobial susceptibility of Streptococcus pneumoniae isolated from children 0–5 years of age in different regions of Russia. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2001; 13(2): 177–87. (in Russian)Козлов Р.С., Чагарян А.Н., Козлова Л.В., Муравьев А.А. Серологическая характеристика и чувствительность к антибиотикам пневмококков, выделенных у детей в возрасте до 5 лет в отдельных регионах Российской Федерации. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001; 13(2): 177–87.Golubkova A.A., Somova A.V. Role of Streptococcus pneumoniae in the etiology of community-acquired pneumonia in a large industrial region of the Russian Federation. Tikhookeanskiy meditsinskiy zhurnal. 2018; (3): 29–33. https://doi.org/10.17238/PmJ1609-1175.2018.3.29-33 (in Russian)Голубкова А.А., Сомова А.В. Роль Streptococcus pneumoniae в этиологии внебольничных пневмоний в крупном промышленном регионе Российской Федерации. Тихоокеанский медицинский журнал. 2018; (3): 29–33. https://doi.org/10.17238/PmJ1609-1175.2018.3.29-33van Gils E.J., Veenhoven R.H., Hak E., Rodenburg G.D., Keijzers W.C., Bogaert D., et al. Pneumococcal conjugate vaccination and nasopharyngeal acquisition of pneumococcal serotype 19A strains. JAMA. 2010; 304(10): 1099–106. https://doi.org/10.1001/jama.2010.1290Reinert R.R. The antimicrobial resistance profile of Streptococcus pneumoniae. Clin. Microbiol. Infect. 2009; 3: 7–11. https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2009.02724.xReinert R.R., Paradiso P., Fritzell B. Advances in pneumococcal vaccines: The 13-valent pneumococcal conjugate vaccine received market authorization in Europe. Expert Rev. Vaccines. 2010; 9(3): 229–36. https://doi.org/10.1586/erv.10.6Beloshitskiy G.V., Koroleva I.S., Koroleva M.A. Landscape of serotypes Pneumococcus isolate with pneumococcal meningitis in the Russian Federation. Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika. 2015; 14(2): 19–25. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2015-14-2-19-25 (in Russian)Белошицкий Г.В., Королева И.С., Королева М.А. Серотиповой пейзаж пневмококков, выделенных при пневмококковом менингите, в Российской Федерации. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2015; 14(2): 19–25. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2015-14-2-19-25Slotved H.C., Kaltoft M., Skovsted I.C., Kerrn M.B., Espersen F. Simple, rapid latex agglutination test for serotyping of Pneumococci (Pneumotest-Latex). J. Clin. Microbiol. 2004; 42(6): 2518–22. https://doi.org/10.1128/JCM.42.6.2518-2522.2004Slotved H.C., Kaltoft M., Skovsted I.C., Kerrn M.B., Espersen F. Simple, rapid latex agglutination test for serotyping of pneumococci (Pneumotest-Latex). J. Clin. Microbiol. 2004; 42(6): 2518–22. https://doi.org/10.1128/JCM.42.6.2518-2522.2004Nikitina E.V., Tsvetkova I.A., Kalinogorskaya O.S., Gostev V.V., Belanov S.S., Mokhov A.S., et al. Serotype composition of Streptococcus pneumoniae in children with respiratory infections, optimization of molecular assessment methods. Antibiotiki i khimioterapiya. 2021; (11-12): 18–24. https://doi.org/10.37489/0235-2990-2021-66-11-12-18-24 (in Russian)Никитина Е.В., Цветкова И.А., Калиногорская О.С., Гостев В.В., Беланов С.С., Мохов А.С. и др. Серотиповый состав Streptococcus pneumoniae, циркулирующих у детей с респираторными инфекциями, оптимизация молекулярных методов оценки. Антибиотики и химиотерапия. 2021; (11-12): 18–24. https://doi.org/10.37489/0235-2990-2021-66-11-12-18-24Davidson I. A collaborative investigation of phages for typing bovine Staphylococci. Bull. World Health Organ. 1972; 46(1): 81–98.Davidson I. A collaborative investigation of phages for typing bovine staphylococci. Bull. World Health Organ. 1972; 46(1): 81–98.Blair J.E., Williams R.E.O. Phage typing of Staphylococci. Bull. World Health Organ. 1961; 24: 771–84.Blair J.E., Williams R.E.O. Phage typing of staphylococci. Bull. World Health Organ. 1961; 24: 771–84.Vongkamjan K., Switt A.M., den Bakker H.C., Fortes E.D., Wiedmann M. Silage collected from dairy farms harbors an abundance of listeriaphages with considerable host range and genome size diversity. Appl. Environ. Microbiol. 2012; 78(24): 8666–75. https://doi.org/10.1128/AEM.01859-12Gaston M.A. Isolation and selection of a bacteriophage-typing set for Enterobacter cloacae. J. Med. Microbiol. 1987; 24(4): 285–90. https://doi.org/10.1099/00222615-24-4-285Fedotova O.S., Zakharova Yu.A., Ostapchuk A.V., Bazhanova U.A., Zakharov A.A. Phenotypic profile of priority multiresistant Acinetobacter baumannii sequence types (ST 1167, ST 944, ST 208). Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii. 2021; 98(6): 639–47. https://doi.org/10.36233/0372-9311-170 (in Russian)Федотова О.С., Захарова Ю.А., Остапчук А.В., Бажанова У.А., Захаров А.А. Фенотипический профиль актуальных полирезистентных сиквенс-типов (ST 1167, ST 944, ST 208 Acinetobacter baumannii. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021; 98(6): 639–47. https://doi.org/10.36233/0372-9311-170